Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	89667	89668	2	4 [0]	[0] 8	mraZ	conserved hypothetical protein

CAAAGGGCGCTTATCAGTGCCTACCCGTTATCGGGAACAGCTGCTTGAGAACGCTGCCGGT  >  W3110S.gb/89669‑89729 |                                                             cAAAGGGCGCTTATCAGTGCCTACCCGTTATCGGGAACAGCTGCTTGAGAACGCTGCCGGt  >  1:1162812/1‑61 (MQ=255) cAAAGGGCGCTTATCAGTGCCTACCCGTTATCGGGAACAGCTGCTTGAGAACGCTGCCGGt  >  1:1385080/1‑61 (MQ=255) cAAAGGGCGCTTATCAGTGCCTACCCGTTATCGGGAACAGCTGCTTGAGAACGCTGCCGGt  >  1:1633243/1‑61 (MQ=255) cAAAGGGCGCTTATCAGTGCCTACCCGTTATCGGGAACAGCTGCTTGAGAACGCTGCCGGt  >  1:1994524/1‑61 (MQ=255) cAAAGGGCGCTTATCAGTGCCTACCCGTTATCGGGAACAGCTGCTTGAGAACGCTGCCGGt  >  1:2018188/1‑61 (MQ=255) cAAAGGGCGCTTATCAGTGCCTACCCGTTATCGGGAACAGCTGCTTGAGAACGCTGCCGGt  >  1:282474/1‑61 (MQ=255) cAAAGGGCGCTTATCAGTGCCTACCCGTTATCGGGAACAGCTGCTTGAGAACGCTGCCGGt  >  1:594323/1‑61 (MQ=255) cAAAGCGCGCTTATCAGTGCCTACCCGTTATCGGGa                           >  1:1735512/1‑36 (MQ=255) |                                                             CAAAGGGCGCTTATCAGTGCCTACCCGTTATCGGGAACAGCTGCTTGAGAACGCTGCCGGT  >  W3110S.gb/89669‑89729

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑