Missing coverage evidence...
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ATGATAACGACATGCTGCAATGAGCAGTGAATCGTCGGTAACCGCGTATACCAGACGGTGCT  >  W3110S.gb/2091354‑2091415                                                              | atGATAACGACATGCTGCAATGAGCAGTGAATCGTCGGTAACCGTGTATACCAGACGGTGct  <  1:1777395/62‑1 (MQ=255) atGATAACGACATGCTGCAATGAGCAGTGAATCGTCGGTAACCGCGTATACCAGACGGTGct  <  1:79094/62‑1 (MQ=255) atGATAACGACATGCTGCAATGAGCAGTGAATCGTCGGTAACCGCGTATACCAGACGGTGct  <  1:2611941/62‑1 (MQ=255) atGATAACGACATGCTGCAATGAGCAGTGAATCGTCGGTAACCGCGTATACCAGACGGTGct  <  1:2691079/62‑1 (MQ=255) atGATAACGACATGCTGCAATGAGCAGTGAATCGTCGGTAACCGCGTATACCAGACGGTGct  <  1:2723516/62‑1 (MQ=255) atGATAACGACATGCTGCAATGAGCAGTGAATCGTCGGTAACCGCGTATACCAGACGGTGct  <  1:2759997/62‑1 (MQ=255) atGATAACGACATGCTGCAATGAGCAGTGAATCGTCGGTAACCGCGTATACCAGACGGTGct  <  1:360523/62‑1 (MQ=255) atGATAACGACATGCTGCAATGAGCAGTGAATCGTCGGTAACCGCGTATACCAGACGGTGct  <  1:386481/62‑1 (MQ=255) atGATAACGACATGCTGCAATGAGCAGTGAATCGTCGGTAACCGCGTATACCAGACGGTGct  <  1:424837/62‑1 (MQ=255) atGATAACGACATGCTGCAATGAGCAGTGAATCGTCGGTAACCGCGTATACCAGACGGTGct  <  1:76500/62‑1 (MQ=255) atGATAACGACATGCTGCAATGAGCAGTGAATCGTCGGTAACCGCGTATACCAGACGGTGct  <  1:2170671/62‑1 (MQ=255) atGATAACGACATGCTGCAATGAGCAGTGAATCGTCGGTAACCGCGTATACCAGACGGTGct  <  1:843810/62‑1 (MQ=255) atGATAACGACATGCTGCAATGAGCAGTGAATCGTCGGTAACCGCGTATACCAGACGGTGct  <  1:881024/62‑1 (MQ=255) atGATAACGACATGCTGCAATGAGCAGTGAATCGTCGGTAACCGCGTATACCAGACGGTGct  <  1:889743/62‑1 (MQ=255) atGATAACGACATGCTGCAATGAGCAGTGAATCGTCGGTAACCGCGTATACCAGACGGTGct  <  1:946683/62‑1 (MQ=255) atGATAACGACATGCTGCAATGAGCAGTGAATCGTCGGTAACCGCGTATACCAGACGGTGct  <  1:965354/62‑1 (MQ=255) atGATAACGACATGCTGCAATGAGCAGTGAATCGTCGGTAACCGCGTATACCAGACGGTGct  <  1:983808/62‑1 (MQ=255) atGATAACGACATGCTGCAATGAGCAGTGAATCGTCGGTAACCGCGTATACCAGACGGTGct  <  1:2145255/62‑1 (MQ=255) atGATAACGACATGCTGCAATGAGCAGTGAATCGTCGGTAACCGCGTATACCAGACGGTGct  <  1:1232662/62‑1 (MQ=255) atGATAACGACATGCTGCAATGAGCAGTGAATCGTCGGTAACCGCGTATACCAGACGGTGct  <  1:1311535/62‑1 (MQ=255) atGATAACGACATGCTGCAATGAGCAGTGAATCGTCGGTAACCGCGTATACCAGACGGTGct  <  1:1447194/62‑1 (MQ=255) atGATAACGACATGCTGCAATGAGCAGTGAATCGTCGGTAACCGCGTATACCAGACGGTGct  <  1:1487842/62‑1 (MQ=255) atGATAACGACATGCTGCAATGAGCAGTGAATCGTCGGTAACCGCGTATACCAGACGGTGct  <  1:1617623/62‑1 (MQ=255) atGATAACGACATGCTGCAATGAGCAGTGAATCGTCGGTAACCGCGTATACCAGACGGTGct  <  1:1726076/62‑1 (MQ=255) atGATAACGACATGCTGCAATGAGCAGTGAATCGTCGGTAACCGCGTATACCAGACGGTGct  <  1:1845116/62‑1 (MQ=255) atGATAACGACATGCTGCAATGAGCAGTGAATCGTCGGTAACCGCGTATACCAGACGGTGct  <  1:1904623/62‑1 (MQ=255) atGATAACGACATGCTGCAATGAGCAGTGAATCGTCGGTAACCGCGTATACCAGACGGTGct  <  1:2059332/62‑1 (MQ=255) atGATAACGACATGCTGCAATGAGCAGTGAATCGTCGGTAACCGCGTATACCAGACGGTGct  <  1:2063234/62‑1 (MQ=255) atGATAACGACATGCTGCAATGAGCAGTGAATCGTCGGTAACCGCGTATACCAGACGGTGct  <  1:2124130/62‑1 (MQ=255)  tGATAACGACATGCTGCAATGAGCAGTGAATCGTCGGTAACCGCGTATACCAGACGGTGct  <  1:89096/61‑1 (MQ=255)   gATAACGACATGCTGCAATGAGCAGTGAATCGTCGGTAACCGCGTATACCAGACGGTGct  <  1:1191707/60‑1 (MQ=255)        cGACATGCTGCAATGAGCAGTGAATCGTCGGTAACCGCGTATACCAGACGGTGct  <  1:1877033/55‑1 (MQ=255)             tgctgcAATGAGCAGTGAATCGTCGGTAACCGCGTATACCAGACGGTGct  <  1:2079134/50‑1 (MQ=255)                        gCAGTGAATCGTCGGTAACCGCGTATACCAGACGGTGct  <  1:2025897/39‑1 (MQ=255)                                                              | ATGATAACGACATGCTGCAATGAGCAGTGAATCGTCGGTAACCGCGTATACCAGACGGTGCT  >  W3110S.gb/2091354‑2091415

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑