Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	1940090	1940110	21	44 [0]	[0] 21	pykA	pyruvate kinase II

CAAGGTTGAACGTGCGGAAGCCGTTTGCAGCCAGGATGCAATGGATGACATCATCCTCGCCT  >  W3110S.gb/1940028‑1940089                                                              | cAAGGTTGAACGTGCGGAAGCCGTTTGCAGCCAGGATGCAATGGATGACATCATCCTCGCct  >  1:535449/1‑62 (MQ=255) cAAGGTTGAACGTGCGGAAGCCGTTTGCAGCCAGGATGCAATGGATGACATCATCCTCGCct  >  1:1068896/1‑62 (MQ=255) cAAGGTTGAACGTGCGGAAGCCGTTTGCAGCCAGGATGCAATGGATGACATCATCCTCGCct  >  1:2383483/1‑62 (MQ=255) cAAGGTTGAACGTGCGGAAGCCGTTTGCAGCCAGGATGCAATGGATGACATCATCCTCGCct  >  1:248440/1‑62 (MQ=255) cAAGGTTGAACGTGCGGAAGCCGTTTGCAGCCAGGATGCAATGGATGACATCATCCTCGCct  >  1:2485416/1‑62 (MQ=255) cAAGGTTGAACGTGCGGAAGCCGTTTGCAGCCAGGATGCAATGGATGACATCATCCTCGCct  >  1:2602220/1‑62 (MQ=255) cAAGGTTGAACGTGCGGAAGCCGTTTGCAGCCAGGATGCAATGGATGACATCATCCTCGCct  >  1:2767417/1‑62 (MQ=255) cAAGGTTGAACGTGCGGAAGCCGTTTGCAGCCAGGATGCAATGGATGACATCATCCTCGCct  >  1:2913831/1‑62 (MQ=255) cAAGGTTGAACGTGCGGAAGCCGTTTGCAGCCAGGATGCAATGGATGACATCATCCTCGCct  >  1:332160/1‑62 (MQ=255) cAAGGTTGAACGTGCGGAAGCCGTTTGCAGCCAGGATGCAATGGATGACATCATCCTCGCct  >  1:342338/1‑62 (MQ=255) cAAGGTTGAACGTGCGGAAGCCGTTTGCAGCCAGGATGCAATGGATGACATCATCCTCGCct  >  1:397856/1‑62 (MQ=255) cAAGGTTGAACGTGCGGAAGCCGTTTGCAGCCAGGATGCAATGGATGACATCATCCTCGCct  >  1:2302210/1‑62 (MQ=255) cAAGGTTGAACGTGCGGAAGCCGTTTGCAGCCAGGATGCAATGGATGACATCATCCTCGCct  >  1:660045/1‑62 (MQ=255) cAAGGTTGAACGTGCGGAAGCCGTTTGCAGCCAGGATGCAATGGATGACATCATCCTCGCct  >  1:692651/1‑62 (MQ=255) cAAGGTTGAACGTGCGGAAGCCGTTTGCAGCCAGGATGCAATGGATGACATCATCCTCGCct  >  1:705358/1‑62 (MQ=255) cAAGGTTGAACGTGCGGAAGCCGTTTGCAGCCAGGATGCAATGGATGACATCATCCTCGCct  >  1:74025/1‑62 (MQ=255) cAAGGTTGAACGTGCGGAAGCCGTTTGCAGCCAGGATGCAATGGATGACATCATCCTCGCct  >  1:787814/1‑62 (MQ=255) cAAGGTTGAACGTGCGGAAGCCGTTTGCAGCCAGGATGCAATGGATGACATCATCCTCGCct  >  1:824717/1‑62 (MQ=255) cAAGGTTGAACGTGCGGAAGCCGTTTGCAGCCAGGATGCAATGGATGACATCATCCTCGCct  >  1:82828/1‑62 (MQ=255) cAAGGTTGAACGTGCGGAAGCCGTTTGCAGCCAGGATGCAATGGATGACATCATCCTCGCct  >  1:881564/1‑62 (MQ=255) cAAGGTTGAACGTGCGGAAGCCGTTTGCAGCCAGGATGCAATGGATGACATCATCCTCGCct  >  1:883707/1‑62 (MQ=255) cAAGGTTGAACGTGCGGAAGCCGTTTGCAGCCAGGATGCAATGGATGACATCATCCTCGCct  >  1:956230/1‑62 (MQ=255) cAAGGTTGAACGTGCGGAAGCCGTTTGCAGCCAGGATGCAATGGATGACATCATCCTCGCct  >  1:1724522/1‑62 (MQ=255) cAAGGTTGAACGTGCGGAAGCCGTTTGCAGCCAGGATGCAATGGATGACATCATCCTCGCct  >  1:1206655/1‑62 (MQ=255) cAAGGTTGAACGTGCGGAAGCCGTTTGCAGCCAGGATGCAATGGATGACATCATCCTCGCct  >  1:1208609/1‑62 (MQ=255) cAAGGTTGAACGTGCGGAAGCCGTTTGCAGCCAGGATGCAATGGATGACATCATCCTCGCct  >  1:1272018/1‑62 (MQ=255) cAAGGTTGAACGTGCGGAAGCCGTTTGCAGCCAGGATGCAATGGATGACATCATCCTCGCct  >  1:1339675/1‑62 (MQ=255) cAAGGTTGAACGTGCGGAAGCCGTTTGCAGCCAGGATGCAATGGATGACATCATCCTCGCct  >  1:134420/1‑62 (MQ=255) cAAGGTTGAACGTGCGGAAGCCGTTTGCAGCCAGGATGCAATGGATGACATCATCCTCGCct  >  1:1395404/1‑62 (MQ=255) cAAGGTTGAACGTGCGGAAGCCGTTTGCAGCCAGGATGCAATGGATGACATCATCCTCGCct  >  1:1516733/1‑62 (MQ=255) cAAGGTTGAACGTGCGGAAGCCGTTTGCAGCCAGGATGCAATGGATGACATCATCCTCGCct  >  1:1574908/1‑62 (MQ=255) cAAGGTTGAACGTGCGGAAGCCGTTTGCAGCCAGGATGCAATGGATGACATCATCCTCGCct  >  1:1716945/1‑62 (MQ=255) cAAGGTTGAACGTGCGGAAGCCGTTTGCAGCCAGGATGCAATGGATGACATCATCCTCGCct  >  1:2269824/1‑62 (MQ=255) cAAGGTTGAACGTGCGGAAGCCGTTTGCAGCCAGGATGCAATGGATGACATCATCCTCGCct  >  1:1988162/1‑62 (MQ=255) cAAGGTTGAACGTGCGGAAGCCGTTTGCAGCCAGGATGCAATGGATGACATCATCCTCGCct  >  1:2024801/1‑62 (MQ=255) cAAGGTTGAACGTGCGGAAGCCGTTTGCAGCCAGGATGCAATGGATGACATCATCCTCGCct  >  1:2028910/1‑62 (MQ=255) cAAGGTTGAACGTGCGGAAGCCGTTTGCAGCCAGGATGCAATGGATGACATCATCCTCGCct  >  1:2037425/1‑62 (MQ=255) cAAGGTTGAACGTGCGGAAGCCGTTTGCAGCCAGGATGCAATGGATGACATCATCCTCGCct  >  1:2059748/1‑62 (MQ=255) cAAGGTTGAACGTGCGGAAGCCGTTTGCAGCCAGGATGCAATGGATGACATCATCCTCGCct  >  1:2064788/1‑62 (MQ=255) cAAGGTTGAACGTGCGGAAGCCGTTTGCAGCCAGGATGCAATGGATGACATCATCCTCGCct  >  1:2186970/1‑62 (MQ=255) cAAGGTTGAACGTGCGGAAGCCGTTTGCAGCCAGGATGCAATGGATGACATCATCCTCGCct  >  1:222114/1‑62 (MQ=255) cAAGGTTGAACGTGCGGAAGCCGTTTGCAGCCAGGATGCAATGGATGACATCATCCTCGCct  >  1:2248185/1‑62 (MQ=255) cAAGGTTGAACGTGCGGAAGCCGTTTGCAGCCAGGATGCAATGGATGACATCATCCTCGCct  >  1:2262898/1‑62 (MQ=255) cAAGGTTGAACGTGCGGAAGCCGTTTGCAGCCAGGATGCAATGGATGACATCATCCTCCCct  >  1:803439/1‑62 (MQ=255)                                                              | CAAGGTTGAACGTGCGGAAGCCGTTTGCAGCCAGGATGCAATGGATGACATCATCCTCGCCT  >  W3110S.gb/1940028‑1940089

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑