Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	2231933	2232010	78	46 [0]	[0] 19	yohH	conserved hypothetical protein

AGTTGATTATCGTGATACTCCAGCCACCATTGGCTGTCT  >  W3110S.gb/2231894‑2231932                                       | aGTTGATTATCGTGATACTCCAGCCACCATTGGCTGTCt  <  1:2877128/39‑1 (MQ=255) aGTTGATTATCGTGATACTCCAGCCACCATTGGCTGTCt  <  1:2126917/39‑1 (MQ=255) aGTTGATTATCGTGATACTCCAGCCACCATTGGCTGTCt  <  1:2134067/39‑1 (MQ=255) aGTTGATTATCGTGATACTCCAGCCACCATTGGCTGTCt  <  1:2146154/39‑1 (MQ=255) aGTTGATTATCGTGATACTCCAGCCACCATTGGCTGTCt  <  1:2159919/39‑1 (MQ=255) aGTTGATTATCGTGATACTCCAGCCACCATTGGCTGTCt  <  1:2220080/39‑1 (MQ=255) aGTTGATTATCGTGATACTCCAGCCACCATTGGCTGTCt  <  1:2305602/39‑1 (MQ=255) aGTTGATTATCGTGATACTCCAGCCACCATTGGCTGTCt  <  1:2334215/39‑1 (MQ=255) aGTTGATTATCGTGATACTCCAGCCACCATTGGCTGTCt  <  1:2342389/39‑1 (MQ=255) aGTTGATTATCGTGATACTCCAGCCACCATTGGCTGTCt  <  1:2404785/39‑1 (MQ=255) aGTTGATTATCGTGATACTCCAGCCACCATTGGCTGTCt  <  1:2482636/39‑1 (MQ=255) aGTTGATTATCGTGATACTCCAGCCACCATTGGCTGTCt  <  1:2717047/39‑1 (MQ=255) aGTTGATTATCGTGATACTCCAGCCACCATTGGCTGTCt  <  1:2084527/39‑1 (MQ=255) aGTTGATTATCGTGATACTCCAGCCACCATTGGCTGTCt  <  1:2903064/39‑1 (MQ=255) aGTTGATTATCGTGATACTCCAGCCACCATTGGCTGTCt  <  1:2914985/39‑1 (MQ=255) aGTTGATTATCGTGATACTCCAGCCACCATTGGCTGTCt  <  1:370239/39‑1 (MQ=255) aGTTGATTATCGTGATACTCCAGCCACCATTGGCTGTCt  <  1:479360/39‑1 (MQ=255) aGTTGATTATCGTGATACTCCAGCCACCATTGGCTGTCt  <  1:484424/39‑1 (MQ=255) aGTTGATTATCGTGATACTCCAGCCACCATTGGCTGTCt  <  1:53238/39‑1 (MQ=255) aGTTGATTATCGTGATACTCCAGCCACCATTGGCTGTCt  <  1:588116/39‑1 (MQ=255) aGTTGATTATCGTGATACTCCAGCCACCATTGGCTGTCt  <  1:762692/39‑1 (MQ=255) aGTTGATTATCGTGATACTCCAGCCACCATTGGCTGTCt  <  1:943705/39‑1 (MQ=255) aGTTGATTATCGTGATACTCCAGCCACCATTGGCTGTCt  <  1:948000/39‑1 (MQ=255) aGTTGATTATCGTGATACTCCAGCCACCATTGGCTGTCt  <  1:1596208/39‑1 (MQ=255) aGTTGATTATCGTGATACTCCAGCCACCATTGGCTGTCt  <  1:1054223/39‑1 (MQ=255) aGTTGATTATCGTGATACTCCAGCCACCATTGGCTGTCt  <  1:1057144/39‑1 (MQ=255) aGTTGATTATCGTGATACTCCAGCCACCATTGGCTGTCt  <  1:1063863/39‑1 (MQ=255) aGTTGATTATCGTGATACTCCAGCCACCATTGGCTGTCt  <  1:128480/39‑1 (MQ=255) aGTTGATTATCGTGATACTCCAGCCACCATTGGCTGTCt  <  1:1331609/39‑1 (MQ=255) aGTTGATTATCGTGATACTCCAGCCACCATTGGCTGTCt  <  1:1363583/39‑1 (MQ=255) aGTTGATTATCGTGATACTCCAGCCACCATTGGCTGTCt  <  1:1428660/39‑1 (MQ=255) aGTTGATTATCGTGATACTCCAGCCACCATTGGCTGTCt  <  1:1480511/39‑1 (MQ=255) aGTTGATTATCGTGATACTCCAGCCACCATTGGCTGTCt  <  1:1557814/39‑1 (MQ=255) aGTTGATTATCGTGATACTCCAGCCACCATTGGCTGTCt  <  1:1587150/39‑1 (MQ=255) aGTTGATTATCGTGATACTCCAGCCACCATTGGCTGTCt  <  1:1001048/39‑1 (MQ=255) aGTTGATTATCGTGATACTCCAGCCACCATTGGCTGTCt  <  1:1728520/39‑1 (MQ=255) aGTTGATTATCGTGATACTCCAGCCACCATTGGCTGTCt  <  1:1741205/39‑1 (MQ=255) aGTTGATTATCGTGATACTCCAGCCACCATTGGCTGTCt  <  1:174352/39‑1 (MQ=255) aGTTGATTATCGTGATACTCCAGCCACCATTGGCTGTCt  <  1:1773948/39‑1 (MQ=255) aGTTGATTATCGTGATACTCCAGCCACCATTGGCTGTCt  <  1:180520/39‑1 (MQ=255) aGTTGATTATCGTGATACTCCAGCCACCATTGGCTGTCt  <  1:1896661/39‑1 (MQ=255) aGTTGATTATCGTGATACTCCAGCCACCATTGGCTGTCt  <  1:1901212/39‑1 (MQ=255) aGTTGATTATCGTGATACTCCAGCCACCATTGGCTGTCt  <  1:1919041/39‑1 (MQ=255) aGTTGATTATCGTGATACTCCAGCCACCATTGGCTGTCt  <  1:1963337/39‑1 (MQ=255) aGTTGATTATCGTGATACTCCAGCCACCATTGGCTGTCt  <  1:2005317/39‑1 (MQ=255)  gTTGATTATCGTGATACTCCAGCCACCATTGGCTGTCt  <  1:1484628/38‑1 (MQ=255)                                       | AGTTGATTATCGTGATACTCCAGCCACCATTGGCTGTCT  >  W3110S.gb/2231894‑2231932

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑