Missing coverage evidence...
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ACATGTGAATAAGGAAACCCACACCAGTGACCACCGAGAGCATGGTCAGCGACAGGCCGTCC  >  W3110S.gb/2399413‑2399474                                                              | aCATGTGAATAAGGAAACCCACACCAGTGACCACCGAGAGCATGGTCAGCGACAGGCCGTcc  <  1:1085267/62‑1 (MQ=255) aCATGTGAATAAGGAAACCCACACCAGTGACCACCGAGAGCATGGTCAGCGACAGGCCGTcc  <  1:880429/62‑1 (MQ=255) aCATGTGAATAAGGAAACCCACACCAGTGACCACCGAGAGCATGGTCAGCGACAGGCCGTcc  <  1:686949/62‑1 (MQ=255) aCATGTGAATAAGGAAACCCACACCAGTGACCACCGAGAGCATGGTCAGCGACAGGCCGTcc  <  1:470938/62‑1 (MQ=255) aCATGTGAATAAGGAAACCCACACCAGTGACCACCGAGAGCATGGTCAGCGACAGGCCGTcc  <  1:408818/62‑1 (MQ=255) aCATGTGAATAAGGAAACCCACACCAGTGACCACCGAGAGCATGGTCAGCGACAGGCCGTcc  <  1:405657/62‑1 (MQ=255) aCATGTGAATAAGGAAACCCACACCAGTGACCACCGAGAGCATGGTCAGCGACAGGCCGTcc  <  1:357276/62‑1 (MQ=255) aCATGTGAATAAGGAAACCCACACCAGTGACCACCGAGAGCATGGTCAGCGACAGGCCGTcc  <  1:292615/62‑1 (MQ=255) aCATGTGAATAAGGAAACCCACACCAGTGACCACCGAGAGCATGGTCAGCGACAGGCCGTcc  <  1:2922943/62‑1 (MQ=255) aCATGTGAATAAGGAAACCCACACCAGTGACCACCGAGAGCATGGTCAGCGACAGGCCGTcc  <  1:2890118/62‑1 (MQ=255) aCATGTGAATAAGGAAACCCACACCAGTGACCACCGAGAGCATGGTCAGCGACAGGCCGTcc  <  1:2804015/62‑1 (MQ=255) aCATGTGAATAAGGAAACCCACACCAGTGACCACCGAGAGCATGGTCAGCGACAGGCCGTcc  <  1:2686649/62‑1 (MQ=255) aCATGTGAATAAGGAAACCCACACCAGTGACCACCGAGAGCATGGTCAGCGACAGGCCGTcc  <  1:2683399/62‑1 (MQ=255) aCATGTGAATAAGGAAACCCACACCAGTGACCACCGAGAGCATGGTCAGCGACAGGCCGTcc  <  1:258463/62‑1 (MQ=255) aCATGTGAATAAGGAAACCCACACCAGTGACCACCGAGAGCATGGTCAGCGACAGGCCGTcc  <  1:2465048/62‑1 (MQ=255) aCATGTGAATAAGGAAACCCACACCAGTGACCACCGAGAGCATGGTCAGCGACAGGCCGTcc  <  1:2217062/62‑1 (MQ=255) aCATGTGAATAAGGAAACCCACACCAGTGACCACCGAGAGCATGGTCAGCGACAGGCCGTcc  <  1:1488997/62‑1 (MQ=255) aCATGTGAATAAGGAAACCCACACCAGTGACCACCGAGAGCATGGTCAGCGACAGGCCGTcc  <  1:1023562/62‑1 (MQ=255) aCATGTGAATAAGGAAACCCACACCAGTGACCACCGAGAGCATGGTCAGCGACAGGCCGTcc  <  1:1146581/62‑1 (MQ=255) aCATGTGAATAAGGAAACCCACACCAGTGACCACCGAGAGCATGGTCAGCGACAGGCCGTcc  <  1:1246368/62‑1 (MQ=255) aCATGTGAATAAGGAAACCCACACCAGTGACCACCGAGAGCATGGTCAGCGACAGGCCGTcc  <  1:1267350/62‑1 (MQ=255) aCATGTGAATAAGGAAACCCACACCAGTGACCACCGAGAGCATGGTCAGCGACAGGCCGTcc  <  1:1303303/62‑1 (MQ=255) aCATGTGAATAAGGAAACCCACACCAGTGACCACCGAGAGCATGGTCAGCGACAGGCCGTcc  <  1:132324/62‑1 (MQ=255) aCATGTGAATAAGGAAACCCACACCAGTGACCACCGAGAGCATGGTCAGCGACAGGCCGTcc  <  1:1406789/62‑1 (MQ=255) aCATGTGAATAAGGAAACCCACACCAGTGACCACCGAGAGCATGGTCAGCGACAGGCCGTcc  <  1:1424686/62‑1 (MQ=255) aCATGTGAATAAGGAAACCCACACCAGTGACCACCGAGAGCATGGTCAGCGACAGGCCGTcc  <  1:2205686/62‑1 (MQ=255) aCATGTGAATAAGGAAACCCACACCAGTGACCACCGAGAGCATGGTCAGCGACAGGCCGTcc  <  1:1509635/62‑1 (MQ=255) aCATGTGAATAAGGAAACCCACACCAGTGACCACCGAGAGCATGGTCAGCGACAGGCCGTcc  <  1:1591612/62‑1 (MQ=255) aCATGTGAATAAGGAAACCCACACCAGTGACCACCGAGAGCATGGTCAGCGACAGGCCGTcc  <  1:1759005/62‑1 (MQ=255) aCATGTGAATAAGGAAACCCACACCAGTGACCACCGAGAGCATGGTCAGCGACAGGCCGTcc  <  1:1782228/62‑1 (MQ=255) aCATGTGAATAAGGAAACCCACACCAGTGACCACCGAGAGCATGGTCAGCGACAGGCCGTcc  <  1:192732/62‑1 (MQ=255) aCATGTGAATAAGGAAACCCACACCAGTGACCACCGAGAGCATGGTCAGCGACAGGCCGTcc  <  1:2008098/62‑1 (MQ=255)  cATGTGAATAAGGAAACCCACACCAGTGACCACCGAGAGCATGGTCAGCGACAGGCCGTcc  <  1:2869942/61‑1 (MQ=255)  cATGTGAATAAGGAAACCCACACCAGTGACCACCGAGAGCATGGTCAGCGACAGGCCGTcc  <  1:2616023/61‑1 (MQ=255)  cATGTGAATAAGGAAACCCACACCAGTGACCACCGAGAGCATGGTCAGCGACAGGCCGTcc  <  1:2296897/61‑1 (MQ=255)   aTGTGAATAAGGAAACCCACACCAGTGACCACCGAGAGCATGGTCAGCGACAGGCCGTcc  <  1:656349/60‑1 (MQ=255)                                                              | ACATGTGAATAAGGAAACCCACACCAGTGACCACCGAGAGCATGGTCAGCGACAGGCCGTCC  >  W3110S.gb/2399413‑2399474

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑