Predicted mutation | ||||||
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evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
RA | W3110S.gb | 1,841,636 | 2 bp→TA | coding (456‑457/1308 nt) | ynjE → | predicted thiosulfate sulfur transferase |
Read alignment evidence... | |||||||||||
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seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | W3110S.gb | 1,841,636 | 0 | C | T | 100.0% | 190.9 / NA | 73 | H152H (CAC→CAT) | ynjE | predicted thiosulfate sulfur transferase |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/0); new base T (0/73); total (0/73) | |||||||||||
* | W3110S.gb | 1,841,637 | 0 | G | A | 100.0% | 188.0 / NA | 73 | D153N (GAC→AAC) | ynjE | predicted thiosulfate sulfur transferase |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/0); new base A (0/73); total (0/73) |
GGTTTATCCGCAATGGCTGCACGACCTGCAACAAGGTAAA > W3110S.gb/1841615‑1841654 || ggTATATCCGCAGTGTCTGCATAACCTGCAACAAGGTaaa < 1:256210/40‑1 (MQ=19) ggTATATCCGCAGTGGCTTCATAACCTGCAACAAGGTaaa < 1:174624/40‑1 (MQ=19) ggTATATCCGCAGTGGCTGCATAACCTGCAACAAGGTaaa < 1:549475/40‑1 (MQ=25) ggTATATCCGCAGTGGCTGCATAACCTGCAACAAGGTaaa < 1:55799/40‑1 (MQ=25) ggTATATCCGCAGTGGCTGCATAACCTGCAACAAGGTaaa < 1:547887/40‑1 (MQ=25) ggTATATCCGCAGTGGCTGCATAACCTGCAACAAGGTaaa < 1:545248/40‑1 (MQ=25) ggTATATCCGCAGTGGCTGCATAACCTGCAACAAGGTaaa < 1:485954/40‑1 (MQ=25) ggTATATCCGCAGTGGCTGCATAACCTGCAACAAGGTaaa < 1:476919/40‑1 (MQ=25) ggTATATCCGCAGTGGCTGCATAACCTGCAACAAGGTaaa < 1:463980/40‑1 (MQ=25) ggTATATCCGCAGTGGCTGCATAACCTGCAACAAGGTaaa < 1:398725/40‑1 (MQ=25) ggTATATCCGCAGTGGCTGCATAACCTGCAACAAGGTaaa < 1:396125/40‑1 (MQ=25) ggTATATCCGCAGTGGCTGCATAACCTGCAACAAGGTaaa < 1:3598/40‑1 (MQ=25) ggTATATCCGCAGTGGCTGCATAACCTGCAACAAGGTaaa < 1:34477/40‑1 (MQ=25) ggTATATCCGCAGTGGCTGCATAACCTGCAACAAGGTaaa < 1:342735/40‑1 (MQ=25) ggTATATCCGCAGTGGCTGCATAACCTGCAACAAGGTaaa < 1:318917/40‑1 (MQ=25) ggTATATCCGCAGTGGCTGCATAACCTGCAACAAGGTaaa < 1:281426/40‑1 (MQ=25) ggTATATCCGCAGTGGCTGCATAACCTGCAACAAGGTaaa < 1:268727/40‑1 (MQ=25) ggTATATCCGCAGTGGCTGCATAACCTGCAACAAGGTaaa < 1:266143/40‑1 (MQ=25) ggTATATCCGCAGTGGCTGCATAACCTGCAACAAGGTaaa < 1:261251/40‑1 (MQ=25) ggTATATCCGCAGTGGCTGCATAACCTGCAACAAGGTaaa < 1:792337/40‑1 (MQ=25) ggTATATCCGCAGTGGCTGCATAACCTGCAACAAGGTaaa < 1:992827/40‑1 (MQ=25) ggTATATCCGCAGTGGCTGCATAACCTGCAACAAGGTaaa < 1:986415/40‑1 (MQ=25) ggTATATCCGCAGTGGCTGCATAACCTGCAACAAGGTaaa < 1:902602/40‑1 (MQ=25) ggTATATCCGCAGTGGCTGCATAACCTGCAACAAGGTaaa < 1:902530/40‑1 (MQ=25) ggTATATCCGCAGTGGCTGCATAACCTGCAACAAGGTaaa < 1:872586/40‑1 (MQ=25) ggTATATCCGCAGTGGCTGCATAACCTGCAACAAGGTaaa < 1:864532/40‑1 (MQ=25) ggTATATCCGCAGTGGCTGCATAACCTGCAACAAGGTaaa < 1:836565/40‑1 (MQ=25) ggTATATCCGCAGTGGCTGCATAACCTGCAACAAGGTaaa < 1:814670/40‑1 (MQ=25) ggTATATCCGCAGTGGCTGCATAACCTGCAACAAGGTaaa < 1:244690/40‑1 (MQ=25) ggTATATCCGCAGTGGCTGCATAACCTGCAACAAGGTaaa < 1:762680/40‑1 (MQ=25) ggTATATCCGCAGTGGCTGCATAACCTGCAACAAGGTaaa < 1:742594/40‑1 (MQ=25) ggTATATCCGCAGTGGCTGCATAACCTGCAACAAGGTaaa < 1:692538/40‑1 (MQ=25) ggTATATCCGCAGTGGCTGCATAACCTGCAACAAGGTaaa < 1:686585/40‑1 (MQ=25) ggTATATCCGCAGTGGCTGCATAACCTGCAACAAGGTaaa < 1:681288/40‑1 (MQ=25) ggTATATCCGCAGTGGCTGCATAACCTGCAACAAGGTaaa < 1:648310/40‑1 (MQ=25) ggTATATCCGCAGTGGCTGCATAACCTGCAACAAGGTaaa < 1:633003/40‑1 (MQ=25) ggTATATCCGCAGTGGCTGCATAACCTGCAACAAGGTaaa < 1:620632/40‑1 (MQ=25) ggTATATCCGCAGTGGCTGCATAACCTGCAACAAGGTaaa < 1:1216483/40‑1 (MQ=25) ggTATATCCGCAGTGGCTGCATAACCTGCAACAAGGTaaa < 1:1028361/40‑1 (MQ=25) ggTATATCCGCAGTGGCTGCATAACCTGCAACAAGGTaaa < 1:1397454/40‑1 (MQ=25) ggTATATCCGCAGTGGCTGCATAACCTGCAACAAGGTaaa < 1:1389581/40‑1 (MQ=25) ggTATATCCGCAGTGGCTGCATAACCTGCAACAAGGTaaa < 1:1386465/40‑1 (MQ=25) ggTATATCCGCAGTGGCTGCATAACCTGCAACAAGGTaaa < 1:1379151/40‑1 (MQ=25) ggTATATCCGCAGTGGCTGCATAACCTGCAACAAGGTaaa < 1:133040/40‑1 (MQ=25) ggTATATCCGCAGTGGCTGCATAACCTGCAACAAGGTaaa < 1:1293244/40‑1 (MQ=25) ggTATATCCGCAGTGGCTGCATAACCTGCAACAAGGTaaa < 1:1290462/40‑1 (MQ=25) ggTATATCCGCAGTGGCTGCATAACCTGCAACAAGGTaaa < 1:1419222/40‑1 (MQ=25) ggTATATCCGCAGTGGCTGCATAACCTGCAACAAGGTaaa < 1:1213684/40‑1 (MQ=25) ggTATATCCGCAGTGGCTGCATAACCTGCAACAAGGTaaa < 1:1192346/40‑1 (MQ=25) ggTATATCCGCAGTGGCTGCATAACCTGCAACAAGGTaaa < 1:1155628/40‑1 (MQ=25) ggTATATCCGCAGTGGCTGCATAACCTGCAACAAGGTaaa < 1:1131817/40‑1 (MQ=25) ggTATATCCGCAGTGGCTGCATAACCTGCAACAAGGTaaa < 1:1125440/40‑1 (MQ=25) ggTATATCCGCAGTGGCTGCATAACCTGCAACAAGGTaaa < 1:1082798/40‑1 (MQ=25) ggTATATCCGCAGTGGCTGCATAACCTGCAACAAGGTaaa < 1:1080745/40‑1 (MQ=25) ggTATATCCGCAGTGGCTGCATAACCTGCAACAAGGTaaa < 1:1032931/40‑1 (MQ=25) ggTATATCCGCAGTGGCTGCATAACCTGCAACAAGGTaaa < 1:20006/40‑1 (MQ=25) ggTATATCCGCAGTGGCTGCATAACCTGCAACAAGGTaaa < 1:244102/40‑1 (MQ=25) ggTATATCCGCAGTGGCTGCATAACCTGCAACAAGGTaaa < 1:243585/40‑1 (MQ=25) ggTATATCCGCAGTGGCTGCATAACCTGCAACAAGGTaaa < 1:234023/40‑1 (MQ=25) ggTATATCCGCAGTGGCTGCATAACCTGCAACAAGGTaaa < 1:230971/40‑1 (MQ=25) ggTATATCCGCAGTGGCTGCATAACCTGCAACAAGGTaaa < 1:230330/40‑1 (MQ=25) ggTATATCCGCAGTGGCTGCATAACCTGCAACAAGGTaaa < 1:22117/40‑1 (MQ=25) ggTATATCCGCAGTGGCTGCATAACCTGCAACAAGGTaaa < 1:21129/40‑1 (MQ=25) ggTATATCCGCAGTGGCTGCATAACCTGCAACAAGGTaaa < 1:1419735/40‑1 (MQ=25) ggTATATCCGCAGTGGCTGCATAACCTGCAACAAGGTaaa < 1:196269/40‑1 (MQ=25) ggTATATCCGCAGTGGCTGCATAACCTGCAACAAGGTaaa < 1:180899/40‑1 (MQ=25) ggTATATCCGCAGTGGCTGCATAACCTGCAACAAGGTaaa < 1:170935/40‑1 (MQ=25) ggTATATCCGCAGTGGCTGCATAACCTGCAACAAGGTaaa < 1:157627/40‑1 (MQ=25) ggTATATCCGCAGTGGCTGCATAACCTGCAACAAGGTaaa < 1:15658/40‑1 (MQ=25) ggTATATCCGCAGTGGCTGCATAACCTGCAACAAGGTaaa < 1:150099/40‑1 (MQ=25) ggTATATCCGCAGTGGCTGCATAACCTGCAACAAGGTaaa < 1:1426299/40‑1 (MQ=25) ggTATATCCGCAGTGGCTGCATAACCTGCAACAAGGTaaa < 1:1423071/40‑1 (MQ=25) atATCCGCAGTGGCTGCATAACCTGCAACAAGGTaaa < 1:86445/36‑1 (MQ=25) || GGTTTATCCGCAATGGCTGCACGACCTGCAACAAGGTAAA > W3110S.gb/1841615‑1841654 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |