Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	4324105	4324107	3	7 [0]	[0] 9	phnJ	carbon‑phosphorus lyase complex subunit

CGACACGGCGTTGGTGGTGTCATCCGCGCCCTGGTCAATCACCTTCAGCACGTCGCTTTCG  >  W3110S.gb/4324044‑4324104                                                             | cGACACGGCGTTGGTGGTGTCATCCGCGCCCTGGTCAATCACCTTCAGCACGTCGCTTTCg  >  1:1183677/1‑61 (MQ=255) cGACACGGCGTTGGTGGTGTCATCCGCGCCCTGGTCAATCACCTTCAGCACGTCGCTTTCg  >  1:1873142/1‑61 (MQ=255) cGACACGGCGTTGGTGGTGTCATCCGCGCCCTGGTCAATCACCTTCAGCACGTCGCTTTCg  >  1:2855131/1‑61 (MQ=255) cGACACGGCGTTGGTGGTGTCATCCGCGCCCTGGTCAATCACCTTCAGCACGTCGCTTTCg  >  1:3097703/1‑61 (MQ=255) cGACACGGCGTTGGTGGTGTCATCCGCGCCCTGGTCAATCACCTTCAGCACGTCGCTTTCg  >  1:388349/1‑61 (MQ=255) cGACACGGCGTTGGTGGTGTCATCCGCGCCCTGGTCAATCACCTTCAGCACGTCGCTTTCg  >  1:421658/1‑61 (MQ=255) cGACACGGCGTTGGTGGTGTCATCCGCGCCCTGGTCAATCACCTTCAGCACGTCGCTTTCg  >  1:554790/1‑61 (MQ=255)                                                             | CGACACGGCGTTGGTGGTGTCATCCGCGCCCTGGTCAATCACCTTCAGCACGTCGCTTTCG  >  W3110S.gb/4324044‑4324104

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑