Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	2777340	2777367	28	9 [1]	[0] 2	ypjA	adhesin‑like autotransporter

CCGCTGCTCATTTTACCTGCTACGTTACTTTTAAAACGGTTCAGCTTCACGACACCGTCCAGAT  >  W3110S.gb/2777280‑2777343                                                            |     ccGCTGCTCATTTTACCTGCTACGTTACTTTTAAAACGGTTCAGCTTCACGACACCGTcc      <  1:2107571/60‑1 (MQ=255) ccGCTGCTCATTTTACCTGCTACGTTACTTTTAAAACGGTTCAGCTTCACGACACCGTcc      <  1:2301966/60‑1 (MQ=255) ccGCTGCTCATTTTACCTGCTACGTTACTTTTAAAACGGTTCAGCTTCACGACACCGTcc      <  1:2369373/60‑1 (MQ=255) ccGCTGCTCATTTTACCTGCTACGTTACTTTTAAAACGGTTCAGCTTCACGACACCGTcc      <  1:2496934/60‑1 (MQ=255) ccGCTGCTCATTTTACCTGCTACGTTACTTTTAAAACGGTTCAGCTTCACGACACCGTcc      <  1:2678654/60‑1 (MQ=255) ccGCTGCTCATTTTACCTGCTACGTTACTTTTAAAACGGTTCAGCTTCACGACACCGTcc      <  1:2712927/60‑1 (MQ=255) ccGCTGCTCATTTTACCTGCTACGTTACTTTTAAAACGGTTCAGCTTCACGACACCGTcc      <  1:2993821/60‑1 (MQ=255)   gctgctCATTTTACCTGCTACGTTACTTTTAAAACGGTTCAGCTTCACGACACCGTCCAGAt  <  1:1956015/62‑1 (MQ=255)                   gCTACGTTACTTTTAAAACGGTTCAGCTTCACGACACCGTcc      <  1:1133146/42‑1 (MQ=255)                                                            |     CCGCTGCTCATTTTACCTGCTACGTTACTTTTAAAACGGTTCAGCTTCACGACACCGTCCAGAT  >  W3110S.gb/2777280‑2777343

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑