Predicted mutation
evidence	seq id	position	mutation	annotation	gene	description
RA	W3110S.gb	1,091,605	C→G	P369P (CCG→CCC)	ycdS ←	predicted outer membrane protein

Read alignment evidence...
	seq id	position		ref	new	freq	score (cons/poly)	reads	annotation	genes	product
*	W3110S.gb	1,091,605	0	C	G	100.0%	110.3 / NA	32	P369P (CCG→CCC)	ycdS	predicted outer membrane protein
Reads supporting (aligned to +/- strand):  ref base C (0/0);  new base G (32/0);  total (32/0)

AGGCGGCGAAGTATTAATGGTATGTTGGGTGACAGTTAGCGCGCCCGGATAATTT  >  W3110S.gb/1091560‑1091614                                              |          aGGCGGCGAAGTATTAATGGTATGTTGGGTGACTGTTAGCGCGCCGGGATAAttt  >  1:1378335/1‑55 (MQ=255) aGGCGGCGAAGTATTAATGGTATGTTGGGTGACAGTTAGCGCGCCGGGATAAttt  >  1:2505233/1‑55 (MQ=255) aGGCGGCGAAGTATTAATGGTATGTTGGGTGACAGTTAGCGCGCCGGGATAAttt  >  1:986453/1‑55 (MQ=255) aGGCGGCGAAGTATTAATGGTATGTTGGGTGACAGTTAGCGCGCCGGGATAAttt  >  1:887355/1‑55 (MQ=255) aGGCGGCGAAGTATTAATGGTATGTTGGGTGACAGTTAGCGCGCCGGGATAAttt  >  1:748060/1‑55 (MQ=255) aGGCGGCGAAGTATTAATGGTATGTTGGGTGACAGTTAGCGCGCCGGGATAAttt  >  1:720485/1‑55 (MQ=255) aGGCGGCGAAGTATTAATGGTATGTTGGGTGACAGTTAGCGCGCCGGGATAAttt  >  1:711105/1‑55 (MQ=255) aGGCGGCGAAGTATTAATGGTATGTTGGGTGACAGTTAGCGCGCCGGGATAAttt  >  1:699432/1‑55 (MQ=255) aGGCGGCGAAGTATTAATGGTATGTTGGGTGACAGTTAGCGCGCCGGGATAAttt  >  1:698332/1‑55 (MQ=255) aGGCGGCGAAGTATTAATGGTATGTTGGGTGACAGTTAGCGCGCCGGGATAAttt  >  1:625581/1‑55 (MQ=255) aGGCGGCGAAGTATTAATGGTATGTTGGGTGACAGTTAGCGCGCCGGGATAAttt  >  1:304709/1‑55 (MQ=255) aGGCGGCGAAGTATTAATGGTATGTTGGGTGACAGTTAGCGCGCCGGGATAAttt  >  1:2977457/1‑55 (MQ=255) aGGCGGCGAAGTATTAATGGTATGTTGGGTGACAGTTAGCGCGCCGGGATAAttt  >  1:2959781/1‑55 (MQ=255) aGGCGGCGAAGTATTAATGGTATGTTGGGTGACAGTTAGCGCGCCGGGATAAttt  >  1:2783884/1‑55 (MQ=255) aGGCGGCGAAGTATTAATGGTATGTTGGGTGACAGTTAGCGCGCCGGGATAAttt  >  1:2752625/1‑55 (MQ=255) aGGCGGCGAAGTATTAATGGTATGTTGGGTGACAGTTAGCGCGCCGGGATAAttt  >  1:2521467/1‑55 (MQ=255) aGGCGGCGAAGTATTAATGGTATGTTGGGTGACAGTTAGCGCGCCGGGATAAttt  >  1:1089297/1‑55 (MQ=255) aGGCGGCGAAGTATTAATGGTATGTTGGGTGACAGTTAGCGCGCCGGGATAAttt  >  1:2319699/1‑55 (MQ=255) aGGCGGCGAAGTATTAATGGTATGTTGGGTGACAGTTAGCGCGCCGGGATAAttt  >  1:223998/1‑55 (MQ=255) aGGCGGCGAAGTATTAATGGTATGTTGGGTGACAGTTAGCGCGCCGGGATAAttt  >  1:216135/1‑55 (MQ=255) aGGCGGCGAAGTATTAATGGTATGTTGGGTGACAGTTAGCGCGCCGGGATAAttt  >  1:2115439/1‑55 (MQ=255) aGGCGGCGAAGTATTAATGGTATGTTGGGTGACAGTTAGCGCGCCGGGATAAttt  >  1:2088647/1‑55 (MQ=255) aGGCGGCGAAGTATTAATGGTATGTTGGGTGACAGTTAGCGCGCCGGGATAAttt  >  1:2036028/1‑55 (MQ=255) aGGCGGCGAAGTATTAATGGTATGTTGGGTGACAGTTAGCGCGCCGGGATAAttt  >  1:20048/1‑55 (MQ=255) aGGCGGCGAAGTATTAATGGTATGTTGGGTGACAGTTAGCGCGCCGGGATAAttt  >  1:1864662/1‑55 (MQ=255) aGGCGGCGAAGTATTAATGGTATGTTGGGTGACAGTTAGCGCGCCGGGATAAttt  >  1:1737790/1‑55 (MQ=255) aGGCGGCGAAGTATTAATGGTATGTTGGGTGACAGTTAGCGCGCCGGGATAAttt  >  1:1603699/1‑55 (MQ=255) aGGCGGCGAAGTATTAATGGTATGTTGGGTGACAGTTAGCGCGCCGGGATAAttt  >  1:1568852/1‑55 (MQ=255) aGGCGGCGAAGTATTAATGGTATGTTGGGTGACAGTTAGCGCGCCGGGATAAttt  >  1:1485046/1‑55 (MQ=255) aGGCGGCGAAGTATTAATGGTATGTTGGGTGACAGTTAGCGCGCCGGGATAAttt  >  1:1226106/1‑55 (MQ=255) aGGCGGCGAAGTATTAATGGTATGTTGGGTGACAGTTAGCGCGCCGGGATAAttt  >  1:1120258/1‑55 (MQ=255) aGGCGGCGAAGTATTAATGGTATGTTGGGTGACAGTTAACGCGCCGGGATAAttt  >  1:2626707/1‑55 (MQ=255)                                              |          AGGCGGCGAAGTATTAATGGTATGTTGGGTGACAGTTAGCGCGCCCGGATAATTT  >  W3110S.gb/1091560‑1091614

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑