Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	2188658	2188675	18	37 [0]	[0] 26	thiM/yohL	hydoxyethylthiazole kinase/conserved hypothetical protein

CGTGCGCAGATTGCGCTGAACCCAGCAGGTCGACTTGCATAGTTTGCTCCTGCCATAACGTG  >  W3110S.gb/2188596‑2188657                                                              | cgTGCGCAGATTGCGCTGAACCCAGCAGGTCGACTTGCATAGTTTGCTCCTGCCATAACGTg  <  1:41445/62‑1 (MQ=255) cgTGCGCAGATTGCGCTGAACCCAGCAGGTCGACTTGCATAGTTTGCTCCTGCCATAACGTg  <  1:2190312/62‑1 (MQ=255) cgTGCGCAGATTGCGCTGAACCCAGCAGGTCGACTTGCATAGTTTGCTCCTGCCATAACGTg  <  1:2242338/62‑1 (MQ=255) cgTGCGCAGATTGCGCTGAACCCAGCAGGTCGACTTGCATAGTTTGCTCCTGCCATAACGTg  <  1:2279594/62‑1 (MQ=255) cgTGCGCAGATTGCGCTGAACCCAGCAGGTCGACTTGCATAGTTTGCTCCTGCCATAACGTg  <  1:2427886/62‑1 (MQ=255) cgTGCGCAGATTGCGCTGAACCCAGCAGGTCGACTTGCATAGTTTGCTCCTGCCATAACGTg  <  1:2451316/62‑1 (MQ=255) cgTGCGCAGATTGCGCTGAACCCAGCAGGTCGACTTGCATAGTTTGCTCCTGCCATAACGTg  <  1:2583069/62‑1 (MQ=255) cgTGCGCAGATTGCGCTGAACCCAGCAGGTCGACTTGCATAGTTTGCTCCTGCCATAACGTg  <  1:2747467/62‑1 (MQ=255) cgTGCGCAGATTGCGCTGAACCCAGCAGGTCGACTTGCATAGTTTGCTCCTGCCATAACGTg  <  1:341583/62‑1 (MQ=255) cgTGCGCAGATTGCGCTGAACCCAGCAGGTCGACTTGCATAGTTTGCTCCTGCCATAACGTg  <  1:2146800/62‑1 (MQ=255) cgTGCGCAGATTGCGCTGAACCCAGCAGGTCGACTTGCATAGTTTGCTCCTGCCATAACGTg  <  1:422079/62‑1 (MQ=255) cgTGCGCAGATTGCGCTGAACCCAGCAGGTCGACTTGCATAGTTTGCTCCTGCCATAACGTg  <  1:459275/62‑1 (MQ=255) cgTGCGCAGATTGCGCTGAACCCAGCAGGTCGACTTGCATAGTTTGCTCCTGCCATAACGTg  <  1:500817/62‑1 (MQ=255) cgTGCGCAGATTGCGCTGAACCCAGCAGGTCGACTTGCATAGTTTGCTCCTGCCATAACGTg  <  1:569063/62‑1 (MQ=255) cgTGCGCAGATTGCGCTGAACCCAGCAGGTCGACTTGCATAGTTTGCTCCTGCCATAACGTg  <  1:653361/62‑1 (MQ=255) cgTGCGCAGATTGCGCTGAACCCAGCAGGTCGACTTGCATAGTTTGCTCCTGCCATAACGTg  <  1:707022/62‑1 (MQ=255) cgTGCGCAGATTGCGCTGAACCCAGCAGGTCGACTTGCATAGTTTGCTCCTGCCATAACGTg  <  1:748222/62‑1 (MQ=255) cgTGCGCAGATTGCGCTGAACCCAGCAGGTCGACTTGCATAGTTTGCTCCTGCCATAACGTg  <  1:97452/62‑1 (MQ=255) cgTGCGCAGATTGCGCTGAACCCAGCAGGTCGACTTGCATAGTTTGCTCCTGCCATAACGTg  <  1:172652/62‑1 (MQ=255) cgTGCGCAGATTGCGCTGAACCCAGCAGGTCGACTTGCATAGTTTGCTCCTGCCATAACGTg  <  1:1092313/62‑1 (MQ=255) cgTGCGCAGATTGCGCTGAACCCAGCAGGTCGACTTGCATAGTTTGCTCCTGCCATAACGTg  <  1:115233/62‑1 (MQ=255) cgTGCGCAGATTGCGCTGAACCCAGCAGGTCGACTTGCATAGTTTGCTCCTGCCATAACGTg  <  1:1161352/62‑1 (MQ=255) cgTGCGCAGATTGCGCTGAACCCAGCAGGTCGACTTGCATAGTTTGCTCCTGCCATAACGTg  <  1:1195642/62‑1 (MQ=255) cgTGCGCAGATTGCGCTGAACCCAGCAGGTCGACTTGCATAGTTTGCTCCTGCCATAACGTg  <  1:1466478/62‑1 (MQ=255) cgTGCGCAGATTGCGCTGAACCCAGCAGGTCGACTTGCATAGTTTGCTCCTGCCATAACGTg  <  1:1493522/62‑1 (MQ=255) cgTGCGCAGATTGCGCTGAACCCAGCAGGTCGACTTGCATAGTTTGCTCCTGCCATAACGTg  <  1:163273/62‑1 (MQ=255) cgTGCGCAGATTGCGCTGAACCCAGCAGGTCGACTTGCATAGTTTGCTCCTGCCATAACGTg  <  1:1699262/62‑1 (MQ=255) cgTGCGCAGATTGCGCTGAACCCAGCAGGTCGACTTGCATAGTTTGCTCCTGCCATAACGTg  <  1:1067167/62‑1 (MQ=255) cgTGCGCAGATTGCGCTGAACCCAGCAGGTCGACTTGCATAGTTTGCTCCTGCCATAACGTg  <  1:1746668/62‑1 (MQ=255) cgTGCGCAGATTGCGCTGAACCCAGCAGGTCGACTTGCATAGTTTGCTCCTGCCATAACGTg  <  1:1875133/62‑1 (MQ=255) cgTGCGCAGATTGCGCTGAACCCAGCAGGTCGACTTGCATAGTTTGCTCCTGCCATAACGTg  <  1:1878064/62‑1 (MQ=255) cgTGCGCAGATTGCGCTGAACCCAGCAGGTCGACTTGCATAGTTTGCTCCTGCCATAACGTg  <  1:2002197/62‑1 (MQ=255) cgTGCGCAGATTGCGCTGAACCCAGCAGGTCGACTTGCATAGTTTGCTCCTGCCATAACGTg  <  1:2059163/62‑1 (MQ=255) cgTGCGCAGATTGCGCTGAACCCAGCAGGTCGACTTGCATAGTTTGCTCCTGCCATAACGTg  <  1:2083565/62‑1 (MQ=255) cgTGCGCAGATTGCGCTGAACCCAGCAGGTCGACTTGCATAGTTTGCTCCTGCCATAACGTg  <  1:20850/62‑1 (MQ=255) cgTGCGCAGATTGCGCTGAACCCAGCAGGTCGACTTGCATAGTTTGCTCCTGCCATAACGTg  <  1:2124743/62‑1 (MQ=255)                cTGAACCCAGCAGGTCGACTTGCATAGTTTGCTCCTGCCATAACGTg  <  1:430658/47‑1 (MQ=255)                                                              | CGTGCGCAGATTGCGCTGAACCCAGCAGGTCGACTTGCATAGTTTGCTCCTGCCATAACGTG  >  W3110S.gb/2188596‑2188657

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑