Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	1134360	1134376	17	4 [0]	[1] 15	flgE	flagellar hook protein

CGTTGCTATCAGCCAGAACGGTTTTTTCCGTCTGGTAGACAGCAACGGTTCGGTGTTCTACAGCCGT  >  W3110S.gb/1134372‑1134438      |                                                              cGTTGCTATCAGCCAGAACGGTTTTTTCCGTCTGGTAGACAGCAACGGTTCGGTGTTCTa         <  1:2699574/60‑1 (MQ=255)      cTATCAGCCAGAACGGTTTTTTCCGTCTGGTAGACAGCAACGGTTCGGTGTTCTACAGcc    >  1:2262260/1‑60 (MQ=255)      cTATCAGCCAGAACGGTTTTTTCCGTCTGGTAGACAGCAACGGTTCGGTGTTCTACAGCCGt  >  1:1503462/1‑62 (MQ=255)      cTATCAGCCAGAACGGTTTTTTCCGTCTGGTAGACAGCAACGGTTCGGTGTTCTACAGCCGt  >  1:1530185/1‑62 (MQ=255)      cTATCAGCCAGAACGGTTTTTTCCGTCTGGTAGACAGCAACGGTTCGGTGTTCTACAGCCGt  >  1:2001153/1‑62 (MQ=255)      cTATCAGCCAGAACGGTTTTTTCCGTCTGGTAGACAGCAACGGTTCGGTGTTCTACAGCCGt  >  1:2084186/1‑62 (MQ=255)      cTATCAGCCAGAACGGTTTTTTCCGTCTGGTAGACAGCAACGGTTCGGTGTTCTACAGCCGt  >  1:2689568/1‑62 (MQ=255)      cTATCAGCCAGAACGGTTTTTTCCGTCTGGTAGACAGCAACGGTTCGGTGTTCTACAGCCGt  >  1:2772737/1‑62 (MQ=255)      cTATCAGCCAGAACGGTTTTTTCCGTCTGGTAGACAGCAACGGTTCGGTGTTCTACAGCCGt  >  1:29474/1‑62 (MQ=255)      cTATCAGCCAGAACGGTTTTTTCCGTCTGGTAGACAGCAACGGTTCGGTGTTCTACAGCCGt  >  1:324755/1‑62 (MQ=255)      cTATCAGCCAGAACGGTTTTTTCCGTCTGGTAGACAGCAACGGTTCGGTGTTCTACAGCCGt  >  1:459390/1‑62 (MQ=255)      cTATCAGCCAGAACGGTTTTTTCCGTCTGGTAGACAGCAACGGTTCGGTGTTCTACAGCCGt  >  1:509252/1‑62 (MQ=255)      cTATCAGCCAGAACGGTTTTTTCCGTCTGGTAGACAGCAACGGTTCGGTGTTCTACAGCCGt  >  1:53855/1‑62 (MQ=255)      cTATCAGCCAGAACGGTTTTTTCCGTCTGGTAGACAGCAACGGTTCGGTGTTCTACAGCCGt  >  1:750198/1‑62 (MQ=255)      cTATCAGCCAGAACGGTTTTTTCCGTCTGGTAGACAGCAACGGTTCGGTGTTCTACAGCCGt  >  1:865508/1‑62 (MQ=255)      |                                                              CGTTGCTATCAGCCAGAACGGTTTTTTCCGTCTGGTAGACAGCAACGGTTCGGTGTTCTACAGCCGT  >  W3110S.gb/1134372‑1134438

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑