Predicted mutation
evidence	seq id	position	mutation	annotation	gene	description
RA	W3110S.gb	232,180	2 bp→CC	coding (255‑256/624 nt)	yafE →	predicted S‑adenosyl‑L‑methionine‑dependent methyltransferase

Read alignment evidence...
	seq id	position		ref	new	freq	score (cons/poly)	reads	annotation	genes	product
*	W3110S.gb	232,180	0	T	C	100.0%	142.4 / NA	51	N85N (AAT→AAC)	yafE	predicted S‑adenosyl‑L‑methionine‑dependent methyltransferase
Reads supporting (aligned to +/- strand):  ref base T (0/0);  new base C (51/0);  total (51/0)
*	W3110S.gb	232,181	0	A	C	100.0%	142.8 / NA	51	R86R (AGG→CGG)	yafE	predicted S‑adenosyl‑L‑methionine‑dependent methyltransferase
Reads supporting (aligned to +/- strand):  ref base A (0/0);  new base C (51/0);  total (51/0)

TGATGTTGGTGCAGCACTGCGAGAAGTGAATAGGATATTGAAACCTGGCGGTAGGCTGATT  >  W3110S.gb/232150‑232210                               ||                              tgatgTTGTTGAATCACTGAGTGAATTGAACCGGATATTGAAACTTGTCGGTAAGCTGAtt  >  1:502923/1‑61 (MQ=255) tgatgTTGGTGCCGCACTGCGTGAAGTGAACCGGATATTGAAACTTGGCGGt           >  1:651913/1‑52 (MQ=255) tgatgTTGGTGCAGCACTGCGTGAAGTGAACCGGATATTGaaa                    >  1:419607/1‑43 (MQ=37) tgatgTTGGTGCAGCACTGCGTGAAGTGAACCGGATATTGaa                     >  1:975185/1‑42 (MQ=37) tgatgTTGGTGCAGCACTGCGTGAAGTGAACCGGATATTGAAACTTGGCGGt           >  1:1010662/1‑52 (MQ=255) tgatgTTGGTGCAGCACTGCGTGAAGTGAACCGGATATTGAAACTTGGCGGTAAGCTGAtt  >  1:631743/1‑61 (MQ=255) tgatgTTGGTGCAGCACTGCGTGAAGTGAACCGGATATTGAAACTTGGCGGTAAGCTGAtt  >  1:340242/1‑61 (MQ=255) tgatgTTGGTGCAGCACTGCGTGAAGTGAACCGGATATTGAAACTTGGCGGTAAGCTGAtt  >  1:398500/1‑61 (MQ=255) tgatgTTGGTGCAGCACTGCGTGAAGTGAACCGGATATTGAAACTTGGCGGTAAGCTGAtt  >  1:43162/1‑61 (MQ=255) tgatgTTGGTGCAGCACTGCGTGAAGTGAACCGGATATTGAAACTTGGCGGTAAGCTGAtt  >  1:459579/1‑61 (MQ=255) tgatgTTGGTGCAGCACTGCGTGAAGTGAACCGGATATTGAAACTTGGCGGTAAGCTGAtt  >  1:460352/1‑61 (MQ=255) tgatgTTGGTGCAGCACTGCGTGAAGTGAACCGGATATTGAAACTTGGCGGTAAGCTGAtt  >  1:516391/1‑61 (MQ=255) tgatgTTGGTGCAGCACTGCGTGAAGTGAACCGGATATTGAAACTTGGCGGTAAGCTGAtt  >  1:557482/1‑61 (MQ=255) tgatgTTGGTGCAGCACTGCGTGAAGTGAACCGGATATTGAAACTTGGCGGTAAGCTGAtt  >  1:596803/1‑61 (MQ=255) tgatgTTGGTGCAGCACTGCGTGAAGTGAACCGGATATTGAAACTTGGCGGTAAGCTGAtt  >  1:602795/1‑61 (MQ=255) tgatgTTGGTGCAGCACTGCGTGAAGTGAACCGGATATTGAAACTTGGCGGTAAGCTGAtt  >  1:334223/1‑61 (MQ=255) tgatgTTGGTGCAGCACTGCGTGAAGTGAACCGGATATTGAAACTTGGCGGTAAGCTGAtt  >  1:636260/1‑61 (MQ=255) tgatgTTGGTGCAGCACTGCGTGAAGTGAACCGGATATTGAAACTTGGCGGTAAGCTGAtt  >  1:663701/1‑61 (MQ=255) tgatgTTGGTGCAGCACTGCGTGAAGTGAACCGGATATTGAAACTTGGCGGTAAGCTGAtt  >  1:763174/1‑61 (MQ=255) tgatgTTGGTGCAGCACTGCGTGAAGTGAACCGGATATTGAAACTTGGCGGTAAGCTGAtt  >  1:798658/1‑61 (MQ=255) tgatgTTGGTGCAGCACTGCGTGAAGTGAACCGGATATTGAAACTTGGCGGTAAGCTGAtt  >  1:8184/1‑61 (MQ=255) tgatgTTGGTGCAGCACTGCGTGAAGTGAACCGGATATTGAAACTTGGCGGTAAGCTGAtt  >  1:849535/1‑61 (MQ=255) tgatgTTGGTGCAGCACTGCGTGAAGTGAACCGGATATTGAAACTTGGCGGTAAGCTGAtt  >  1:850405/1‑61 (MQ=255) tgatgTTGGTGCAGCACTGCGTGAAGTGAACCGGATATTGAAACTTGGCGGTAAGCTGAtt  >  1:952570/1‑61 (MQ=255) tgatgTTGGTGCAGCACTGCGTGAAGTGAACCGGATATTGAAACTTGGCGGTAAGCTGAtt  >  1:979588/1‑61 (MQ=255) tgatgTTGGTGCAGCACTGCGTGAAGTGAACCGGATATTGAAACTTGGCGGTAAGCTGAtt  >  1:99297/1‑61 (MQ=255) tgatgTTGGTGCAGCACTGCGTGAAGTGAACCGGATATTGAAACTTGGCGGTAAGCTGAtt  >  1:1352582/1‑61 (MQ=255) tgatgTTGGTGCAGCACTGCGTGAAGTGAACCGGATATTGAAACTTGGCGGTAAGCTGAtt  >  1:1036264/1‑61 (MQ=255) tgatgTTGGTGCAGCACTGCGTGAAGTGAACCGGATATTGAAACTTGGCGGTAAGCTGAtt  >  1:1037004/1‑61 (MQ=255) tgatgTTGGTGCAGCACTGCGTGAAGTGAACCGGATATTGAAACTTGGCGGTAAGCTGAtt  >  1:1038032/1‑61 (MQ=255) tgatgTTGGTGCAGCACTGCGTGAAGTGAACCGGATATTGAAACTTGGCGGTAAGCTGAtt  >  1:1044329/1‑61 (MQ=255) tgatgTTGGTGCAGCACTGCGTGAAGTGAACCGGATATTGAAACTTGGCGGTAAGCTGAtt  >  1:1047172/1‑61 (MQ=255) tgatgTTGGTGCAGCACTGCGTGAAGTGAACCGGATATTGAAACTTGGCGGTAAGCTGAtt  >  1:1089307/1‑61 (MQ=255) tgatgTTGGTGCAGCACTGCGTGAAGTGAACCGGATATTGAAACTTGGCGGTAAGCTGAtt  >  1:1101014/1‑61 (MQ=255) tgatgTTGGTGCAGCACTGCGTGAAGTGAACCGGATATTGAAACTTGGCGGTAAGCTGAtt  >  1:114271/1‑61 (MQ=255) tgatgTTGGTGCAGCACTGCGTGAAGTGAACCGGATATTGAAACTTGGCGGTAAGCTGAtt  >  1:1158642/1‑61 (MQ=255) tgatgTTGGTGCAGCACTGCGTGAAGTGAACCGGATATTGAAACTTGGCGGTAAGCTGAtt  >  1:1203166/1‑61 (MQ=255) tgatgTTGGTGCAGCACTGCGTGAAGTGAACCGGATATTGAAACTTGGCGGTAAGCTGAtt  >  1:1245322/1‑61 (MQ=255) tgatgTTGGTGCAGCACTGCGTGAAGTGAACCGGATATTGAAACTTGGCGGTAAGCTGAtt  >  1:1349052/1‑61 (MQ=255) tgatgTTGGTGCAGCACTGCGTGAAGTGAACCGGATATTGAAACTTGGCGGTAAGCTGAtt  >  1:322546/1‑61 (MQ=255) tgatgTTGGTGCAGCACTGCGTGAAGTGAACCGGATATTGAAACTTGGCGGTAAGCTGAtt  >  1:1369651/1‑61 (MQ=255) tgatgTTGGTGCAGCACTGCGTGAAGTGAACCGGATATTGAAACTTGGCGGTAAGCTGAtt  >  1:1384857/1‑61 (MQ=255) tgatgTTGGTGCAGCACTGCGTGAAGTGAACCGGATATTGAAACTTGGCGGTAAGCTGAtt  >  1:139028/1‑61 (MQ=255) tgatgTTGGTGCAGCACTGCGTGAAGTGAACCGGATATTGAAACTTGGCGGTAAGCTGAtt  >  1:1431495/1‑61 (MQ=255) tgatgTTGGTGCAGCACTGCGTGAAGTGAACCGGATATTGAAACTTGGCGGTAAGCTGAtt  >  1:1444747/1‑61 (MQ=255) tgatgTTGGTGCAGCACTGCGTGAAGTGAACCGGATATTGAAACTTGGCGGTAAGCTGAtt  >  1:1445706/1‑61 (MQ=255) tgatgTTGGTGCAGCACTGCGTGAAGTGAACCGGATATTGAAACTTGGCGGTAAGCTGAtt  >  1:1465895/1‑61 (MQ=255) tgatgTTGGTGCAGCACTGCGTGAAGTGAACCGGATATTGAAACTTGGCGGTAAGCTGAtt  >  1:273730/1‑61 (MQ=255) tgatgTTGGTGCAGCACTGCGTGAAGTGAACCGGATATTGAAACTTGGCGGTAAGCTGAtt  >  1:284226/1‑61 (MQ=255) tgatgTTGGTGCAGCACTGCGTGAAGTGAACCGGATATTGAAACTTGGCGGTAAGCTGAt   >  1:246510/1‑60 (MQ=255) tgatgTTGGTGCAGCACTGCGTGAAGTGAACCGGATATTGAAACTTGGCGGTAAGCTGAt   >  1:380839/1‑60 (MQ=255)                               ||                              TGATGTTGGTGCAGCACTGCGAGAAGTGAATAGGATATTGAAACCTGGCGGTAGGCTGATT  >  W3110S.gb/232150‑232210

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑