Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	1980145	1980146	2	9 [0]	[0] 9	flhD/insH	DNA‑binding transcriptional dual regulator with FlhC/IS5 element protein

ACACTTATCTAAGATTTTTCCTAAATCGACGCAACTGTACTCGTCACTACACGCACATACAA  >  W3110S.gb/1980083‑1980144                                                              | acacTTATCTAAGATTTTTCCTAAATCGACGCAACTGTACTCGTCACTACACGCACATACaa  >  1:1127051/1‑62 (MQ=255) acacTTATCTAAGATTTTTCCTAAATCGACGCAACTGTACTCGTCACTACACGCACATACaa  >  1:1151238/1‑62 (MQ=255) acacTTATCTAAGATTTTTCCTAAATCGACGCAACTGTACTCGTCACTACACGCACATACaa  >  1:1183479/1‑62 (MQ=255) acacTTATCTAAGATTTTTCCTAAATCGACGCAACTGTACTCGTCACTACACGCACATACaa  >  1:1560765/1‑62 (MQ=255) acacTTATCTAAGATTTTTCCTAAATCGACGCAACTGTACTCGTCACTACACGCACATACaa  >  1:1821638/1‑62 (MQ=255) acacTTATCTAAGATTTTTCCTAAATCGACGCAACTGTACTCGTCACTACACGCACATACaa  >  1:1940050/1‑62 (MQ=255) acacTTATCTAAGATTTTTCCTAAATCGACGCAACTGTACTCGTCACTACACGCACATACaa  >  1:2361265/1‑62 (MQ=255) acacTTATCTAAGATTTTTCCTAAATCGACGCAACTGTACTCGTCACTACACGCACATACaa  >  1:2830628/1‑62 (MQ=255) acacTTATCTAAGATTTTTCCTAAATCGACGCAACTGTACTCGTCACTACACGCACATACaa  >  1:685459/1‑62 (MQ=255)                                                              | ACACTTATCTAAGATTTTTCCTAAATCGACGCAACTGTACTCGTCACTACACGCACATACAA  >  W3110S.gb/1980083‑1980144

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑