Missing coverage evidence...
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*	*	÷	W3110S.gb	2406204	2406269	66	33 [0]	[0] 26	[nuoF]–[nuoE]	[nuoF],[nuoE]

CGTCCAGCCACACTGGCTGTTTGTCATCGCGCAGACGCCAGGTCAGCGGATGCGTTTCGG  >  W3110S.gb/2406144‑2406203                                                            | cGTCCAGCCACACTGGCTGTTTGTCATCGCGCAGACGCCAGGTCAGCGGATGCGTTTCgg  <  1:373821/60‑1 (MQ=255) cGTCCAGCCACACTGGCTGTTTGTCATCGCGCAGACGCCAGGTCAGCGGATGCGTTTCgg  <  1:2530563/60‑1 (MQ=255) cGTCCAGCCACACTGGCTGTTTGTCATCGCGCAGACGCCAGGTCAGCGGATGCGTTTCgg  <  1:2533734/60‑1 (MQ=255) cGTCCAGCCACACTGGCTGTTTGTCATCGCGCAGACGCCAGGTCAGCGGATGCGTTTCgg  <  1:2744852/60‑1 (MQ=255) cGTCCAGCCACACTGGCTGTTTGTCATCGCGCAGACGCCAGGTCAGCGGATGCGTTTCgg  <  1:2746652/60‑1 (MQ=255) cGTCCAGCCACACTGGCTGTTTGTCATCGCGCAGACGCCAGGTCAGCGGATGCGTTTCgg  <  1:2758401/60‑1 (MQ=255) cGTCCAGCCACACTGGCTGTTTGTCATCGCGCAGACGCCAGGTCAGCGGATGCGTTTCgg  <  1:279228/60‑1 (MQ=255) cGTCCAGCCACACTGGCTGTTTGTCATCGCGCAGACGCCAGGTCAGCGGATGCGTTTCgg  <  1:2880548/60‑1 (MQ=255) cGTCCAGCCACACTGGCTGTTTGTCATCGCGCAGACGCCAGGTCAGCGGATGCGTTTCgg  <  1:290165/60‑1 (MQ=255) cGTCCAGCCACACTGGCTGTTTGTCATCGCGCAGACGCCAGGTCAGCGGATGCGTTTCgg  <  1:248837/60‑1 (MQ=255) cGTCCAGCCACACTGGCTGTTTGTCATCGCGCAGACGCCAGGTCAGCGGATGCGTTTCgg  <  1:429176/60‑1 (MQ=255) cGTCCAGCCACACTGGCTGTTTGTCATCGCGCAGACGCCAGGTCAGCGGATGCGTTTCgg  <  1:604415/60‑1 (MQ=255) cGTCCAGCCACACTGGCTGTTTGTCATCGCGCAGACGCCAGGTCAGCGGATGCGTTTCgg  <  1:605499/60‑1 (MQ=255) cGTCCAGCCACACTGGCTGTTTGTCATCGCGCAGACGCCAGGTCAGCGGATGCGTTTCgg  <  1:607357/60‑1 (MQ=255) cGTCCAGCCACACTGGCTGTTTGTCATCGCGCAGACGCCAGGTCAGCGGATGCGTTTCgg  <  1:689751/60‑1 (MQ=255) cGTCCAGCCACACTGGCTGTTTGTCATCGCGCAGACGCCAGGTCAGCGGATGCGTTTCgg  <  1:823543/60‑1 (MQ=255) cGTCCAGCCACACTGGCTGTTTGTCATCGCGCAGACGCCAGGTCAGCGGATGCGTTTCgg  <  1:927486/60‑1 (MQ=255) cGTCCAGCCACACTGGCTGTTTGTCATCGCGCAGACGCCAGGTCAGCGGATGCGTTTCgg  <  1:1140238/60‑1 (MQ=255) cGTCCAGCCACACTGGCTGTTTGTCATCGCGCAGACGCCAGGTCAGCGGATGCGTTTCgg  <  1:2395837/60‑1 (MQ=255) cGTCCAGCCACACTGGCTGTTTGTCATCGCGCAGACGCCAGGTCAGCGGATGCGTTTCgg  <  1:2183652/60‑1 (MQ=255) cGTCCAGCCACACTGGCTGTTTGTCATCGCGCAGACGCCAGGTCAGCGGATGCGTTTCgg  <  1:218263/60‑1 (MQ=255) cGTCCAGCCACACTGGCTGTTTGTCATCGCGCAGACGCCAGGTCAGCGGATGCGTTTCgg  <  1:2025007/60‑1 (MQ=255) cGTCCAGCCACACTGGCTGTTTGTCATCGCGCAGACGCCAGGTCAGCGGATGCGTTTCgg  <  1:1830328/60‑1 (MQ=255) cGTCCAGCCACACTGGCTGTTTGTCATCGCGCAGACGCCAGGTCAGCGGATGCGTTTCgg  <  1:1793042/60‑1 (MQ=255) cGTCCAGCCACACTGGCTGTTTGTCATCGCGCAGACGCCAGGTCAGCGGATGCGTTTCgg  <  1:1775388/60‑1 (MQ=255) cGTCCAGCCACACTGGCTGTTTGTCATCGCGCAGACGCCAGGTCAGCGGATGCGTTTCgg  <  1:1651266/60‑1 (MQ=255) cGTCCAGCCACACTGGCTGTTTGTCATCGCGCAGACGCCAGGTCAGCGGATGCGTTTCgg  <  1:1420641/60‑1 (MQ=255) cGTCCAGCCACACTGGCTGTTTGTCATCGCGCAGACGCCAGGTCAGCGGATGCGTTTCgg  <  1:1380036/60‑1 (MQ=255) cGTCCAGCCACACTGGCTGTTTGTCATCGCGCAGACGCCAGGTCAGCGGATGCGTTTCgg  <  1:13600/60‑1 (MQ=255) cGTCCAGCCACACTGGCTGTTTGTCATCGCGCAGACGCCAGGTCAGCGGATGCGTTTCgg  <  1:1224258/60‑1 (MQ=255) cGTCCAGCCACACTGGCTGTTTGTCATCGCGCAGACGCCAGGTCAGCGGATGCGTTTCgg  <  1:1145490/60‑1 (MQ=255) cGTCCAGCCACACTGGCTGTTTGTCATCGCGCAGACGCCAGGTCAGCGGATGCGTTTCgg  <  1:1140982/60‑1 (MQ=255)  gTCCAGCCACACTGGCTGTTTGTCATCGCGCAGACGCCAGGTCAGCGGATGCGTTTCgg  <  1:1842228/59‑1 (MQ=255)                                                            | CGTCCAGCCACACTGGCTGTTTGTCATCGCGCAGACGCCAGGTCAGCGGATGCGTTTCGG  >  W3110S.gb/2406144‑2406203

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑