Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	2021710	2021737	28	29 [0]	[0] 19	fliK/fliL	flagellar hook‑length control protein/flagellar biosynthesis protein

AACGTCAGAGGTAGCACCGTAATCCGCGTCTTTTCCCCGCTTTGTTGCGCTCAAGACGCAG  >  W3110S.gb/2021649‑2021709                                                             | aaCGTCAGAGGTAGCACCGTAATCCGCGTCTTTTCCCCGCTTTGTTGCGCTCAAGACGCAg  >  1:2587016/1‑61 (MQ=255) aaCGTCAGAGGTAGCACCGTAATCCGCGTCTTTTCCCCGCTTTGTTGCGCTCAAGACGCAg  >  1:816250/1‑61 (MQ=255) aaCGTCAGAGGTAGCACCGTAATCCGCGTCTTTTCCCCGCTTTGTTGCGCTCAAGACGCAg  >  1:775468/1‑61 (MQ=255) aaCGTCAGAGGTAGCACCGTAATCCGCGTCTTTTCCCCGCTTTGTTGCGCTCAAGACGCAg  >  1:732940/1‑61 (MQ=255) aaCGTCAGAGGTAGCACCGTAATCCGCGTCTTTTCCCCGCTTTGTTGCGCTCAAGACGCAg  >  1:577832/1‑61 (MQ=255) aaCGTCAGAGGTAGCACCGTAATCCGCGTCTTTTCCCCGCTTTGTTGCGCTCAAGACGCAg  >  1:504557/1‑61 (MQ=255) aaCGTCAGAGGTAGCACCGTAATCCGCGTCTTTTCCCCGCTTTGTTGCGCTCAAGACGCAg  >  1:454522/1‑61 (MQ=255) aaCGTCAGAGGTAGCACCGTAATCCGCGTCTTTTCCCCGCTTTGTTGCGCTCAAGACGCAg  >  1:392573/1‑61 (MQ=255) aaCGTCAGAGGTAGCACCGTAATCCGCGTCTTTTCCCCGCTTTGTTGCGCTCAAGACGCAg  >  1:2927451/1‑61 (MQ=255) aaCGTCAGAGGTAGCACCGTAATCCGCGTCTTTTCCCCGCTTTGTTGCGCTCAAGACGCAg  >  1:2865165/1‑61 (MQ=255) aaCGTCAGAGGTAGCACCGTAATCCGCGTCTTTTCCCCGCTTTGTTGCGCTCAAGACGCAg  >  1:2804329/1‑61 (MQ=255) aaCGTCAGAGGTAGCACCGTAATCCGCGTCTTTTCCCCGCTTTGTTGCGCTCAAGACGCAg  >  1:2803316/1‑61 (MQ=255) aaCGTCAGAGGTAGCACCGTAATCCGCGTCTTTTCCCCGCTTTGTTGCGCTCAAGACGCAg  >  1:2668699/1‑61 (MQ=255) aaCGTCAGAGGTAGCACCGTAATCCGCGTCTTTTCCCCGCTTTGTTGCGCTCAAGACGCAg  >  1:2641942/1‑61 (MQ=255) aaCGTCAGAGGTAGCACCGTAATCCGCGTCTTTTCCCCGCTTTGTTGCGCTCAAGACGCAg  >  1:1061464/1‑61 (MQ=255) aaCGTCAGAGGTAGCACCGTAATCCGCGTCTTTTCCCCGCTTTGTTGCGCTCAAGACGCAg  >  1:246998/1‑61 (MQ=255) aaCGTCAGAGGTAGCACCGTAATCCGCGTCTTTTCCCCGCTTTGTTGCGCTCAAGACGCAg  >  1:2293859/1‑61 (MQ=255) aaCGTCAGAGGTAGCACCGTAATCCGCGTCTTTTCCCCGCTTTGTTGCGCTCAAGACGCAg  >  1:2109170/1‑61 (MQ=255) aaCGTCAGAGGTAGCACCGTAATCCGCGTCTTTTCCCCGCTTTGTTGCGCTCAAGACGCAg  >  1:2073728/1‑61 (MQ=255) aaCGTCAGAGGTAGCACCGTAATCCGCGTCTTTTCCCCGCTTTGTTGCGCTCAAGACGCAg  >  1:1962363/1‑61 (MQ=255) aaCGTCAGAGGTAGCACCGTAATCCGCGTCTTTTCCCCGCTTTGTTGCGCTCAAGACGCAg  >  1:1660503/1‑61 (MQ=255) aaCGTCAGAGGTAGCACCGTAATCCGCGTCTTTTCCCCGCTTTGTTGCGCTCAAGACGCAg  >  1:1637420/1‑61 (MQ=255) aaCGTCAGAGGTAGCACCGTAATCCGCGTCTTTTCCCCGCTTTGTTGCGCTCAAGACGCAg  >  1:160204/1‑61 (MQ=255) aaCGTCAGAGGTAGCACCGTAATCCGCGTCTTTTCCCCGCTTTGTTGCGCTCAAGACGCAg  >  1:1465524/1‑61 (MQ=255) aaCGTCAGAGGTAGCACCGTAATCCGCGTCTTTTCCCCGCTTTGTTGCGCTCAAGACGCAg  >  1:1206365/1‑61 (MQ=255) aaCGTCAGAGGTAGCACCGTAATCCGCGTCTTTTCCCCGCTTTGTTGCGCTCAAGACGCAg  >  1:1108285/1‑61 (MQ=255) aaCGTCAGAGGTAGCACCGTAATCCGCGTCTTTTCCCCGCTTTGTTGCGCTCAAGACGCAg  >  1:1096863/1‑61 (MQ=255) aaCGTCAGAGGTAGCACCGTAATCCGCGTCTTTTCCCCGCTTTGTTGCGCTCAAGACGCAg  >  1:1066875/1‑61 (MQ=255) aaCGTCAGAGGTAGCACCGTAATACGCGTCTTTTCCCCGCTTTGTTGCGCTCAAGACGCAg  >  1:2744750/1‑61 (MQ=255)                                                             | AACGTCAGAGGTAGCACCGTAATCCGCGTCTTTTCCCCGCTTTGTTGCGCTCAAGACGCAG  >  W3110S.gb/2021649‑2021709

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑