Missing coverage evidence...
   seq id start end size ←reads reads→ gene description
* * ÷ W3110S.gb 1976895 1976943 49 13 [0] [0] 8 cheA fused chemotactic sensory histidine kinase (soluble) in two‑component regulatory system with CheB and CheY

AAACGCTGAAGCCAAAAGTTCCTGCCCCTCCTTTGATCGA  >  W3110S.gb/1976855‑1976894
                                       |
aaaCGCTGAAGCCAAAAGTTCCTGCCCCTCCTTTGATCGa  >  1:1088411/1‑40 (MQ=255)
aaaCGCTGAAGCCAAAAGTTCCTGCCCCTCCTTTGATCGa  >  1:1137810/1‑40 (MQ=255)
aaaCGCTGAAGCCAAAAGTTCCTGCCCCTCCTTTGATCGa  >  1:1204073/1‑40 (MQ=255)
aaaCGCTGAAGCCAAAAGTTCCTGCCCCTCCTTTGATCGa  >  1:1477620/1‑40 (MQ=255)
aaaCGCTGAAGCCAAAAGTTCCTGCCCCTCCTTTGATCGa  >  1:1918315/1‑40 (MQ=255)
aaaCGCTGAAGCCAAAAGTTCCTGCCCCTCCTTTGATCGa  >  1:1948746/1‑40 (MQ=255)
aaaCGCTGAAGCCAAAAGTTCCTGCCCCTCCTTTGATCGa  >  1:2589746/1‑40 (MQ=255)
aaaCGCTGAAGCCAAAAGTTCCTGCCCCTCCTTTGATCGa  >  1:301904/1‑40 (MQ=255)
aaaCGCTGAAGCCAAAAGTTCCTGCCCCTCCTTTGATCGa  >  1:312166/1‑40 (MQ=255)
aaaCGCTGAAGCCAAAAGTTCCTGCCCCTCCTTTGATCGa  >  1:3128460/1‑40 (MQ=255)
aaaCGCTGAAGCCAAAAGTTCCTGCCCCTCCTTTGATCGa  >  1:485077/1‑40 (MQ=255)
aaaCGCTGAAGCCAAAAGTTCCTGCCCCTCCTTTGATCGa  >  1:774453/1‑40 (MQ=255)
aaaCGCTGAAGCCAAAAGTTCCTGCCCCTCCTTTGATCGa  >  1:847864/1‑40 (MQ=255)
                                       |
AAACGCTGAAGCCAAAAGTTCCTGCCCCTCCTTTGATCGA  >  W3110S.gb/1976855‑1976894

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap:     Deleted base: