Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	2109165	2109170	6	29 [0]	[0] 19	wbbH	O‑antigen polymerase

ATTATTGACTTTTCTGATATTTAGATCTAATACACTTTCCGTCAATAAACATGACAGGGTAA  >  W3110S.gb/2109103‑2109164                                                              | attattGACTTTTCTGATATTTAGATCTAATACACTTTCCGTCAATAAACATGACAGGGTaa  <  1:2321250/62‑1 (MQ=255) attattGACTTTTCTGATATTTAGATCTAATACACTTTCCGTCAATAAACATGACAGGGTaa  <  1:920812/62‑1 (MQ=255) attattGACTTTTCTGATATTTAGATCTAATACACTTTCCGTCAATAAACATGACAGGGTaa  <  1:865492/62‑1 (MQ=255) attattGACTTTTCTGATATTTAGATCTAATACACTTTCCGTCAATAAACATGACAGGGTaa  <  1:700043/62‑1 (MQ=255) attattGACTTTTCTGATATTTAGATCTAATACACTTTCCGTCAATAAACATGACAGGGTaa  <  1:664681/62‑1 (MQ=255) attattGACTTTTCTGATATTTAGATCTAATACACTTTCCGTCAATAAACATGACAGGGTaa  <  1:557258/62‑1 (MQ=255) attattGACTTTTCTGATATTTAGATCTAATACACTTTCCGTCAATAAACATGACAGGGTaa  <  1:486414/62‑1 (MQ=255) attattGACTTTTCTGATATTTAGATCTAATACACTTTCCGTCAATAAACATGACAGGGTaa  <  1:382497/62‑1 (MQ=255) attattGACTTTTCTGATATTTAGATCTAATACACTTTCCGTCAATAAACATGACAGGGTaa  <  1:284707/62‑1 (MQ=255) attattGACTTTTCTGATATTTAGATCTAATACACTTTCCGTCAATAAACATGACAGGGTaa  <  1:284224/62‑1 (MQ=255) attattGACTTTTCTGATATTTAGATCTAATACACTTTCCGTCAATAAACATGACAGGGTaa  <  1:2588899/62‑1 (MQ=255) attattGACTTTTCTGATATTTAGATCTAATACACTTTCCGTCAATAAACATGACAGGGTaa  <  1:2386374/62‑1 (MQ=255) attattGACTTTTCTGATATTTAGATCTAATACACTTTCCGTCAATAAACATGACAGGGTaa  <  1:2356846/62‑1 (MQ=255) attattGACTTTTCTGATATTTAGATCTAATACACTTTCCGTCAATAAACATGACAGGGTaa  <  1:2336497/62‑1 (MQ=255) attattGACTTTTCTGATATTTAGATCTAATACACTTTCCGTCAATAAACATGACAGGGTaa  <  1:112980/62‑1 (MQ=255) attattGACTTTTCTGATATTTAGATCTAATACACTTTCCGTCAATAAACATGACAGGGTaa  <  1:2306795/62‑1 (MQ=255) attattGACTTTTCTGATATTTAGATCTAATACACTTTCCGTCAATAAACATGACAGGGTaa  <  1:2276219/62‑1 (MQ=255) attattGACTTTTCTGATATTTAGATCTAATACACTTTCCGTCAATAAACATGACAGGGTaa  <  1:2276073/62‑1 (MQ=255) attattGACTTTTCTGATATTTAGATCTAATACACTTTCCGTCAATAAACATGACAGGGTaa  <  1:2265236/62‑1 (MQ=255) attattGACTTTTCTGATATTTAGATCTAATACACTTTCCGTCAATAAACATGACAGGGTaa  <  1:2208217/62‑1 (MQ=255) attattGACTTTTCTGATATTTAGATCTAATACACTTTCCGTCAATAAACATGACAGGGTaa  <  1:2161150/62‑1 (MQ=255) attattGACTTTTCTGATATTTAGATCTAATACACTTTCCGTCAATAAACATGACAGGGTaa  <  1:1864670/62‑1 (MQ=255) attattGACTTTTCTGATATTTAGATCTAATACACTTTCCGTCAATAAACATGACAGGGTaa  <  1:1729614/62‑1 (MQ=255) attattGACTTTTCTGATATTTAGATCTAATACACTTTCCGTCAATAAACATGACAGGGTaa  <  1:1676370/62‑1 (MQ=255) attattGACTTTTCTGATATTTAGATCTAATACACTTTCCGTCAATAAACATGACAGGGTaa  <  1:1400028/62‑1 (MQ=255) attattGACTTTTCTGATATTTAGATCTAATACACTTTCCGTCAATAAACATGACAGGGTaa  <  1:1338738/62‑1 (MQ=255) attattGACTTTTCTGATATTTAGATCTAATACACTTTCCGTCAATAAACATGACAGGGTaa  <  1:1223354/62‑1 (MQ=255)  ttattGACTTTTCTGATATTTAGATCTAATACACTTTCCGTCAATAAACATGACAGGGTaa  <  1:243379/61‑1 (MQ=255)       gACTTTTCTGATATTTAGATCTAATACACTTTCCGTCAATAAACATGACAGGGTaa  <  1:1411649/56‑1 (MQ=255)                                                              | ATTATTGACTTTTCTGATATTTAGATCTAATACACTTTCCGTCAATAAACATGACAGGGTAA  >  W3110S.gb/2109103‑2109164

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑