Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	2440828	2440852	25	11 [0]	[0] 20	truA	pseudouridylate synthase I

TCATCAGGTACAGTTTTAACCCAACGCACAGCGATGTCACCAGGTAAATTCGCATTTACGCC  >  W3110S.gb/2440766‑2440827                                                              | tcatcaGGTACAGTTTTAACCCAACGCACAGCGATGTCACCAGGTAAATTCGCATTTACGcc  <  1:1236108/62‑1 (MQ=255) tcatcaGGTACAGTTTTAACCCAACGCACAGCGATGTCACCAGGTAAATTCGCATTTACGcc  <  1:1347903/62‑1 (MQ=255) tcatcaGGTACAGTTTTAACCCAACGCACAGCGATGTCACCAGGTAAATTCGCATTTACGcc  <  1:2225467/62‑1 (MQ=255) tcatcaGGTACAGTTTTAACCCAACGCACAGCGATGTCACCAGGTAAATTCGCATTTACGcc  <  1:2228784/62‑1 (MQ=255) tcatcaGGTACAGTTTTAACCCAACGCACAGCGATGTCACCAGGTAAATTCGCATTTACGcc  <  1:319639/62‑1 (MQ=255) tcatcaGGTACAGTTTTAACCCAACGCACAGCGATGTCACCAGGTAAATTCGCATTTACGcc  <  1:381416/62‑1 (MQ=255) tcatcaGGTACAGTTTTAACCCAACGCACAGCGATGTCACCAGGTAAATTCGCATTTACGcc  <  1:407302/62‑1 (MQ=255) tcatcaGGTACAGTTTTAACCCAACGCACAGCGATGTCACCAGGTAAATTCGCATTTACGcc  <  1:465037/62‑1 (MQ=255) tcatcaGGTACAGTTTTAACCCAACGCACAGCGATGTCACCAGGTAAATTCGCATTTACGcc  <  1:729543/62‑1 (MQ=255) tcatcaGGTACAGTTTTAACCCAACGCACAGCGATGTCACCAGGTAAATTCGCATTTACGcc  <  1:893650/62‑1 (MQ=255) tcatcaGGTACAGTTTTAACCCAACGCACAGCGATGTAACCAGGTAAATTCGCATTTACGcc  <  1:1210493/62‑1 (MQ=255)                                                              | TCATCAGGTACAGTTTTAACCCAACGCACAGCGATGTCACCAGGTAAATTCGCATTTACGCC  >  W3110S.gb/2440766‑2440827

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑