Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	2449061	2449063	3	23 [0]	[0] 15	trmC	fused 5‑methylaminomethyl‑2‑thiouridine forming enzyme methyltransferase and FAD‑dependent demodification enzyme

ATGAGGCGGTAAGCGCGCCGGTTTTTGACGATCTCTTTATGTTTGCGGCTTTAGGTTCT  >  W3110S.gb/2449002‑2449060                                                           | aTGAGGCGGTAAGCGCGCCGGTTTTTGACGATCTCTTTATGTTTGCGGCTTTAGGTtct  <  1:1111935/59‑1 (MQ=255) aTGAGGCGGTAAGCGCGCCGGTTTTTGACGATCTCTTTATGTTTGCGGCTTTAGGTtct  <  1:514176/59‑1 (MQ=255) aTGAGGCGGTAAGCGCGCCGGTTTTTGACGATCTCTTTATGTTTGCGGCTTTAGGTtct  <  1:478388/59‑1 (MQ=255) aTGAGGCGGTAAGCGCGCCGGTTTTTGACGATCTCTTTATGTTTGCGGCTTTAGGTtct  <  1:453757/59‑1 (MQ=255) aTGAGGCGGTAAGCGCGCCGGTTTTTGACGATCTCTTTATGTTTGCGGCTTTAGGTtct  <  1:378604/59‑1 (MQ=255) aTGAGGCGGTAAGCGCGCCGGTTTTTGACGATCTCTTTATGTTTGCGGCTTTAGGTtct  <  1:2639509/59‑1 (MQ=255) aTGAGGCGGTAAGCGCGCCGGTTTTTGACGATCTCTTTATGTTTGCGGCTTTAGGTtct  <  1:2588834/59‑1 (MQ=255) aTGAGGCGGTAAGCGCGCCGGTTTTTGACGATCTCTTTATGTTTGCGGCTTTAGGTtct  <  1:2485780/59‑1 (MQ=255) aTGAGGCGGTAAGCGCGCCGGTTTTTGACGATCTCTTTATGTTTGCGGCTTTAGGTtct  <  1:243402/59‑1 (MQ=255) aTGAGGCGGTAAGCGCGCCGGTTTTTGACGATCTCTTTATGTTTGCGGCTTTAGGTtct  <  1:2382512/59‑1 (MQ=255) aTGAGGCGGTAAGCGCGCCGGTTTTTGACGATCTCTTTATGTTTGCGGCTTTAGGTtct  <  1:2321378/59‑1 (MQ=255) aTGAGGCGGTAAGCGCGCCGGTTTTTGACGATCTCTTTATGTTTGCGGCTTTAGGTtct  <  1:2215713/59‑1 (MQ=255) aTGAGGCGGTAAGCGCGCCGGTTTTTGACGATCTCTTTATGTTTGCGGCTTTAGGTtct  <  1:2194765/59‑1 (MQ=255) aTGAGGCGGTAAGCGCGCCGGTTTTTGACGATCTCTTTATGTTTGCGGCTTTAGGTtct  <  1:2182795/59‑1 (MQ=255) aTGAGGCGGTAAGCGCGCCGGTTTTTGACGATCTCTTTATGTTTGCGGCTTTAGGTtct  <  1:2117613/59‑1 (MQ=255) aTGAGGCGGTAAGCGCGCCGGTTTTTGACGATCTCTTTATGTTTGCGGCTTTAGGTtct  <  1:1790453/59‑1 (MQ=255) aTGAGGCGGTAAGCGCGCCGGTTTTTGACGATCTCTTTATGTTTGCGGCTTTAGGTtct  <  1:1728034/59‑1 (MQ=255) aTGAGGCGGTAAGCGCGCCGGTTTTTGACGATCTCTTTATGTTTGCGGCTTTAGGTtct  <  1:151045/59‑1 (MQ=255) aTGAGGCGGTAAGCGCGCCGGTTTTTGACGATCTCTTTATGTTTGCGGCTTTAGGTtct  <  1:1445289/59‑1 (MQ=255) aTGAGGCGGTAAGCGCGCCGGTTTTTGACGATCTCTTTATGTTTGCGGCTTTAGGTtct  <  1:12341/59‑1 (MQ=255) aTGAGGCGGTAAGCGCGCCGGTTTTTGACGATCTCTTTATGTTTGCGGCTTTAGGTtct  <  1:1094844/59‑1 (MQ=255)                        tttGACGATCTCTTTATGTTTGCGGCTTTAGGTtct  <  1:2587137/36‑1 (MQ=255)                        tttGACGATCTCTTTATGTTTGCGGCTTTAGGTtct  <  1:970975/36‑1 (MQ=255)                                                           | ATGAGGCGGTAAGCGCGCCGGTTTTTGACGATCTCTTTATGTTTGCGGCTTTAGGTTCT  >  W3110S.gb/2449002‑2449060

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑