Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	1465589	1465590	2	20 [0]	[0] 5	paaX	DNA‑binding transcriptional regulator, aryl‑CoA responsive

TTTATCGCGCAGAGCAACCTGCATGGGATGGTAAATGGCTCCTG  >  W3110S.gb/1465545‑1465588                                            | tttATCGCGCAGAGCAACCTGCATGGGATGGTAAATGGCTCCTg  <  1:2722011/44‑1 (MQ=255) tttATCGCGCAGAGCAACCTGCATGGGATGGTAAATGGCTCCTg  <  1:999965/44‑1 (MQ=255) tttATCGCGCAGAGCAACCTGCATGGGATGGTAAATGGCTCCTg  <  1:956133/44‑1 (MQ=255) tttATCGCGCAGAGCAACCTGCATGGGATGGTAAATGGCTCCTg  <  1:827360/44‑1 (MQ=255) tttATCGCGCAGAGCAACCTGCATGGGATGGTAAATGGCTCCTg  <  1:818924/44‑1 (MQ=255) tttATCGCGCAGAGCAACCTGCATGGGATGGTAAATGGCTCCTg  <  1:370918/44‑1 (MQ=255) tttATCGCGCAGAGCAACCTGCATGGGATGGTAAATGGCTCCTg  <  1:3076262/44‑1 (MQ=255) tttATCGCGCAGAGCAACCTGCATGGGATGGTAAATGGCTCCTg  <  1:294584/44‑1 (MQ=255) tttATCGCGCAGAGCAACCTGCATGGGATGGTAAATGGCTCCTg  <  1:2767306/44‑1 (MQ=255) tttATCGCGCAGAGCAACCTGCATGGGATGGTAAATGGCTCCTg  <  1:2732036/44‑1 (MQ=255) tttATCGCGCAGAGCAACCTGCATGGGATGGTAAATGGCTCCTg  <  1:1177422/44‑1 (MQ=255) tttATCGCGCAGAGCAACCTGCATGGGATGGTAAATGGCTCCTg  <  1:2651827/44‑1 (MQ=255) tttATCGCGCAGAGCAACCTGCATGGGATGGTAAATGGCTCCTg  <  1:2205448/44‑1 (MQ=255) tttATCGCGCAGAGCAACCTGCATGGGATGGTAAATGGCTCCTg  <  1:204663/44‑1 (MQ=255) tttATCGCGCAGAGCAACCTGCATGGGATGGTAAATGGCTCCTg  <  1:1799500/44‑1 (MQ=255) tttATCGCGCAGAGCAACCTGCATGGGATGGTAAATGGCTCCTg  <  1:1795772/44‑1 (MQ=255) tttATCGCGCAGAGCAACCTGCATGGGATGGTAAATGGCTCCTg  <  1:1515481/44‑1 (MQ=255) tttATCGCGCAGAGCAACCTGCATGGGATGGTAAATGGCTCCTg  <  1:1481818/44‑1 (MQ=255) tttATCGCGCAGAGCAACCTGCATGGGATGGTAAATGGCTCCTg  <  1:1264049/44‑1 (MQ=255) tttATCGCGCAGAGCAACCTGCATGGGATGGTAAATGGCTCCTg  <  1:1178106/44‑1 (MQ=255)                                            | TTTATCGCGCAGAGCAACCTGCATGGGATGGTAAATGGCTCCTG  >  W3110S.gb/1465545‑1465588

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑