Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	3248240	3248246	7	19 [1]	[0] 2	yqjD	conserved hypothetical protein

AGCCGTTATCGCCTGGGTGAAACCGGTGATGCCATTGCCAAACAAACCCGTGTCGCGGCGGCGC  >  W3110S.gb/3248178‑3248241                                                              |   agCCGTTATCGCCTTGGTGAAACCGGTGATGCCATTGCCAAACAAACCCGTGTCgcggcggc    <  1:2416477/62‑1 (MQ=255) agCCGTTATCGCCTGGGTGAAACCGGTGATGCCATTGCCAAACAAACCCGTGTCgcggcggc    <  1:2703614/62‑1 (MQ=255) agCCGTTATCGCCTGGGTGAAACCGGTGATGCCATTGCCAAACAAACCCGTGTCgcggcggc    <  1:93112/62‑1 (MQ=255) agCCGTTATCGCCTGGGTGAAACCGGTGATGCCATTGCCAAACAAACCCGTGTCgcggcggc    <  1:81949/62‑1 (MQ=255) agCCGTTATCGCCTGGGTGAAACCGGTGATGCCATTGCCAAACAAACCCGTGTCgcggcggc    <  1:575397/62‑1 (MQ=255) agCCGTTATCGCCTGGGTGAAACCGGTGATGCCATTGCCAAACAAACCCGTGTCgcggcggc    <  1:469298/62‑1 (MQ=255) agCCGTTATCGCCTGGGTGAAACCGGTGATGCCATTGCCAAACAAACCCGTGTCgcggcggc    <  1:328902/62‑1 (MQ=255) agCCGTTATCGCCTGGGTGAAACCGGTGATGCCATTGCCAAACAAACCCGTGTCgcggcggc    <  1:3082738/62‑1 (MQ=255) agCCGTTATCGCCTGGGTGAAACCGGTGATGCCATTGCCAAACAAACCCGTGTCgcggcggc    <  1:3074878/62‑1 (MQ=255) agCCGTTATCGCCTGGGTGAAACCGGTGATGCCATTGCCAAACAAACCCGTGTCgcggcggc    <  1:1115641/62‑1 (MQ=255) agCCGTTATCGCCTGGGTGAAACCGGTGATGCCATTGCCAAACAAACCCGTGTCgcggcggc    <  1:2072858/62‑1 (MQ=255) agCCGTTATCGCCTGGGTGAAACCGGTGATGCCATTGCCAAACAAACCCGTGTCgcggcggc    <  1:1980252/62‑1 (MQ=255) agCCGTTATCGCCTGGGTGAAACCGGTGATGCCATTGCCAAACAAACCCGTGTCgcggcggc    <  1:1802926/62‑1 (MQ=255) agCCGTTATCGCCTGGGTGAAACCGGTGATGCCATTGCCAAACAAACCCGTGTCgcggcggc    <  1:1593784/62‑1 (MQ=255) agCCGTTATCGCCTGGGTGAAACCGGTGATGCCATTGCCAAACAAACCCGTGTCgcggcggc    <  1:1523060/62‑1 (MQ=255) agCCGTTATCGCCTGGGTGAAACCGGTGATGCCATTGCCAAACAAACCCGTGTCgcggcggc    <  1:1203750/62‑1 (MQ=255)   ccGTTATCGCCTGGGTGAAACCGGTGATGCCATTGCCAAACAAACCCGTGTCgcggcggc    <  1:570451/60‑1 (MQ=255)    cGTTATCGCCTGGGTGAAACCGGTGATGCCATTGCCAAACAAACCCGTGTCGCGGCGgcgc  >  1:1427698/1‑61 (MQ=255)                    aaaCCGGTGATGCCATTGCCAAACAAACCCGTGTCgcggcggc    <  1:776565/43‑1 (MQ=255)                                                              |   AGCCGTTATCGCCTGGGTGAAACCGGTGATGCCATTGCCAAACAAACCCGTGTCGCGGCGGCGC  >  W3110S.gb/3248178‑3248241

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑