Predicted mutation
evidence seq id position mutation annotation gene description
RA W3110S.gb 3,244,515 3 bp→TGA coding (756‑758/1419 nt) exuT → hexuronate transporter

Read alignment evidence...
  seq id position ref new freq score (cons/poly) reads annotation genes product
*W3110S.gb3,244,5150GT100.0% 137.5 / NA 66V252V (GTG→GTTexuThexuronate transporter
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*W3110S.gb3,244,5160AG100.0% 138.2 / NA 66S253D (AGC→GAC) exuThexuronate transporter
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*W3110S.gb3,244,5170GA100.0% 137.1 / NA 66S253D (AGC→GAC) exuThexuronate transporter
Reads supporting (aligned to +/- strand):  ref base G (0/0);  new base A (0/66);  total (0/66)

ACCAGGTGAGCACGGCGAAGAAAATGTCCGTTGGTC  >  W3110S.gb/3244508‑3244543
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ACCAGGTGAGCACGGCGAAGAAAATGTCCGTTGGTC  >  W3110S.gb/3244508‑3244543

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap:     Deleted base: