Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	2274445	2274449	5	29 [0]	[0] 12	rtn	conserved hypothetical protein

ACCGGTGAGATGGACATTCCACTCAATGAATTGATTCCGGCGCTCGACATTAATAAAA  >  W3110S.gb/2274387‑2274444                                                          | aCCGGTGAGATGGACATTCCACTCAATGAATTGATTCCGGCGCTCGACATTAATaaaa  <  1:1071958/58‑1 (MQ=255) aCCGGTGAGATGGACATTCCACTCAATGAATTGATTCCGGCGCTCGACATTAATaaaa  <  1:377119/58‑1 (MQ=255) aCCGGTGAGATGGACATTCCACTCAATGAATTGATTCCGGCGCTCGACATTAATaaaa  <  1:324322/58‑1 (MQ=255) aCCGGTGAGATGGACATTCCACTCAATGAATTGATTCCGGCGCTCGACATTAATaaaa  <  1:2452554/58‑1 (MQ=255) aCCGGTGAGATGGACATTCCACTCAATGAATTGATTCCGGCGCTCGACATTAATaaaa  <  1:2150415/58‑1 (MQ=255) aCCGGTGAGATGGACATTCCACTCAATGAATTGATTCCGGCGCTCGACATTAATaaaa  <  1:1885956/58‑1 (MQ=255) aCCGGTGAGATGGACATTCCACTCAATGAATTGATTCCGGCGCTCGACATTAATaaaa  <  1:1751969/58‑1 (MQ=255) aCCGGTGAGATGGACATTCCACTCAATGAATTGATTCCGGCGCTCGACATTAATaaaa  <  1:1591200/58‑1 (MQ=255) aCCGGTGAGATGGACATTCCACTCAATGAATTGATTCCGGCGCTCGACATTAATaaaa  <  1:1438593/58‑1 (MQ=255) aCCGGTGAGATGGACATTCCACTCAATGAATTGATTCCGGCGCTCGACATTAATaaaa  <  1:1322514/58‑1 (MQ=255) aCCGGTGAGATGGACATTCCACTCAATGAATTGATTCCGGCGCTCGACATTAATaaaa  <  1:1322289/58‑1 (MQ=255)           tGGACATTCCACTCAATGAATTGATTCCGGCGCTCGACATTAATaaaa  <  1:322246/48‑1 (MQ=255)                   ccACTCAATGAATTGATTCCGGCGCTCGACATTAATaaaa  <  1:2223489/40‑1 (MQ=255)                   ccACTCAATGAATTGATTCCGGCGCTCGACATTAATaaaa  <  1:716393/40‑1 (MQ=255)                   ccACTCAATGAATTGATTCCGGCGCTCGACATTAATaaaa  <  1:1027514/40‑1 (MQ=255)                   ccACTCAATGAATTGATTCCGGCGCTCGACATTAATaaaa  <  1:1158256/40‑1 (MQ=255)                   ccACTCAATGAATTGATTCCGGCGCTCGACATTAATaaaa  <  1:2862955/40‑1 (MQ=255)                   ccACTCAATGAATTGATTCCGGCGCTCGACATTAATaaaa  <  1:2733252/40‑1 (MQ=255)                   ccACTCAATGAATTGATTCCGGCGCTCGACATTAATaaaa  <  1:1186643/40‑1 (MQ=255)                   ccACTCAATGAATTGATTCCGGCGCTCGACATTAATaaaa  <  1:2270181/40‑1 (MQ=255)                   ccACTCAATGAATTGATTCCGGCGCTCGACATTAATaaaa  <  1:2257350/40‑1 (MQ=255)                   ccACTCAATGAATTGATTCCGGCGCTCGACATTAATaaaa  <  1:2174095/40‑1 (MQ=255)                   ccACTCAATGAATTGATTCCGGCGCTCGACATTAATaaaa  <  1:1228361/40‑1 (MQ=255)                   ccACTCAATGAATTGATTCCGGCGCTCGACATTAATaaaa  <  1:2143144/40‑1 (MQ=255)                   ccACTCAATGAATTGATTCCGGCGCTCGACATTAATaaaa  <  1:1723093/40‑1 (MQ=255)                   ccACTCAATGAATTGATTCCGGCGCTCGACATTAATaaaa  <  1:1673770/40‑1 (MQ=255)                   ccACTCAATGAATTGATTCCGGCGCTCGACATTAATaaaa  <  1:1338784/40‑1 (MQ=255)                    cACTCAATGAATTGATTCCGGCGCTCGACATTAATaaaa  <  1:134180/39‑1 (MQ=255)                    cACTCAATGAATTGATTCCGGCGCTCGACATTAATaaaa  <  1:211859/39‑1 (MQ=255)                                                          | ACCGGTGAGATGGACATTCCACTCAATGAATTGATTCCGGCGCTCGACATTAATAAAA  >  W3110S.gb/2274387‑2274444

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑