Missing coverage evidence...
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*	*	÷	W3110S.gb	2017162	2017273	112	47 [0]	[0] 8	fliG	flagellar motor switching and energizing component

CTCTCCCAGCGTGAAGTACAAACCCTGAGCGCTGCAATGGCGAACGTCACGCAGATCTCCA  >  W3110S.gb/2017101‑2017161                                                             | ctctCCCAGCGTGAAGTACAAACGCTGAGCGCTGCAATGGCGAACGTCACGCAGATCTCca  >  1:2210555/1‑61 (MQ=255) ctctCCCAGCGTGAAGTACAAACCCTGAGCGCTGCAATGGCGAACGTCACGCAGATCTCca  >  1:469723/1‑61 (MQ=255) ctctCCCAGCGTGAAGTACAAACCCTGAGCGCTGCAATGGCGAACGTCACGCAGATCTCca  >  1:2738214/1‑61 (MQ=255) ctctCCCAGCGTGAAGTACAAACCCTGAGCGCTGCAATGGCGAACGTCACGCAGATCTCca  >  1:2751460/1‑61 (MQ=255) ctctCCCAGCGTGAAGTACAAACCCTGAGCGCTGCAATGGCGAACGTCACGCAGATCTCca  >  1:279723/1‑61 (MQ=255) ctctCCCAGCGTGAAGTACAAACCCTGAGCGCTGCAATGGCGAACGTCACGCAGATCTCca  >  1:2818424/1‑61 (MQ=255) ctctCCCAGCGTGAAGTACAAACCCTGAGCGCTGCAATGGCGAACGTCACGCAGATCTCca  >  1:2872252/1‑61 (MQ=255) ctctCCCAGCGTGAAGTACAAACCCTGAGCGCTGCAATGGCGAACGTCACGCAGATCTCca  >  1:297367/1‑61 (MQ=255) ctctCCCAGCGTGAAGTACAAACCCTGAGCGCTGCAATGGCGAACGTCACGCAGATCTCca  >  1:30831/1‑61 (MQ=255) ctctCCCAGCGTGAAGTACAAACCCTGAGCGCTGCAATGGCGAACGTCACGCAGATCTCca  >  1:376194/1‑61 (MQ=255) ctctCCCAGCGTGAAGTACAAACCCTGAGCGCTGCAATGGCGAACGTCACGCAGATCTCca  >  1:39527/1‑61 (MQ=255) ctctCCCAGCGTGAAGTACAAACCCTGAGCGCTGCAATGGCGAACGTCACGCAGATCTCca  >  1:414233/1‑61 (MQ=255) ctctCCCAGCGTGAAGTACAAACCCTGAGCGCTGCAATGGCGAACGTCACGCAGATCTCca  >  1:258673/1‑61 (MQ=255) ctctCCCAGCGTGAAGTACAAACCCTGAGCGCTGCAATGGCGAACGTCACGCAGATCTCca  >  1:481325/1‑61 (MQ=255) ctctCCCAGCGTGAAGTACAAACCCTGAGCGCTGCAATGGCGAACGTCACGCAGATCTCca  >  1:496962/1‑61 (MQ=255) ctctCCCAGCGTGAAGTACAAACCCTGAGCGCTGCAATGGCGAACGTCACGCAGATCTCca  >  1:548729/1‑61 (MQ=255) ctctCCCAGCGTGAAGTACAAACCCTGAGCGCTGCAATGGCGAACGTCACGCAGATCTCca  >  1:56364/1‑61 (MQ=255) ctctCCCAGCGTGAAGTACAAACCCTGAGCGCTGCAATGGCGAACGTCACGCAGATCTCca  >  1:599156/1‑61 (MQ=255) ctctCCCAGCGTGAAGTACAAACCCTGAGCGCTGCAATGGCGAACGTCACGCAGATCTCca  >  1:650717/1‑61 (MQ=255) ctctCCCAGCGTGAAGTACAAACCCTGAGCGCTGCAATGGCGAACGTCACGCAGATCTCca  >  1:714320/1‑61 (MQ=255) ctctCCCAGCGTGAAGTACAAACCCTGAGCGCTGCAATGGCGAACGTCACGCAGATCTCca  >  1:733172/1‑61 (MQ=255) ctctCCCAGCGTGAAGTACAAACCCTGAGCGCTGCAATGGCGAACGTCACGCAGATCTCca  >  1:935408/1‑61 (MQ=255) ctctCCCAGCGTGAAGTACAAACCCTGAGCGCTGCAATGGCGAACGTCACGCAGATCTCca  >  1:983252/1‑61 (MQ=255) ctctCCCAGCGTGAAGTACAAACCCTGAGCGCTGCAATGGCGAACGTCACGCAGATCTCca  >  1:98525/1‑61 (MQ=255) ctctCCCAGCGTGAAGTACAAACCCTGAGCGCTGCAATGGCGAACGTCACGCAGATCTCca  >  1:1836577/1‑61 (MQ=255) ctctCCCAGCGTGAAGTACAAACCCTGAGCGCTGCAATGGCGAACGTCACGCAGATCTCca  >  1:1091873/1‑61 (MQ=255) ctctCCCAGCGTGAAGTACAAACCCTGAGCGCTGCAATGGCGAACGTCACGCAGATCTCca  >  1:1168249/1‑61 (MQ=255) ctctCCCAGCGTGAAGTACAAACCCTGAGCGCTGCAATGGCGAACGTCACGCAGATCTCca  >  1:1256353/1‑61 (MQ=255) ctctCCCAGCGTGAAGTACAAACCCTGAGCGCTGCAATGGCGAACGTCACGCAGATCTCca  >  1:1421395/1‑61 (MQ=255) ctctCCCAGCGTGAAGTACAAACCCTGAGCGCTGCAATGGCGAACGTCACGCAGATCTCca  >  1:1458819/1‑61 (MQ=255) ctctCCCAGCGTGAAGTACAAACCCTGAGCGCTGCAATGGCGAACGTCACGCAGATCTCca  >  1:1490884/1‑61 (MQ=255) ctctCCCAGCGTGAAGTACAAACCCTGAGCGCTGCAATGGCGAACGTCACGCAGATCTCca  >  1:1492821/1‑61 (MQ=255) ctctCCCAGCGTGAAGTACAAACCCTGAGCGCTGCAATGGCGAACGTCACGCAGATCTCca  >  1:1496053/1‑61 (MQ=255) ctctCCCAGCGTGAAGTACAAACCCTGAGCGCTGCAATGGCGAACGTCACGCAGATCTCca  >  1:164776/1‑61 (MQ=255) ctctCCCAGCGTGAAGTACAAACCCTGAGCGCTGCAATGGCGAACGTCACGCAGATCTCca  >  1:1662752/1‑61 (MQ=255) ctctCCCAGCGTGAAGTACAAACCCTGAGCGCTGCAATGGCGAACGTCACGCAGATCTCca  >  1:2670922/1‑61 (MQ=255) ctctCCCAGCGTGAAGTACAAACCCTGAGCGCTGCAATGGCGAACGTCACGCAGATCTCca  >  1:1927169/1‑61 (MQ=255) ctctCCCAGCGTGAAGTACAAACCCTGAGCGCTGCAATGGCGAACGTCACGCAGATCTCca  >  1:1940051/1‑61 (MQ=255) ctctCCCAGCGTGAAGTACAAACCCTGAGCGCTGCAATGGCGAACGTCACGCAGATCTCca  >  1:1950649/1‑61 (MQ=255) ctctCCCAGCGTGAAGTACAAACCCTGAGCGCTGCAATGGCGAACGTCACGCAGATCTCca  >  1:2076736/1‑61 (MQ=255) ctctCCCAGCGTGAAGTACAAACCCTGAGCGCTGCAATGGCGAACGTCACGCAGATCTCca  >  1:2108110/1‑61 (MQ=255) ctctCCCAGCGTGAAGTACAAACCCTGAGCGCTGCAATGGCGAACGTCACGCAGATCTCca  >  1:2109803/1‑61 (MQ=255) ctctCCCAGCGTGAAGTACAAACCCTGAGCGCTGCAATGGCGAACGTCACGCAGATCTCca  >  1:2163770/1‑61 (MQ=255) ctctCCCAGCGTGAAGTACAAACCCTGAGCGCTGCAATGGCGAACGTCACGCAGATCTCca  >  1:2473156/1‑61 (MQ=255) ctctCCCAGCGTGAAGTACAAACCCTGAGCGCTGCAATGGCGAACGTCACGCAGATCTCca  >  1:254067/1‑61 (MQ=255) ctctCCCAGCGTGAAGTACAAACCCTGAGCGCTGCAATGGCGAACGTCACGCAGATCTCca  >  1:1063265/1‑61 (MQ=255) ctctCCCAGCGTGAAGTACAAACCCTGAGAGCTGCAATGGCGAACGTCACGCAGATCTCca  >  1:1164747/1‑61 (MQ=255)                                                             | CTCTCCCAGCGTGAAGTACAAACCCTGAGCGCTGCAATGGCGAACGTCACGCAGATCTCCA  >  W3110S.gb/2017101‑2017161

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑