Predicted mutation
evidence	seq id	position	mutation	annotation	gene	description
RA	W3110S.gb	511,440	T→C	Y192Y (TAT→TAC)	ybaS →	predicted glutaminase

Read alignment evidence...
	seq id	position		ref	new	freq	score (cons/poly)	reads	annotation	genes	product
*	W3110S.gb	511,440	0	T	C	100.0%	146.2 / NA	52	Y192Y (TAT→TAC)	ybaS	predicted glutaminase
Reads supporting (aligned to +/- strand):  ref base T (0/0);  new base C (0/52);  total (0/52)

TTGTGATGCAATGGAAGCCTGTGACGTGTATACCCGTCAGTGCTCCACGCTCCTCAATAC  >  W3110S.gb/511410‑511469                               |                              ttGTGATGCAATGGAAGCCTGTGACGTGTACACCCGTCAGTGCTCCACGCTCATCAATAc  <  1:672689/60‑1 (MQ=255) ttGTGATGCAATGGAAGCCTGTGACGTGTACACCCGTCAGTGCTCCACGCTCATCAATAc  <  1:1015892/60‑1 (MQ=255) ttGTGATGCAATGGAAGCCTGTGACGTGTACACCCGTCAGTGCTCCACGCTCATCAATAc  <  1:279117/60‑1 (MQ=255) ttGTGATGCAATGGAAGCCTGTGACGTGTACACCCGTCAGTGCTCCACGCTCATCAATAc  <  1:338733/60‑1 (MQ=255) ttGTGATGCAATGGAAGCCTGTGACGTGTACACCCGTCAGTGCTCCACGCTCATCAATAc  <  1:379904/60‑1 (MQ=255) ttGTGATGCAATGGAAGCCTGTGACGTGTACACCCGTCAGTGCTCCACGCTCATCAATAc  <  1:386538/60‑1 (MQ=255) ttGTGATGCAATGGAAGCCTGTGACGTGTACACCCGTCAGTGCTCCACGCTCATCAATAc  <  1:418417/60‑1 (MQ=255) ttGTGATGCAATGGAAGCCTGTGACGTGTACACCCGTCAGTGCTCCACGCTCATCAATAc  <  1:418780/60‑1 (MQ=255) ttGTGATGCAATGGAAGCCTGTGACGTGTACACCCGTCAGTGCTCCACGCTCATCAATAc  <  1:442506/60‑1 (MQ=255) ttGTGATGCAATGGAAGCCTGTGACGTGTACACCCGTCAGTGCTCCACGCTCATCAATAc  <  1:469048/60‑1 (MQ=255) ttGTGATGCAATGGAAGCCTGTGACGTGTACACCCGTCAGTGCTCCACGCTCATCAATAc  <  1:498898/60‑1 (MQ=255) ttGTGATGCAATGGAAGCCTGTGACGTGTACACCCGTCAGTGCTCCACGCTCATCAATAc  <  1:562530/60‑1 (MQ=255) ttGTGATGCAATGGAAGCCTGTGACGTGTACACCCGTCAGTGCTCCACGCTCATCAATAc  <  1:628956/60‑1 (MQ=255) ttGTGATGCAATGGAAGCCTGTGACGTGTACACCCGTCAGTGCTCCACGCTCATCAATAc  <  1:25324/60‑1 (MQ=255) ttGTGATGCAATGGAAGCCTGTGACGTGTACACCCGTCAGTGCTCCACGCTCATCAATAc  <  1:683552/60‑1 (MQ=255) ttGTGATGCAATGGAAGCCTGTGACGTGTACACCCGTCAGTGCTCCACGCTCATCAATAc  <  1:692449/60‑1 (MQ=255) ttGTGATGCAATGGAAGCCTGTGACGTGTACACCCGTCAGTGCTCCACGCTCATCAATAc  <  1:744913/60‑1 (MQ=255) ttGTGATGCAATGGAAGCCTGTGACGTGTACACCCGTCAGTGCTCCACGCTCATCAATAc  <  1:763916/60‑1 (MQ=255) ttGTGATGCAATGGAAGCCTGTGACGTGTACACCCGTCAGTGCTCCACGCTCATCAATAc  <  1:771909/60‑1 (MQ=255) ttGTGATGCAATGGAAGCCTGTGACGTGTACACCCGTCAGTGCTCCACGCTCATCAATAc  <  1:776601/60‑1 (MQ=255) ttGTGATGCAATGGAAGCCTGTGACGTGTACACCCGTCAGTGCTCCACGCTCATCAATAc  <  1:88435/60‑1 (MQ=255) ttGTGATGCAATGGAAGCCTGTGACGTGTACACCCGTCAGTGCTCCACGCTCATCAATAc  <  1:897953/60‑1 (MQ=255) ttGTGATGCAATGGAAGCCTGTGACGTGTACACCCGTCAGTGCTCCACGCTCATCAATAc  <  1:953050/60‑1 (MQ=255) ttGTGATGCAATGGAAGCCTGTGACGTGTACACCCGTCAGTGCTCCACGCTCATCAATAc  <  1:965615/60‑1 (MQ=255) ttGTGATGCAATGGAAGCCTGTGACGTGTACACCCGTCAGTGCTCCACGCTCATCAATAc  <  1:983163/60‑1 (MQ=255) ttGTGATGCAATGGAAGCCTGTGACGTGTACACCCGTCAGTGCTCCACGCTCATCAATAc  <  1:1373630/60‑1 (MQ=255) ttGTGATGCAATGGAAGCCTGTGACGTGTACACCCGTCAGTGCTCCACGCTCATCAATAc  <  1:1016384/60‑1 (MQ=255) ttGTGATGCAATGGAAGCCTGTGACGTGTACACCCGTCAGTGCTCCACGCTCATCAATAc  <  1:1075095/60‑1 (MQ=255) ttGTGATGCAATGGAAGCCTGTGACGTGTACACCCGTCAGTGCTCCACGCTCATCAATAc  <  1:1083927/60‑1 (MQ=255) ttGTGATGCAATGGAAGCCTGTGACGTGTACACCCGTCAGTGCTCCACGCTCATCAATAc  <  1:1142334/60‑1 (MQ=255) ttGTGATGCAATGGAAGCCTGTGACGTGTACACCCGTCAGTGCTCCACGCTCATCAATAc  <  1:1153194/60‑1 (MQ=255) ttGTGATGCAATGGAAGCCTGTGACGTGTACACCCGTCAGTGCTCCACGCTCATCAATAc  <  1:1181612/60‑1 (MQ=255) ttGTGATGCAATGGAAGCCTGTGACGTGTACACCCGTCAGTGCTCCACGCTCATCAATAc  <  1:1258697/60‑1 (MQ=255) ttGTGATGCAATGGAAGCCTGTGACGTGTACACCCGTCAGTGCTCCACGCTCATCAATAc  <  1:126814/60‑1 (MQ=255) ttGTGATGCAATGGAAGCCTGTGACGTGTACACCCGTCAGTGCTCCACGCTCATCAATAc  <  1:12843/60‑1 (MQ=255) ttGTGATGCAATGGAAGCCTGTGACGTGTACACCCGTCAGTGCTCCACGCTCATCAATAc  <  1:12906/60‑1 (MQ=255) ttGTGATGCAATGGAAGCCTGTGACGTGTACACCCGTCAGTGCTCCACGCTCATCAATAc  <  1:1295735/60‑1 (MQ=255) ttGTGATGCAATGGAAGCCTGTGACGTGTACACCCGTCAGTGCTCCACGCTCATCAATAc  <  1:1319780/60‑1 (MQ=255) ttGTGATGCAATGGAAGCCTGTGACGTGTACACCCGTCAGTGCTCCACGCTCATCAATAc  <  1:1349329/60‑1 (MQ=255) ttGTGATGCAATGGAAGCCTGTGACGTGTACACCCGTCAGTGCTCCACGCTCATCAATAc  <  1:23518/60‑1 (MQ=255) ttGTGATGCAATGGAAGCCTGTGACGTGTACACCCGTCAGTGCTCCACGCTCATCAATAc  <  1:1380121/60‑1 (MQ=255) ttGTGATGCAATGGAAGCCTGTGACGTGTACACCCGTCAGTGCTCCACGCTCATCAATAc  <  1:138929/60‑1 (MQ=255) ttGTGATGCAATGGAAGCCTGTGACGTGTACACCCGTCAGTGCTCCACGCTCATCAATAc  <  1:1411098/60‑1 (MQ=255) ttGTGATGCAATGGAAGCCTGTGACGTGTACACCCGTCAGTGCTCCACGCTCATCAATAc  <  1:1419230/60‑1 (MQ=255) ttGTGATGCAATGGAAGCCTGTGACGTGTACACCCGTCAGTGCTCCACGCTCATCAATAc  <  1:1452657/60‑1 (MQ=255) ttGTGATGCAATGGAAGCCTGTGACGTGTACACCCGTCAGTGCTCCACGCTCATCAATAc  <  1:1457609/60‑1 (MQ=255) ttGTGATGCAATGGAAGCCTGTGACGTGTACACCCGTCAGTGCTCCACGCTCATCAATAc  <  1:145914/60‑1 (MQ=255) ttGTGATGCAATGGAAGCCTGTGACGTGTACACCCGTCAGTGCTCCACGCTCATCAATAc  <  1:18091/60‑1 (MQ=255) ttGTGATGCAATGGAAGCCTGTGACGTGTACACCCGTCAGTGCTCCACGCTCATCAATAc  <  1:23014/60‑1 (MQ=255) ttGTGATGCAATGGAAGCCTGTGACGTGCACACCCGTCAGTGCTCCACGCTCATCAATAc  <  1:344012/60‑1 (MQ=255)   gtgATGCAATGGAAGCCTGTGACGTGTACACCCGTCAGTGCTCCACGCTCATCAATAc  <  1:331202/58‑1 (MQ=255)                       gACGTGTACACCCGTCAGTGCTCCACGCTCATCAATAc  <  1:198054/38‑1 (MQ=38)                               |                              TTGTGATGCAATGGAAGCCTGTGACGTGTATACCCGTCAGTGCTCCACGCTCCTCAATAC  >  W3110S.gb/511410‑511469

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑