Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	2023283	2023347	65	51 [0]	[0] 13	fliN	flagellar motor switching and energizing component

TGAGTGACATGAATAATCCGGCCGATGACAACAACGGCGCAATGGACGATCTGTGGG  >  W3110S.gb/2023226‑2023282                                                         | tGAGTGACATGAATAATCCGGCCGATGACAACAACGGCGCATTGGACGATCTGTggg  <  1:648481/57‑1 (MQ=255) tGAGTGACATGAATAATCCGGCCGATGACAACAACGGCGCAATGGACGATCTGTggg  <  1:392731/57‑1 (MQ=255) tGAGTGACATGAATAATCCGGCCGATGACAACAACGGCGCAATGGACGATCTGTggg  <  1:2605298/57‑1 (MQ=255) tGAGTGACATGAATAATCCGGCCGATGACAACAACGGCGCAATGGACGATCTGTggg  <  1:2610658/57‑1 (MQ=255) tGAGTGACATGAATAATCCGGCCGATGACAACAACGGCGCAATGGACGATCTGTggg  <  1:2627354/57‑1 (MQ=255) tGAGTGACATGAATAATCCGGCCGATGACAACAACGGCGCAATGGACGATCTGTggg  <  1:2627771/57‑1 (MQ=255) tGAGTGACATGAATAATCCGGCCGATGACAACAACGGCGCAATGGACGATCTGTggg  <  1:2721044/57‑1 (MQ=255) tGAGTGACATGAATAATCCGGCCGATGACAACAACGGCGCAATGGACGATCTGTggg  <  1:2748949/57‑1 (MQ=255) tGAGTGACATGAATAATCCGGCCGATGACAACAACGGCGCAATGGACGATCTGTggg  <  1:2788755/57‑1 (MQ=255) tGAGTGACATGAATAATCCGGCCGATGACAACAACGGCGCAATGGACGATCTGTggg  <  1:2805832/57‑1 (MQ=255) tGAGTGACATGAATAATCCGGCCGATGACAACAACGGCGCAATGGACGATCTGTggg  <  1:2873077/57‑1 (MQ=255) tGAGTGACATGAATAATCCGGCCGATGACAACAACGGCGCAATGGACGATCTGTggg  <  1:2881163/57‑1 (MQ=255) tGAGTGACATGAATAATCCGGCCGATGACAACAACGGCGCAATGGACGATCTGTggg  <  1:332521/57‑1 (MQ=255) tGAGTGACATGAATAATCCGGCCGATGACAACAACGGCGCAATGGACGATCTGTggg  <  1:371512/57‑1 (MQ=255) tGAGTGACATGAATAATCCGGCCGATGACAACAACGGCGCAATGGACGATCTGTggg  <  1:2604877/57‑1 (MQ=255) tGAGTGACATGAATAATCCGGCCGATGACAACAACGGCGCAATGGACGATCTGTggg  <  1:43071/57‑1 (MQ=255) tGAGTGACATGAATAATCCGGCCGATGACAACAACGGCGCAATGGACGATCTGTggg  <  1:507858/57‑1 (MQ=255) tGAGTGACATGAATAATCCGGCCGATGACAACAACGGCGCAATGGACGATCTGTggg  <  1:535536/57‑1 (MQ=255) tGAGTGACATGAATAATCCGGCCGATGACAACAACGGCGCAATGGACGATCTGTggg  <  1:562912/57‑1 (MQ=255) tGAGTGACATGAATAATCCGGCCGATGACAACAACGGCGCAATGGACGATCTGTggg  <  1:574912/57‑1 (MQ=255) tGAGTGACATGAATAATCCGGCCGATGACAACAACGGCGCAATGGACGATCTGTggg  <  1:668687/57‑1 (MQ=255) tGAGTGACATGAATAATCCGGCCGATGACAACAACGGCGCAATGGACGATCTGTggg  <  1:762128/57‑1 (MQ=255) tGAGTGACATGAATAATCCGGCCGATGACAACAACGGCGCAATGGACGATCTGTggg  <  1:851095/57‑1 (MQ=255) tGAGTGACATGAATAATCCGGCCGATGACAACAACGGCGCAATGGACGATCTGTggg  <  1:987649/57‑1 (MQ=255) tGAGTGACATGAATAATCCGGCCGATGACAACAACGGCGCAATGGACGATCTGTggg  <  1:988789/57‑1 (MQ=255) tGAGTGACATGAATAATCCGGCCGATGACAACAACGGCGCAATGGACGATCTGTggg  <  1:2476105/57‑1 (MQ=255) tGAGTGACATGAATAATCCGGCCGATGACAACAACGGCGCAATGGACGATCTGTggg  <  1:1073111/57‑1 (MQ=255) tGAGTGACATGAATAATCCGGCCGATGACAACAACGGCGCAATGGACGATCTGTggg  <  1:1252559/57‑1 (MQ=255) tGAGTGACATGAATAATCCGGCCGATGACAACAACGGCGCAATGGACGATCTGTggg  <  1:1269598/57‑1 (MQ=255) tGAGTGACATGAATAATCCGGCCGATGACAACAACGGCGCAATGGACGATCTGTggg  <  1:1272565/57‑1 (MQ=255) tGAGTGACATGAATAATCCGGCCGATGACAACAACGGCGCAATGGACGATCTGTggg  <  1:1350355/57‑1 (MQ=255) tGAGTGACATGAATAATCCGGCCGATGACAACAACGGCGCAATGGACGATCTGTggg  <  1:1416768/57‑1 (MQ=255) tGAGTGACATGAATAATCCGGCCGATGACAACAACGGCGCAATGGACGATCTGTggg  <  1:1421401/57‑1 (MQ=255) tGAGTGACATGAATAATCCGGCCGATGACAACAACGGCGCAATGGACGATCTGTggg  <  1:1548533/57‑1 (MQ=255) tGAGTGACATGAATAATCCGGCCGATGACAACAACGGCGCAATGGACGATCTGTggg  <  1:1621888/57‑1 (MQ=255) tGAGTGACATGAATAATCCGGCCGATGACAACAACGGCGCAATGGACGATCTGTggg  <  1:1624961/57‑1 (MQ=255) tGAGTGACATGAATAATCCGGCCGATGACAACAACGGCGCAATGGACGATCTGTggg  <  1:1652609/57‑1 (MQ=255) tGAGTGACATGAATAATCCGGCCGATGACAACAACGGCGCAATGGACGATCTGTggg  <  1:1736651/57‑1 (MQ=255) tGAGTGACATGAATAATCCGGCCGATGACAACAACGGCGCAATGGACGATCTGTggg  <  1:1742213/57‑1 (MQ=255) tGAGTGACATGAATAATCCGGCCGATGACAACAACGGCGCAATGGACGATCTGTggg  <  1:178871/57‑1 (MQ=255) tGAGTGACATGAATAATCCGGCCGATGACAACAACGGCGCAATGGACGATCTGTggg  <  1:179094/57‑1 (MQ=255) tGAGTGACATGAATAATCCGGCCGATGACAACAACGGCGCAATGGACGATCTGTggg  <  1:1927336/57‑1 (MQ=255) tGAGTGACATGAATAATCCGGCCGATGACAACAACGGCGCAATGGACGATCTGTggg  <  1:1963883/57‑1 (MQ=255) tGAGTGACATGAATAATCCGGCCGATGACAACAACGGCGCAATGGACGATCTGTggg  <  1:2120922/57‑1 (MQ=255) tGAGTGACATGAATAATCCGGCCGATGACAACAACGGCGCAATGGACGATCTGTggg  <  1:2249725/57‑1 (MQ=255) tGAGTGACATGAATAATCCGGCCGATGACAACAACGGCGCAATGGACGATCTGTggg  <  1:2263160/57‑1 (MQ=255) tGAGTGACATGAATAATCCGGCCGATGACAACAACGGCGCAATGGACGATCTGTggg  <  1:241465/57‑1 (MQ=255) tGAGTGACATGAATAATCCGGCCGATGACAACAACGGCGCAATGGACGATCTGTggg  <  1:1003188/57‑1 (MQ=255)  gAGTGTCATGAATAATCCGGCCGATGACAACAACGGCGCAATGGACGATCTGTggg  <  1:88562/56‑1 (MQ=255)          tGAATAATCCGGCCGATGACAACAACGGCGCAATGGACGATCTGTggg  <  1:1004589/48‑1 (MQ=255)                      ccGAAGACAACAACGGCGCAATGGACGATCTGTggg  <  1:1207982/36‑1 (MQ=255)                                                         | TGAGTGACATGAATAATCCGGCCGATGACAACAACGGCGCAATGGACGATCTGTGGG  >  W3110S.gb/2023226‑2023282

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑