Predicted mutation
evidence	seq id	position	mutation	annotation	gene	description
RA	W3110S.gb	3,068,411	A→G	V18A (GTA→GCA)	mscS ←	mechanosensitive channel

Read alignment evidence...
	seq id	position		ref	new	freq	score (cons/poly)	reads	annotation	genes	product
*	W3110S.gb	3,068,411	0	A	G	100.0%	103.8 / NA	30	V18A (GTA→GCA)	mscS	mechanosensitive channel
Reads supporting (aligned to +/- strand):  ref base A (0/0);  new base G (21/9);  total (21/9)

TTAGCAGCAGCGCCTGGTTAGCTACCAGCCAGCTTCCCGCGCCGTTTATGCTATCGACAACATTCAAATCT  >  W3110S.gb/3068388‑3068458                        |                                                ttAGCAGCAGCGCCTGGTTAGCTGCCAGCCAGCTTCCCGCGCCGTTTATGCTATCGacaaca           >  1:3015361/1‑62 (MQ=255) ttAGCAGCAGCGCCTGGTTAGCTGCCAGCCAGCTTCCCGCGCCGTTTATGCTATCGacaac            >  1:1222603/1‑61 (MQ=255) ttAGCAGCAGCGCCTGGTTAGCTGCCAGCCAGCTTCCCGCGCCGTTTATGCTATCGacaac            >  1:3029064/1‑61 (MQ=255) ttAGCAGCAGCGCCTGGTTAGCTGCCAGCCAGCTTCCCGCGCCGTTTATGCTATCGaca              >  1:1614539/1‑59 (MQ=255)  tAGCAGCAGCGCCTGGTTAGCTGCCAGCCAGCTTCCCGCGCCGTTTATGCTATCGacaaca           >  1:142844/1‑61 (MQ=255)  tAGCAGCAGCGCCTGGTTAGCTGCCAGCCAGCTTCCCGCGCCGTTTATGCTATCGacaaca           >  1:938/1‑61 (MQ=255)  tAGCAGCAGCGCCTGGTTAGCTGCCAGCCAGCTTCCCGCGCCGTTTATGCTATCGacaaca           >  1:722382/1‑61 (MQ=255)  tAGCAGCAGCGCCTGGTTAGCTGCCAGCCAGCTTCCCGCGCCGTTTATGCTATCGacaaca           >  1:669381/1‑61 (MQ=255)  tAGCAGCAGCGCCTGGTTAGCTGCCAGCCAGCTTCCCGCGCCGTTTATGCTATCGacaaca           >  1:291671/1‑61 (MQ=255)  tAGCAGCAGCGCCTGGTTAGCTGCCAGCCAGCTTCCCGCGCCGTTTATGCTATCGacaaca           >  1:287894/1‑61 (MQ=255)  tAGCAGCAGCGCCTGGTTAGCTGCCAGCCAGCTTCCCGCGCCGTTTATGCTATCGacaaca           >  1:2790349/1‑61 (MQ=255)  tAGCAGCAGCGCCTGGTTAGCTGCCAGCCAGCTTCCCGCGCCGTTTATGCTATCGacaaca           >  1:2746184/1‑61 (MQ=255)  tAGCAGCAGCGCCTGGTTAGCTGCCAGCCAGCTTCCCGCGCCGTTTATGCTATCGacaaca           >  1:2446965/1‑61 (MQ=255)  tAGCAGCAGCGCCTGGTTAGCTGCCAGCCAGCTTCCCGCGCCGTTTATGCTATCGacaaca           >  1:2351178/1‑61 (MQ=255)          gcgcCTGGTTAGCTGCCAGCCAGCTTCCCGCGCCGTTTATGCTATCGACAACATTCAAATCt  <  1:1992836/62‑1 (MQ=255)          gcgcCTGGTTAGCTGCCAGCCAGCTTCCCGCGCCGTTTATGCTATCGACAACATTCAAATCt  >  1:960668/1‑62 (MQ=255)          gcgcCTGGTTAGCTGCCAGCCAGCTTCCCGCGCCGTTTATGCTATCGACAACATTCAAATCt  <  1:1572286/62‑1 (MQ=255)          gcgcCTGGTTAGCTGCCAGCCAGCTTCCCGCGCCGTTTATGCTATCGACAACATTCAAATCt  >  1:823278/1‑62 (MQ=255)          gcgcCTGGTTAGCTGCCAGCCAGCTTCCCGCGCCGTTTATGCTATCGACAACATTCAAATCt  >  1:754712/1‑62 (MQ=255)          gcgcCTGGTTAGCTGCCAGCCAGCTTCCCGCGCCGTTTATGCTATCGACAACATTCAAATCt  <  1:1662002/62‑1 (MQ=255)          gcgcCTGGTTAGCTGCCAGCCAGCTTCCCGCGCCGTTTATGCTATCGACAACATTCAAATCt  >  1:183693/1‑62 (MQ=255)          gcgcCTGGTTAGCTGCCAGCCAGCTTCCCGCGCCGTTTATGCTATCGACAACATTCAAATCt  <  1:617455/62‑1 (MQ=255)          gcgcCTGGTTAGCTGCCAGCCAGCTTCCCGCGCCGTTTATGCTATCGACAACATTCAAATCt  >  1:593167/1‑62 (MQ=255)          gcgcCTGGTTAGCTGCCAGCCAGCTTCCCGCGCCGTTTATGCTATCGACAACATTCAAATCt  <  1:2517216/62‑1 (MQ=255)          gcgcCTGGTTAGCTGCCAGCCAGCTTCCCGCGCCGTTTATGCTATCGACAACATTCAAATCt  <  1:2019886/62‑1 (MQ=255)          gcgcCTGGTTAGCTGCCAGCCAGCTTCCCGCGCCGTTTATGCTATCGACAACATTCAAATCt  <  1:2964/62‑1 (MQ=255)          gcgcCTGGTTAGCTGCCAGCCAGCTTCCCGCGCCGTTTATGCTATCGACAACATTCAAATCt  >  1:2311334/1‑62 (MQ=255)          gcgcCTGGTTAGCTGCCAGCCAGCTTCCCGCGCCGTTTATGCTATCGACAACATTCAAATCt  <  1:2347364/62‑1 (MQ=255)          gcgcCTGGTTAGCTGCCAGCCAGCTTCCCGCGCCGTTTATGCTATCGACAACATTCAAATCt  >  1:2643873/1‑62 (MQ=255)          gcgcCTGGTTAGCTGCCAGCCAGCTTCCCGCGCCGTTTATGCTATCGACAACATTCAAATCt  <  1:2598463/62‑1 (MQ=255)                        |                                                TTAGCAGCAGCGCCTGGTTAGCTACCAGCCAGCTTCCCGCGCCGTTTATGCTATCGACAACATTCAAATCT  >  W3110S.gb/3068388‑3068458

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑