Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	3502471	3502479	9	5 [0]	[0] 9	katG	catalase/hydroperoxidase HPI(I)

CACGACCCGCGCCACCGCGTCCATCGATTGAACGGTAAGTCCCCGCGCCGTGCCAGGC  >  W3110S.gb/3502480‑3502537 |                                                          cACGACCCGCGCCACCGCGTCCATCGATTGAACGGTAAGTCCCCGCGCCGTGCCAgg   >  1:1359243/1‑57 (MQ=255) cACGACCCGCGCCACCGCGTCCATCGATTGAACGGTAAGTCCCCGCGCCGTGCCAGGc  >  1:1767649/1‑58 (MQ=255) cACGACCCGCGCCACCGCGTCCATCGATTGAACGGTAAGTCCCCGCGCCGTGCCAGGc  >  1:2319938/1‑58 (MQ=255) cACGACCCGCGCCACCGCGTCCATCGATTGAACGGTAAGTCCCCGCGCCGTGCCAGGc  >  1:2392785/1‑58 (MQ=255) cACGACCCGCGCCACCGCGTCCATCGATTGAACGGTAAGTCCCCGCGCCGTGCCAGGc  >  1:2521625/1‑58 (MQ=255) cACGACCCGCGCCACCGCGTCCATCGATTGAACGGTAAGTCCCCGCGCCGTGCCAGGc  >  1:3064042/1‑58 (MQ=255) cACGACCCGCGCCACCGCGTCCATCGATTGAACGGTAAGTCCCCGCGCCGTGCCAGGc  >  1:647498/1‑58 (MQ=255) cACGACCCGCGCCACCGCGTCCATCGATTGAACGGTAAGTCCCCGCGCCGTGCCAGGc  >  1:786022/1‑58 (MQ=255) cACGACCCGCGCCACCGCGTCAATCGATTGAACGGTAAGTCCCCGCGCCGTGCCAGGc  >  1:1545917/1‑58 (MQ=255) |                                                          CACGACCCGCGCCACCGCGTCCATCGATTGAACGGTAAGTCCCCGCGCCGTGCCAGGC  >  W3110S.gb/3502480‑3502537

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑