Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	2015493	2015650	158	22 [0]	[0] 2	fliF	flagellar basal‑body MS‑ring and collar protein

ATTCCATTGATTGTTGCCGGTTCCGCGGCAGTGGCGGTCATGGTCGCACTGATCCTGTGGG  >  W3110S.gb/2015432‑2015492                                                             | aTTCCATTGATTGTTGCCGGTTCCGCGGCAGTGGCGGTCATGGTCGCACTGATCCTGTggg  >  1:328582/1‑61 (MQ=255) aTTCCATTGATTGTTGCCGGTTCCGCGGCAGTGGCGGTCATGGTCGCACTGATCCTGTggg  >  1:792769/1‑61 (MQ=255) aTTCCATTGATTGTTGCCGGTTCCGCGGCAGTGGCGGTCATGGTCGCACTGATCCTGTggg  >  1:76880/1‑61 (MQ=255) aTTCCATTGATTGTTGCCGGTTCCGCGGCAGTGGCGGTCATGGTCGCACTGATCCTGTggg  >  1:760418/1‑61 (MQ=255) aTTCCATTGATTGTTGCCGGTTCCGCGGCAGTGGCGGTCATGGTCGCACTGATCCTGTggg  >  1:729523/1‑61 (MQ=255) aTTCCATTGATTGTTGCCGGTTCCGCGGCAGTGGCGGTCATGGTCGCACTGATCCTGTggg  >  1:573788/1‑61 (MQ=255) aTTCCATTGATTGTTGCCGGTTCCGCGGCAGTGGCGGTCATGGTCGCACTGATCCTGTggg  >  1:409774/1‑61 (MQ=255) aTTCCATTGATTGTTGCCGGTTCCGCGGCAGTGGCGGTCATGGTCGCACTGATCCTGTggg  >  1:382903/1‑61 (MQ=255) aTTCCATTGATTGTTGCCGGTTCCGCGGCAGTGGCGGTCATGGTCGCACTGATCCTGTggg  >  1:35088/1‑61 (MQ=255) aTTCCATTGATTGTTGCCGGTTCCGCGGCAGTGGCGGTCATGGTCGCACTGATCCTGTggg  >  1:1145765/1‑61 (MQ=255) aTTCCATTGATTGTTGCCGGTTCCGCGGCAGTGGCGGTCATGGTCGCACTGATCCTGTggg  >  1:291792/1‑61 (MQ=255) aTTCCATTGATTGTTGCCGGTTCCGCGGCAGTGGCGGTCATGGTCGCACTGATCCTGTggg  >  1:222678/1‑61 (MQ=255) aTTCCATTGATTGTTGCCGGTTCCGCGGCAGTGGCGGTCATGGTCGCACTGATCCTGTggg  >  1:2206316/1‑61 (MQ=255) aTTCCATTGATTGTTGCCGGTTCCGCGGCAGTGGCGGTCATGGTCGCACTGATCCTGTggg  >  1:2013342/1‑61 (MQ=255) aTTCCATTGATTGTTGCCGGTTCCGCGGCAGTGGCGGTCATGGTCGCACTGATCCTGTggg  >  1:1682181/1‑61 (MQ=255) aTTCCATTGATTGTTGCCGGTTCCGCGGCAGTGGCGGTCATGGTCGCACTGATCCTGTggg  >  1:1515078/1‑61 (MQ=255) aTTCCATTGATTGTTGCCGGTTCCGCGGCAGTGGCGGTCATGGTCGCACTGATCCTGTggg  >  1:1401839/1‑61 (MQ=255) aTTCCATTGATTGTTGCCGGTTCCGCGGCAGTGGCGGTCATGGTCGCACTGATCCTGTggg  >  1:1381022/1‑61 (MQ=255) aTTCCATTGATTGTTGCCGGTTCCGCGGCAGTGGCGGTCATGGTCGCACTGATCCTGTggg  >  1:1231704/1‑61 (MQ=255) aTTCCATTGATTGTTGCCGGTTCCGCGGCAGTGGCGGTCATGGTCGCACTGATCCTGTggg  >  1:1179665/1‑61 (MQ=255) aTTCCATTGATTGTTGCCGGTTCCGCGGCAGTGGCGGTCATGGTCGCACTGATCCAGTggg  >  1:485160/1‑61 (MQ=255) aTTCCATTGATTGTTGCCGGTTCCGCGGCAGTGGCGGTCATGGTCGCACTGATCCAGTggg  >  1:488491/1‑61 (MQ=255)                                                             | ATTCCATTGATTGTTGCCGGTTCCGCGGCAGTGGCGGTCATGGTCGCACTGATCCTGTGGG  >  W3110S.gb/2015432‑2015492

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑