Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	2236406	2236412	7	24 [0]	[0] 27	sanA	hypothetical protein

GCCAGGTCGGTGTGGTGCTCGGAACAGCAAAATATTATCGTACTGGCGTAATTAATCAGTA  >  W3110S.gb/2236345‑2236405                                                             | gCCAGGTCGGTGTGGTGCTCGGAACAGCAAAATATTATCGTACTGGCGTAATTAATCAGta  <  1:2231907/61‑1 (MQ=255) gCCAGGTCGGTGTGGTGCTCGGAACAGCAAAATATTATCGTACTGGCGTAATTAATCAGta  <  1:888519/61‑1 (MQ=255) gCCAGGTCGGTGTGGTGCTCGGAACAGCAAAATATTATCGTACTGGCGTAATTAATCAGta  <  1:821037/61‑1 (MQ=255) gCCAGGTCGGTGTGGTGCTCGGAACAGCAAAATATTATCGTACTGGCGTAATTAATCAGta  <  1:783913/61‑1 (MQ=255) gCCAGGTCGGTGTGGTGCTCGGAACAGCAAAATATTATCGTACTGGCGTAATTAATCAGta  <  1:45824/61‑1 (MQ=255) gCCAGGTCGGTGTGGTGCTCGGAACAGCAAAATATTATCGTACTGGCGTAATTAATCAGta  <  1:2894717/61‑1 (MQ=255) gCCAGGTCGGTGTGGTGCTCGGAACAGCAAAATATTATCGTACTGGCGTAATTAATCAGta  <  1:2848102/61‑1 (MQ=255) gCCAGGTCGGTGTGGTGCTCGGAACAGCAAAATATTATCGTACTGGCGTAATTAATCAGta  <  1:2660213/61‑1 (MQ=255) gCCAGGTCGGTGTGGTGCTCGGAACAGCAAAATATTATCGTACTGGCGTAATTAATCAGta  <  1:2621935/61‑1 (MQ=255) gCCAGGTCGGTGTGGTGCTCGGAACAGCAAAATATTATCGTACTGGCGTAATTAATCAGta  <  1:2584646/61‑1 (MQ=255) gCCAGGTCGGTGTGGTGCTCGGAACAGCAAAATATTATCGTACTGGCGTAATTAATCAGta  <  1:2289385/61‑1 (MQ=255) gCCAGGTCGGTGTGGTGCTCGGAACAGCAAAATATTATCGTACTGGCGTAATTAATCAGta  <  1:1039445/61‑1 (MQ=255) gCCAGGTCGGTGTGGTGCTCGGAACAGCAAAATATTATCGTACTGGCGTAATTAATCAGta  <  1:2196450/61‑1 (MQ=255) gCCAGGTCGGTGTGGTGCTCGGAACAGCAAAATATTATCGTACTGGCGTAATTAATCAGta  <  1:2035059/61‑1 (MQ=255) gCCAGGTCGGTGTGGTGCTCGGAACAGCAAAATATTATCGTACTGGCGTAATTAATCAGta  <  1:2030211/61‑1 (MQ=255) gCCAGGTCGGTGTGGTGCTCGGAACAGCAAAATATTATCGTACTGGCGTAATTAATCAGta  <  1:1984785/61‑1 (MQ=255) gCCAGGTCGGTGTGGTGCTCGGAACAGCAAAATATTATCGTACTGGCGTAATTAATCAGta  <  1:1903472/61‑1 (MQ=255) gCCAGGTCGGTGTGGTGCTCGGAACAGCAAAATATTATCGTACTGGCGTAATTAATCAGta  <  1:1809547/61‑1 (MQ=255) gCCAGGTCGGTGTGGTGCTCGGAACAGCAAAATATTATCGTACTGGCGTAATTAATCAGta  <  1:1408088/61‑1 (MQ=255) gCCAGGTCGGTGTGGTGCTCGGAACAGCAAAATATTATCGTACTGGCGTAATTAATCAGta  <  1:138365/61‑1 (MQ=255) gCCAGGTCGGTGTGGTGCTCGGAACAGCAAAATATTATCGTACTGGCGTAATTAATCAGta  <  1:1142020/61‑1 (MQ=255) gCCAGGTCGGTGTGGTGCTCGGAACAGCAAAATATTATCGTACTGGCGTAATTAATCAGta  <  1:1082722/61‑1 (MQ=255)  ccAGGTCGGTGTGGTGCTCGGAACAGCAAAATATTATCGTACTGGCGTAATTAATCAGta  <  1:1388146/60‑1 (MQ=255)       tCGGTGTGGTGCTCGGAACAGCAAAATATTATCGTACTGGCGTAATTAATCAGta  <  1:848914/55‑1 (MQ=255)                                                             | GCCAGGTCGGTGTGGTGCTCGGAACAGCAAAATATTATCGTACTGGCGTAATTAATCAGTA  >  W3110S.gb/2236345‑2236405

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑