Predicted mutation
evidence	seq id	position	mutation	annotation	gene	description
RA	W3110S.gb	2,310,698	2 bp→GC	coding (1251‑1252/1644 nt)	yojI ←	fused predicted multidrug transport subunits and membrane component and ATP‑binding component of ABC superfamily

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	seq id	position		ref	new	freq	score (cons/poly)	reads	annotation	genes	product
*	W3110S.gb	2,310,698	0	T	G	100.0%	211.0 / NA	74	K418Q (AAA→CAA)	yojI	fused predicted multidrug transport subunits and membrane component and ATP‑binding component of ABC superfamily
Reads supporting (aligned to +/- strand):  ref base T (0/0);  new base G (74/0);  total (74/0)
*	W3110S.gb	2,310,699	0	A	C	98.7%	204.4 / ‑6.2	74	G417G (GGT→GGG)	yojI	fused predicted multidrug transport subunits and membrane component and ATP‑binding component of ABC superfamily
Reads supporting (aligned to +/- strand):  ref base A (1/0);  new base C (73/0);  total (74/0)
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.99e-01

CGGGTTAGCGGGTTTACCCTCCGGCCCCAGCAGTTGATCAAACAGCCAGACATCGGTAAACA  >  W3110S.gb/2310684‑2310745               ||                                               cGGGTTAGCGGGTTGCCCCTCCGGCCCCCGCAGTTGATCAAACAGCCAGACATCGGTAAaca  >  1:1138814/1‑62 (MQ=38) cGGGTTAGCGGGTTGCCCCTCCGGCCCCAGCAGTTg                            >  1:321653/1‑36 (MQ=37) cGGGTTAGCGGGTTGCCCCTCCGGCCCCAGCAGTTGATCAAACAGCCAGa              >  1:597850/1‑50 (MQ=39) cGGGTTAGCGGGTTGCCCCTCCGGCCCCAGCAGTTGATCAAACAGCCAGAc             >  1:154681/1‑51 (MQ=39) cGGGTTAGCGGGTTGCCCCTCCGGCCCCAGCAGTTGATCAAACAGCCAGACATCgg        >  1:770010/1‑56 (MQ=255) cGGGTTAGCGGGTTGCCCCTCCGGCCCCAGCAGTTGATCAAACAGCCAGACATCGGTaaa    >  1:586980/1‑60 (MQ=255) cGGGTTAGCGGGTTGCCCCTCCGGCCCCAGCAGTTGATCAAACAGCCAGACATCGGTAAaca  >  1:392429/1‑62 (MQ=255) cGGGTTAGCGGGTTGCCCCTCCGGCCCCAGCAGTTGATCAAACAGCCAGACATCGGTAAaca  >  1:562399/1‑62 (MQ=255) cGGGTTAGCGGGTTGCCCCTCCGGCCCCAGCAGTTGATCAAACAGCCAGACATCGGTAAaca  >  1:503365/1‑62 (MQ=255) cGGGTTAGCGGGTTGCCCCTCCGGCCCCAGCAGTTGATCAAACAGCCAGACATCGGTAAaca  >  1:472572/1‑62 (MQ=255) cGGGTTAGCGGGTTGCCCCTCCGGCCCCAGCAGTTGATCAAACAGCCAGACATCGGTAAaca  >  1:460792/1‑62 (MQ=255) cGGGTTAGCGGGTTGCCCCTCCGGCCCCAGCAGTTGATCAAACAGCCAGACATCGGTAAaca  >  1:453875/1‑62 (MQ=255) cGGGTTAGCGGGTTGCCCCTCCGGCCCCAGCAGTTGATCAAACAGCCAGACATCGGTAAaca  >  1:433077/1‑62 (MQ=255) cGGGTTAGCGGGTTGCCCCTCCGGCCCCAGCAGTTGATCAAACAGCCAGACATCGGTAAaca  >  1:404466/1‑62 (MQ=255) cGGGTTAGCGGGTTGCCCCTCCGGCCCCAGCAGTTGATCAAACAGCCAGACATCGGTAAaca  >  1:394691/1‑62 (MQ=255) cGGGTTAGCGGGTTGCCCCTCCGGCCCCAGCAGTTGATCAAACAGCCAGACATCGGTAAaca  >  1:1010725/1‑62 (MQ=255) cGGGTTAGCGGGTTGCCCCTCCGGCCCCAGCAGTTGATCAAACAGCCAGACATCGGTAAaca  >  1:341043/1‑62 (MQ=255) cGGGTTAGCGGGTTGCCCCTCCGGCCCCAGCAGTTGATCAAACAGCCAGACATCGGTAAaca  >  1:320621/1‑62 (MQ=255) cGGGTTAGCGGGTTGCCCCTCCGGCCCCAGCAGTTGATCAAACAGCCAGACATCGGTAAaca  >  1:256343/1‑62 (MQ=255) cGGGTTAGCGGGTTGCCCCTCCGGCCCCAGCAGTTGATCAAACAGCCAGACATCGGTAAaca  >  1:252501/1‑62 (MQ=255) 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cGGGTTAGCGGGTTGCCCCTCCGGCCCCAGCAGTTGATCAAACAGCCAGACATCGGTAAaca  >  1:1030838/1‑62 (MQ=255) cGGGTTAGCGGGTTGCCCCTCCGGCCCCAGCAGTTGATCAAACAGCCAGACATCGGTAAaca  >  1:1235536/1‑62 (MQ=255) cGGGTTAGCGGGTTGCCCCTCCGGCCCCAGCAGTTGATCAAACAGCCAGACATCGGTAAaca  >  1:180234/1‑62 (MQ=255) cGGGTTAGCGGGTTGCCCCTCCGGCCCCAGCAGTTGATCAAACAGCCAGACATCGGTAAaca  >  1:15639/1‑62 (MQ=255) cGGGTTAGCGGGTTGCCCCTCCGGCCCCAGCAGTTGATCAAACAGCCAGACATCGGTAAaca  >  1:1468894/1‑62 (MQ=255) cGGGTTAGCGGGTTGCCCCTCCGGCCCCAGCAGTTGATCAAACAGCCAGACATCGGTAAaca  >  1:1467169/1‑62 (MQ=255) cGGGTTAGCGGGTTGCCCCTCCGGCCCCAGCAGTTGATCAAACAGCCAGACATCGGTAAaca  >  1:145684/1‑62 (MQ=255) cGGGTTAGCGGGTTGCCCCTCCGGCCCCAGCAGTTGATCAAACAGCCAGACATCGGTAAaca  >  1:1417460/1‑62 (MQ=255) cGGGTTAGCGGGTTGCCCCTCCGGCCCCAGCAGTTGATCAAACAGCCAGACATCGGTAAaca  >  1:1394227/1‑62 (MQ=255) cGGGTTAGCGGGTTGCCCCTCCGGCCCCAGCAGTTGATCAAACAGCCAGACATCGGTAAaca  >  1:1382835/1‑62 (MQ=255) cGGGTTAGCGGGTTGCCCCTCCGGCCCCAGCAGTTGATCAAACAGCCAGACATCGGTAAaca  >  1:1344115/1‑62 (MQ=255) cGGGTTAGCGGGTTGCCCCTCCGGCCCCAGCAGTTGATCAAACAGCCAGACATCGGTAAaca  >  1:133045/1‑62 (MQ=255) cGGGTTAGCGGGTTGCCCCTCCGGCCCCAGCAGTTGATCAAACAGCCAGACATCGGTAAaca  >  1:1308352/1‑62 (MQ=255) cGGGTTAGCGGGTTGCCCCTCCGGCCCCAGCAGTTGATCAAACAGCCAGACATCGGTAAaca  >  1:124284/1‑62 (MQ=255) cGGGTTAGCGGGTTGCCCCTCCGGCCCCAGCAGTTGATCAAACAGCCAGACATCGGTAAac   >  1:1163749/1‑61 (MQ=255) cGGGTTAGCGGGTTGCCCCTCCGGCCCCAGCAGTTGATCAAACAGCCAGACATCGGTAAac   >  1:1446857/1‑61 (MQ=255) cGGGTTAGCGGGTTGCCCCTCCGGCCCCAGCAGTTGATCAAACAGCCAGACATCGGTAAac   >  1:288851/1‑61 (MQ=255) cGGGTTAGCGGGTTGCCCCTCCGGCCCCAGCAGTT‑ATCAAACAGCCAGACATCGGTAAaca  >  1:476844/1‑61 (MQ=255) cGGGTTAGCGGGTTGCCCCACCGGCCCCAGCAGTTGATCAAACAGCCAGACATCGGTAAaca  >  1:1140073/1‑62 (MQ=255) cGGGTTAGCGGGTTGACCCTCCGGCCCCAGCAGTTGATCaa                       >  1:1221428/1‑41 (MQ=255) cGGGTTAGCGGGTCGCCCCTCCGGCCCCAGCAGTTGATCAAACAGCCAGACATCGGTAAaca  >  1:610118/1‑62 (MQ=255)               ||                                               CGGGTTAGCGGGTTTACCCTCCGGCCCCAGCAGTTGATCAAACAGCCAGACATCGGTAAACA  >  W3110S.gb/2310684‑2310745

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑