Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	1852244	1852253	10	5 [0]	[0] 9	sppA	protease IV

CCGGGCAATGTTGCCAGATGCGTTCCAGGCCATGTTACCTGCACCGCTGGCCTCGGTAGCC  >  W3110S.gb/1852254‑1852314 |                                                             ccGGGCAATGTTGCCAGATGCGTTCCAGGCCATGTTACCTGCACCGCTGGCCTCGGTAGcc  >  1:1020249/1‑61 (MQ=255) ccGGGCAATGTTGCCAGATGCGTTCCAGGCCATGTTACCTGCACCGCTGGCCTCGGTAGcc  >  1:1535506/1‑61 (MQ=255) ccGGGCAATGTTGCCAGATGCGTTCCAGGCCATGTTACCTGCACCGCTGGCCTCGGTAGcc  >  1:1556348/1‑61 (MQ=255) ccGGGCAATGTTGCCAGATGCGTTCCAGGCCATGTTACCTGCACCGCTGGCCTCGGTAGcc  >  1:1984098/1‑61 (MQ=255) ccGGGCAATGTTGCCAGATGCGTTCCAGGCCATGTTACCTGCACCGCTGGCCTCGGTAGcc  >  1:2870482/1‑61 (MQ=255) ccGGGCAATGTTGCCAGATGCGTTCCAGGCCATGTTACCTGCACCGCTGGCCTCGGTAGcc  >  1:3057593/1‑61 (MQ=255) ccGGGCAATGTTGCCAGATGCGTTCCAGGCCATGTTACCTGCACCGCTGGCCTCGGTAGcc  >  1:366351/1‑61 (MQ=255) ccGGGCAATGTTGCCAGATGCGTTCCAGGCCATGTTACCTGCACCGCTGGCCTCGGTAGcc  >  1:923127/1‑61 (MQ=255) ccGGGCAATGTTGCCAGATGCGTTCCAGGCCATGTTACCTGCACCGCAGGCCTCGGTAGcc  >  1:1419543/1‑61 (MQ=255) |                                                             CCGGGCAATGTTGCCAGATGCGTTCCAGGCCATGTTACCTGCACCGCTGGCCTCGGTAGCC  >  W3110S.gb/1852254‑1852314

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑