Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	1979890	1980068	179	27 [0]	[0] 24	[flhD]	[flhD]

TCCTGAACAATCAAACGCTGTGCAAGTAGTAAATATGACAAGTTGATGTCATAAATGTGTT  >  W3110S.gb/1979829‑1979889                                                             | tCCTGAACAATCAAACGCTGTGCAAGTAGTAAATATGACAAGTTGATGTCATAAATGTGtt  <  1:2146057/61‑1 (MQ=255) tCCTGAACAATCAAACGCTGTGCAAGTAGTAAATATGACAAGTTGATGTCATAAATGTGtt  <  1:992627/61‑1 (MQ=255) tCCTGAACAATCAAACGCTGTGCAAGTAGTAAATATGACAAGTTGATGTCATAAATGTGtt  <  1:888335/61‑1 (MQ=255) tCCTGAACAATCAAACGCTGTGCAAGTAGTAAATATGACAAGTTGATGTCATAAATGTGtt  <  1:863998/61‑1 (MQ=255) tCCTGAACAATCAAACGCTGTGCAAGTAGTAAATATGACAAGTTGATGTCATAAATGTGtt  <  1:811276/61‑1 (MQ=255) tCCTGAACAATCAAACGCTGTGCAAGTAGTAAATATGACAAGTTGATGTCATAAATGTGtt  <  1:808613/61‑1 (MQ=255) tCCTGAACAATCAAACGCTGTGCAAGTAGTAAATATGACAAGTTGATGTCATAAATGTGtt  <  1:760210/61‑1 (MQ=255) tCCTGAACAATCAAACGCTGTGCAAGTAGTAAATATGACAAGTTGATGTCATAAATGTGtt  <  1:6123/61‑1 (MQ=255) tCCTGAACAATCAAACGCTGTGCAAGTAGTAAATATGACAAGTTGATGTCATAAATGTGtt  <  1:576691/61‑1 (MQ=255) tCCTGAACAATCAAACGCTGTGCAAGTAGTAAATATGACAAGTTGATGTCATAAATGTGtt  <  1:46327/61‑1 (MQ=255) tCCTGAACAATCAAACGCTGTGCAAGTAGTAAATATGACAAGTTGATGTCATAAATGTGtt  <  1:453912/61‑1 (MQ=255) tCCTGAACAATCAAACGCTGTGCAAGTAGTAAATATGACAAGTTGATGTCATAAATGTGtt  <  1:2643844/61‑1 (MQ=255) tCCTGAACAATCAAACGCTGTGCAAGTAGTAAATATGACAAGTTGATGTCATAAATGTGtt  <  1:2506344/61‑1 (MQ=255) tCCTGAACAATCAAACGCTGTGCAAGTAGTAAATATGACAAGTTGATGTCATAAATGTGtt  <  1:1130958/61‑1 (MQ=255) tCCTGAACAATCAAACGCTGTGCAAGTAGTAAATATGACAAGTTGATGTCATAAATGTGtt  <  1:2037371/61‑1 (MQ=255) tCCTGAACAATCAAACGCTGTGCAAGTAGTAAATATGACAAGTTGATGTCATAAATGTGtt  <  1:1964408/61‑1 (MQ=255) tCCTGAACAATCAAACGCTGTGCAAGTAGTAAATATGACAAGTTGATGTCATAAATGTGtt  <  1:1910124/61‑1 (MQ=255) tCCTGAACAATCAAACGCTGTGCAAGTAGTAAATATGACAAGTTGATGTCATAAATGTGtt  <  1:1883444/61‑1 (MQ=255) tCCTGAACAATCAAACGCTGTGCAAGTAGTAAATATGACAAGTTGATGTCATAAATGTGtt  <  1:176988/61‑1 (MQ=255) tCCTGAACAATCAAACGCTGTGCAAGTAGTAAATATGACAAGTTGATGTCATAAATGTGtt  <  1:1706327/61‑1 (MQ=255) tCCTGAACAATCAAACGCTGTGCAAGTAGTAAATATGACAAGTTGATGTCATAAATGTGtt  <  1:1666526/61‑1 (MQ=255) tCCTGAACAATCAAACGCTGTGCAAGTAGTAAATATGACAAGTTGATGTCATAAATGTGtt  <  1:1605025/61‑1 (MQ=255) tCCTGAACAATCAAACGCTGTGCAAGTAGTAAATATGACAAGTTGATGTCATAAATGTGtt  <  1:158418/61‑1 (MQ=255) tCCTGAACAATCAAACGCTGTGCAAGTAGTAAATATGACAAGTTGATGTCATAAATGTGtt  <  1:1323247/61‑1 (MQ=255) tCCTGAACAATCAAACGCTGTGCAAGTAGTAAATATGACAAGTTGATGTCATAAATGTGtt  <  1:1196515/61‑1 (MQ=255)  ccTGAACAATCAAACGCTGTGCAAGTAGTAAATATGACAAGTTGATGTCATAAATGTGtt  <  1:1953122/60‑1 (MQ=255)                           tagtaAATATGACAAGTTGAGGTCATAAATGTGtt  <  1:70818/35‑1 (MQ=255)                                                             | TCCTGAACAATCAAACGCTGTGCAAGTAGTAAATATGACAAGTTGATGTCATAAATGTGTT  >  W3110S.gb/1979829‑1979889

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑