Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	2216551	2216553	3	53 [0]	[0] 3	yehU	predicted sensory kinase in two‑component system with YehT

CCTCACGTCGGGCGCTGATTGCCACTCGCCCTGTATCCAGCAGTTGTGATGTCCCATGTTT  >  W3110S.gb/2216490‑2216550                                                             | ccTCACGTCGGGCGCTGATTGTCACTCGCCCTGTATCCAGCAGTTGTGATGTCCCATGttt  <  1:1967249/61‑1 (MQ=255) ccTCACGTCGGGCGCTGATTGCCACTCGCCCTGTATCCAGCAGTTGTGATGTCCCATGttt  <  1:2831952/61‑1 (MQ=255) ccTCACGTCGGGCGCTGATTGCCACTCGCCCTGTATCCAGCAGTTGTGATGTCCCATGttt  <  1:1020125/61‑1 (MQ=255) ccTCACGTCGGGCGCTGATTGCCACTCGCCCTGTATCCAGCAGTTGTGATGTCCCATGttt  <  1:209663/61‑1 (MQ=255) ccTCACGTCGGGCGCTGATTGCCACTCGCCCTGTATCCAGCAGTTGTGATGTCCCATGttt  <  1:2262803/61‑1 (MQ=255) ccTCACGTCGGGCGCTGATTGCCACTCGCCCTGTATCCAGCAGTTGTGATGTCCCATGttt  <  1:2345503/61‑1 (MQ=255) ccTCACGTCGGGCGCTGATTGCCACTCGCCCTGTATCCAGCAGTTGTGATGTCCCATGttt  <  1:2403388/61‑1 (MQ=255) ccTCACGTCGGGCGCTGATTGCCACTCGCCCTGTATCCAGCAGTTGTGATGTCCCATGttt  <  1:2442362/61‑1 (MQ=255) ccTCACGTCGGGCGCTGATTGCCACTCGCCCTGTATCCAGCAGTTGTGATGTCCCATGttt  <  1:2499866/61‑1 (MQ=255) 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                                                            | CCTCACGTCGGGCGCTGATTGCCACTCGCCCTGTATCCAGCAGTTGTGATGTCCCATGTTT  >  W3110S.gb/2216490‑2216550

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑