Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	2108264	2108279	16	23 [0]	[0] 5	wbbH	O‑antigen polymerase

TTATTTTCTGGGCCTTAAGAAATTGAGAGAATACTATGATACAAAGAGTTATTTGTATCCAA  >  W3110S.gb/2108202‑2108263                                                              | ttATTTTCTGTGCCTTAAGAAATTGAGAGAATACTATGATACAAAGAGTTATTTGTATCCaa  <  1:737648/62‑1 (MQ=255) ttATTTTCTGGGCCTTAAGAAATTGAGAGAATACTATGATACAAAGAGTTATTTGTATCCaa  <  1:1262607/62‑1 (MQ=255) ttATTTTCTGGGCCTTAAGAAATTGAGAGAATACTATGATACAAAGAGTTATTTGTATCCaa  <  1:846637/62‑1 (MQ=255) ttATTTTCTGGGCCTTAAGAAATTGAGAGAATACTATGATACAAAGAGTTATTTGTATCCaa  <  1:817126/62‑1 (MQ=255) ttATTTTCTGGGCCTTAAGAAATTGAGAGAATACTATGATACAAAGAGTTATTTGTATCCaa  <  1:747190/62‑1 (MQ=255) ttATTTTCTGGGCCTTAAGAAATTGAGAGAATACTATGATACAAAGAGTTATTTGTATCCaa  <  1:728738/62‑1 (MQ=255) ttATTTTCTGGGCCTTAAGAAATTGAGAGAATACTATGATACAAAGAGTTATTTGTATCCaa  <  1:569372/62‑1 (MQ=255) ttATTTTCTGGGCCTTAAGAAATTGAGAGAATACTATGATACAAAGAGTTATTTGTATCCaa  <  1:53754/62‑1 (MQ=255) ttATTTTCTGGGCCTTAAGAAATTGAGAGAATACTATGATACAAAGAGTTATTTGTATCCaa  <  1:35254/62‑1 (MQ=255) ttATTTTCTGGGCCTTAAGAAATTGAGAGAATACTATGATACAAAGAGTTATTTGTATCCaa  <  1:2663227/62‑1 (MQ=255) ttATTTTCTGGGCCTTAAGAAATTGAGAGAATACTATGATACAAAGAGTTATTTGTATCCaa  <  1:2412468/62‑1 (MQ=255) ttATTTTCTGGGCCTTAAGAAATTGAGAGAATACTATGATACAAAGAGTTATTTGTATCCaa  <  1:2203904/62‑1 (MQ=255) ttATTTTCTGGGCCTTAAGAAATTGAGAGAATACTATGATACAAAGAGTTATTTGTATCCaa  <  1:2123456/62‑1 (MQ=255) ttATTTTCTGGGCCTTAAGAAATTGAGAGAATACTATGATACAAAGAGTTATTTGTATCCaa  <  1:2122392/62‑1 (MQ=255) ttATTTTCTGGGCCTTAAGAAATTGAGAGAATACTATGATACAAAGAGTTATTTGTATCCaa  <  1:2021027/62‑1 (MQ=255) ttATTTTCTGGGCCTTAAGAAATTGAGAGAATACTATGATACAAAGAGTTATTTGTATCCaa  <  1:1690978/62‑1 (MQ=255) ttATTTTCTGGGCCTTAAGAAATTGAGAGAATACTATGATACAAAGAGTTATTTGTATCCaa  <  1:1525417/62‑1 (MQ=255) ttATTTTCTGGGCCTTAAGAAATTGAGAGAATACTATGATACAAAGAGTTATTTGTATCCaa  <  1:1137762/62‑1 (MQ=255) ttATTTTCTGGGCCTTAAGAAATTGAGAGAAAACTATGATACAAAGAGTTATTTGTATCCaa  <  1:2463003/62‑1 (MQ=255)      ttCTGGGCCTTAAGAAATTGAGAGAATACTATGATACAAAGAGTTATTTGTATCCaa  <  1:2712292/57‑1 (MQ=255)             ccTTAAGAAATTGAGAGAATACTATGATACAAAGAGTTATTTGTATCCaa  <  1:684563/50‑1 (MQ=255)              cTTAAGAAATTGAGAGAATACTATGATACAAAGAGTTATTTGTATCCaa  <  1:73101/49‑1 (MQ=255)                tAAGAAATTGAGAGAATACTATGATACAAAGAGTTATTTGTATCCaa  <  1:2688727/47‑1 (MQ=255)                                                              | TTATTTTCTGGGCCTTAAGAAATTGAGAGAATACTATGATACAAAGAGTTATTTGTATCCAA  >  W3110S.gb/2108202‑2108263

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑