Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	1138487	1138509	23	2 [0]	[0] 9	flgI	predicted flagellar basal body protein

TATTCAGGTGCGCGTACCGAGTGGCAACAGTTCCCAGGTCCGCTTCCTTGCCGATATTCAG  >  W3110S.gb/1138510‑1138570 |                                                             tATTCAGGTGCGCGTACCGAGTGGCAACAGTTCCCAGGTCCGCTTCCTTGCCGATATTCAg  >  1:1689068/1‑61 (MQ=255) tATTCAGGTGCGCGTACCGAGTGGCAACAGTTCCCAGGTCCGCTTCCTTGCCGATATTCAg  >  1:2266397/1‑61 (MQ=255) tATTCAGGTGCGCGTACCGAGTGGCAACAGTTCCCAGGTCCGCTTCCTTGCCGATATTCAg  >  1:2639538/1‑61 (MQ=255) tATTCAGGTGCGCGTACCGAGTGGCAACAGTTCCCAGGTCCGCTTCCTTGCCGATATTCAg  >  1:2887685/1‑61 (MQ=255) tATTCAGGTGCGCGTACCGAGTGGCAACAGTTCCCAGGTCCGCTTCCTTGCCGATATTCAg  >  1:2911310/1‑61 (MQ=255) tATTCAGGTGCGCGTACCGAGTGGCAACAGTTCCCAGGTCCGCTTCCTTGCCGATATTCAg  >  1:3072956/1‑61 (MQ=255) tATTCAGGTGCGCGTACCGAGTGGCAACAGTTCCCAGGTCCGCTTCCTTGCCGATATTCAg  >  1:390530/1‑61 (MQ=255) tATTCAGGTGCGCGTACCGAGTGGCAACAGTTCCCAGGTCCGCTTCCTTGCCGATATTCAg  >  1:831446/1‑61 (MQ=255) tATTCAGGTGCGCGTACCGAGTGGCAACAGTTCCCAGGTCCGCTTCCTTGCAGATATTCAg  >  1:2850964/1‑61 (MQ=255) |                                                             TATTCAGGTGCGCGTACCGAGTGGCAACAGTTCCCAGGTCCGCTTCCTTGCCGATATTCAG  >  W3110S.gb/1138510‑1138570

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑