Missing coverage evidence...
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*	*	÷	W3110S.gb	2074547	2074674	128	23 [0]	[0] 29	flu	antigen 43 (Ag43) phase‑variable biofilm formation autotransporter

ACAGTGACGGCTGGCAGATTGTCAAAAACGGGGGTGTGGCCGGGAATACCACCGTTAATC  >  W3110S.gb/2074487‑2074546                                                            | aCAGTGACGGCTGGCAGATTGTCAAAAACGGGGGTGTGGGCGGGAATACCACCGTTAATc  >  1:2875575/1‑60 (MQ=255) aCAGTGACGGCTGGCAGATTGTCAAAAACGGGGGTGTGGCCGGGAATACCACCGTTAATc  >  1:2690501/1‑60 (MQ=255) aCAGTGACGGCTGGCAGATTGTCAAAAACGGGGGTGTGGCCGGGAATACCACCGTTAATc  >  1:931266/1‑60 (MQ=255) aCAGTGACGGCTGGCAGATTGTCAAAAACGGGGGTGTGGCCGGGAATACCACCGTTAATc  >  1:877130/1‑60 (MQ=255) aCAGTGACGGCTGGCAGATTGTCAAAAACGGGGGTGTGGCCGGGAATACCACCGTTAATc  >  1:699234/1‑60 (MQ=255) aCAGTGACGGCTGGCAGATTGTCAAAAACGGGGGTGTGGCCGGGAATACCACCGTTAATc  >  1:691256/1‑60 (MQ=255) aCAGTGACGGCTGGCAGATTGTCAAAAACGGGGGTGTGGCCGGGAATACCACCGTTAATc  >  1:659244/1‑60 (MQ=255) aCAGTGACGGCTGGCAGATTGTCAAAAACGGGGGTGTGGCCGGGAATACCACCGTTAATc  >  1:499784/1‑60 (MQ=255) aCAGTGACGGCTGGCAGATTGTCAAAAACGGGGGTGTGGCCGGGAATACCACCGTTAATc  >  1:424753/1‑60 (MQ=255) aCAGTGACGGCTGGCAGATTGTCAAAAACGGGGGTGTGGCCGGGAATACCACCGTTAATc  >  1:2834450/1‑60 (MQ=255) aCAGTGACGGCTGGCAGATTGTCAAAAACGGGGGTGTGGCCGGGAATACCACCGTTAATc  >  1:2714130/1‑60 (MQ=255) aCAGTGACGGCTGGCAGATTGTCAAAAACGGGGGTGTGGCCGGGAATACCACCGTTAATc  >  1:2705944/1‑60 (MQ=255) aCAGTGACGGCTGGCAGATTGTCAAAAACGGGGGTGTGGCCGGGAATACCACCGTTAATc  >  1:1504427/1‑60 (MQ=255) aCAGTGACGGCTGGCAGATTGTCAAAAACGGGGGTGTGGCCGGGAATACCACCGTTAATc  >  1:2343889/1‑60 (MQ=255) aCAGTGACGGCTGGCAGATTGTCAAAAACGGGGGTGTGGCCGGGAATACCACCGTTAATc  >  1:2324604/1‑60 (MQ=255) aCAGTGACGGCTGGCAGATTGTCAAAAACGGGGGTGTGGCCGGGAATACCACCGTTAATc  >  1:2309256/1‑60 (MQ=255) aCAGTGACGGCTGGCAGATTGTCAAAAACGGGGGTGTGGCCGGGAATACCACCGTTAATc  >  1:2221657/1‑60 (MQ=255) aCAGTGACGGCTGGCAGATTGTCAAAAACGGGGGTGTGGCCGGGAATACCACCGTTAATc  >  1:2217345/1‑60 (MQ=255) aCAGTGACGGCTGGCAGATTGTCAAAAACGGGGGTGTGGCCGGGAATACCACCGTTAATc  >  1:2143682/1‑60 (MQ=255) aCAGTGACGGCTGGCAGATTGTCAAAAACGGGGGTGTGGCCGGGAATACCACCGTTAATc  >  1:2088873/1‑60 (MQ=255) aCAGTGACGGCTGGCAGATTGTCAAAAACGGGGGTGTGGCCGGGAATACCACCGTTAATc  >  1:1972127/1‑60 (MQ=255) aCAGTGACGGCTGGCAGATTGTCAAAAACGGGGGTGTGGCCGGGAATACCACCGTTAATc  >  1:173638/1‑60 (MQ=255) aCAGTGACGGCTGGCAGATTGTCAAAAACGGGGGTGTGGCCGGGAATACCACCGTTAATc  >  1:1510251/1‑60 (MQ=255)                                                            | ACAGTGACGGCTGGCAGATTGTCAAAAACGGGGGTGTGGCCGGGAATACCACCGTTAATC  >  W3110S.gb/2074487‑2074546

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑