Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	1789000	1789142	143	31 [0]	[1] 11	pps/ydiA	phosphoenolpyruvate synthase/conserved hypothetical protein

TTTTACTTTTTAAGACTGATCCCAGCGTTGCGCAAATCTGCTCTCTTCGACAATTTCCACA  >  W3110S.gb/1788939‑1788999                                                             | ttttACTTTTTAAGACTGGTCCCAGCGTTGCGCAAATCTGCTCTCTTCGACAATTTCcaca  >  1:873303/1‑61 (MQ=255) ttttACTTTTTAAGACTGATCCCAGCGTTGCGCAAATCTGCTCTCTTCGACAATTTCcaca  >  1:1136211/1‑61 (MQ=255) ttttACTTTTTAAGACTGATCCCAGCGTTGCGCAAATCTGCTCTCTTCGACAATTTCcaca  >  1:930497/1‑61 (MQ=255) ttttACTTTTTAAGACTGATCCCAGCGTTGCGCAAATCTGCTCTCTTCGACAATTTCcaca  >  1:898748/1‑61 (MQ=255) ttttACTTTTTAAGACTGATCCCAGCGTTGCGCAAATCTGCTCTCTTCGACAATTTCcaca  >  1:893398/1‑61 (MQ=255) ttttACTTTTTAAGACTGATCCCAGCGTTGCGCAAATCTGCTCTCTTCGACAATTTCcaca  >  1:826998/1‑61 (MQ=255) ttttACTTTTTAAGACTGATCCCAGCGTTGCGCAAATCTGCTCTCTTCGACAATTTCcaca  >  1:688604/1‑61 (MQ=255) ttttACTTTTTAAGACTGATCCCAGCGTTGCGCAAATCTGCTCTCTTCGACAATTTCcaca  >  1:642675/1‑61 (MQ=255) ttttACTTTTTAAGACTGATCCCAGCGTTGCGCAAATCTGCTCTCTTCGACAATTTCcaca  >  1:541738/1‑61 (MQ=255) ttttACTTTTTAAGACTGATCCCAGCGTTGCGCAAATCTGCTCTCTTCGACAATTTCcaca  >  1:505242/1‑61 (MQ=255) ttttACTTTTTAAGACTGATCCCAGCGTTGCGCAAATCTGCTCTCTTCGACAATTTCcaca  >  1:2902471/1‑61 (MQ=255) ttttACTTTTTAAGACTGATCCCAGCGTTGCGCAAATCTGCTCTCTTCGACAATTTCcaca  >  1:2734038/1‑61 (MQ=255) ttttACTTTTTAAGACTGATCCCAGCGTTGCGCAAATCTGCTCTCTTCGACAATTTCcaca  >  1:2722848/1‑61 (MQ=255) ttttACTTTTTAAGACTGATCCCAGCGTTGCGCAAATCTGCTCTCTTCGACAATTTCcaca  >  1:2638679/1‑61 (MQ=255) ttttACTTTTTAAGACTGATCCCAGCGTTGCGCAAATCTGCTCTCTTCGACAATTTCcaca  >  1:1582591/1‑61 (MQ=255) ttttACTTTTTAAGACTGATCCCAGCGTTGCGCAAATCTGCTCTCTTCGACAATTTCcaca  >  1:1054018/1‑61 (MQ=255) ttttACTTTTTAAGACTGATCCCAGCGTTGCGCAAATCTGCTCTCTTCGACAATTTCcaca  >  1:1179151/1‑61 (MQ=255) ttttACTTTTTAAGACTGATCCCAGCGTTGCGCAAATCTGCTCTCTTCGACAATTTCcaca  >  1:1183724/1‑61 (MQ=255) ttttACTTTTTAAGACTGATCCCAGCGTTGCGCAAATCTGCTCTCTTCGACAATTTCcaca  >  1:1246643/1‑61 (MQ=255) ttttACTTTTTAAGACTGATCCCAGCGTTGCGCAAATCTGCTCTCTTCGACAATTTCcaca  >  1:1269856/1‑61 (MQ=255) ttttACTTTTTAAGACTGATCCCAGCGTTGCGCAAATCTGCTCTCTTCGACAATTTCcaca  >  1:1389927/1‑61 (MQ=255) ttttACTTTTTAAGACTGATCCCAGCGTTGCGCAAATCTGCTCTCTTCGACAATTTCcaca  >  1:144245/1‑61 (MQ=255) ttttACTTTTTAAGACTGATCCCAGCGTTGCGCAAATCTGCTCTCTTCGACAATTTCcaca  >  1:2246306/1‑61 (MQ=255) ttttACTTTTTAAGACTGATCCCAGCGTTGCGCAAATCTGCTCTCTTCGACAATTTCcaca  >  1:1691607/1‑61 (MQ=255) ttttACTTTTTAAGACTGATCCCAGCGTTGCGCAAATCTGCTCTCTTCGACAATTTCcaca  >  1:1790895/1‑61 (MQ=255) ttttACTTTTTAAGACTGATCCCAGCGTTGCGCAAATCTGCTCTCTTCGACAATTTCcaca  >  1:1870284/1‑61 (MQ=255) ttttACTTTTTAAGACTGATCCCAGCGTTGCGCAAATCTGCTCTCTTCGACAATTTCcaca  >  1:1903208/1‑61 (MQ=255) ttttACTTTTTAAGACTGATCCCAGCGTTGCGCAAATCTGCTCTCTTCGACAATTTCcaca  >  1:2018239/1‑61 (MQ=255) ttttACTTTTTAAGACTGATCCCAGCGTTGCGCAAATCTGCTCTCTACGACAATTTCcaca  >  1:2812946/1‑61 (MQ=255) ttttACTTTTTAAGACTGATCCCAGCGTTGCGCAAATCTGCTATCTTCGACAATTTCcaca  >  1:785873/1‑61 (MQ=255) ttttACTTTTAAAGACTGATCCCAGCGTTGCGCAAATCTGCTCTCTTCGACAATTTCaaca  >  1:2578296/1‑61 (MQ=255)                                                             | TTTTACTTTTTAAGACTGATCCCAGCGTTGCGCAAATCTGCTCTCTTCGACAATTTCCACA  >  W3110S.gb/1788939‑1788999

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑