Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	772536	772537	2	11 [0]	[0] 16	cydA	cytochrome d terminal oxidase, subunit I

AGCGCATGGTATATGCTGAAAGGTCGTGACTTCGCCTTCGCTAAACGCTC  >  W3110S.gb/772486‑772535                                                  | aGCGCATGGTATATGCTGAAAGGTCGTGACTTCGCCTTCGCTAAACGCTc  <  1:1375459/50‑1 (MQ=255) aGCGCATGGTATATGCTGAAAGGTCGTGACTTCGCCTTCGCTAAACGCTc  <  1:1601201/50‑1 (MQ=255) aGCGCATGGTATATGCTGAAAGGTCGTGACTTCGCCTTCGCTAAACGCTc  <  1:1812849/50‑1 (MQ=255) aGCGCATGGTATATGCTGAAAGGTCGTGACTTCGCCTTCGCTAAACGCTc  <  1:2020873/50‑1 (MQ=255) aGCGCATGGTATATGCTGAAAGGTCGTGACTTCGCCTTCGCTAAACGCTc  <  1:210757/50‑1 (MQ=255) aGCGCATGGTATATGCTGAAAGGTCGTGACTTCGCCTTCGCTAAACGCTc  <  1:2232821/50‑1 (MQ=255) aGCGCATGGTATATGCTGAAAGGTCGTGACTTCGCCTTCGCTAAACGCTc  <  1:2236393/50‑1 (MQ=255) aGCGCATGGTATATGCTGAAAGGTCGTGACTTCGCCTTCGCTAAACGCTc  <  1:2608084/50‑1 (MQ=255) aGCGCATGGTATATGCTGAAAGGTCGTGACTTCGCCTTCGCTAAACGCTc  <  1:2838100/50‑1 (MQ=255) aGCGCATGGTATATGCTGAAAGGTCGTGACTTCGCCTTCGCTAAACGCTc  <  1:984747/50‑1 (MQ=255) aGCGCATGGTACATGCTGAAAGGTCGTGACTTCGCCTTCGCTAAACGCTc  <  1:465203/50‑1 (MQ=255)                                                  | AGCGCATGGTATATGCTGAAAGGTCGTGACTTCGCCTTCGCTAAACGCTC  >  W3110S.gb/772486‑772535

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑