Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	2478376	2478382	7	23 [0]	[0] 2	yfdO	predicted defective phage replication protein O

AGACTCATGCTCACCCCCTGAATCCTGCCGGGATCTGGCTGTAGTCCACATTGTCGTAACTG  >  W3110S.gb/2478314‑2478375                                                              | aGACTCATGCTCACCCCCTGAATCCTGCCGGGATCTGGCTGTAGTCCACATTGTCGTAACTg  <  1:2183965/62‑1 (MQ=255) aGACTCATGCTCACCCCCTGAATCCTGCCGGGATCTGGCTGTAGTCCACATTGTCGTAACTg  <  1:978058/62‑1 (MQ=255) aGACTCATGCTCACCCCCTGAATCCTGCCGGGATCTGGCTGTAGTCCACATTGTCGTAACTg  <  1:968611/62‑1 (MQ=255) aGACTCATGCTCACCCCCTGAATCCTGCCGGGATCTGGCTGTAGTCCACATTGTCGTAACTg  <  1:857037/62‑1 (MQ=255) aGACTCATGCTCACCCCCTGAATCCTGCCGGGATCTGGCTGTAGTCCACATTGTCGTAACTg  <  1:594076/62‑1 (MQ=255) aGACTCATGCTCACCCCCTGAATCCTGCCGGGATCTGGCTGTAGTCCACATTGTCGTAACTg  <  1:2784200/62‑1 (MQ=255) aGACTCATGCTCACCCCCTGAATCCTGCCGGGATCTGGCTGTAGTCCACATTGTCGTAACTg  <  1:2727556/62‑1 (MQ=255) aGACTCATGCTCACCCCCTGAATCCTGCCGGGATCTGGCTGTAGTCCACATTGTCGTAACTg  <  1:2544902/62‑1 (MQ=255) aGACTCATGCTCACCCCCTGAATCCTGCCGGGATCTGGCTGTAGTCCACATTGTCGTAACTg  <  1:2282767/62‑1 (MQ=255) aGACTCATGCTCACCCCCTGAATCCTGCCGGGATCTGGCTGTAGTCCACATTGTCGTAACTg  <  1:1053496/62‑1 (MQ=255) aGACTCATGCTCACCCCCTGAATCCTGCCGGGATCTGGCTGTAGTCCACATTGTCGTAACTg  <  1:2171489/62‑1 (MQ=255) aGACTCATGCTCACCCCCTGAATCCTGCCGGGATCTGGCTGTAGTCCACATTGTCGTAACTg  <  1:2159858/62‑1 (MQ=255) aGACTCATGCTCACCCCCTGAATCCTGCCGGGATCTGGCTGTAGTCCACATTGTCGTAACTg  <  1:1861582/62‑1 (MQ=255) aGACTCATGCTCACCCCCTGAATCCTGCCGGGATCTGGCTGTAGTCCACATTGTCGTAACTg  <  1:1784075/62‑1 (MQ=255) aGACTCATGCTCACCCCCTGAATCCTGCCGGGATCTGGCTGTAGTCCACATTGTCGTAACTg  <  1:167221/62‑1 (MQ=255) aGACTCATGCTCACCCCCTGAATCCTGCCGGGATCTGGCTGTAGTCCACATTGTCGTAACTg  <  1:1662932/62‑1 (MQ=255) aGACTCATGCTCACCCCCTGAATCCTGCCGGGATCTGGCTGTAGTCCACATTGTCGTAACTg  <  1:1631582/62‑1 (MQ=255) aGACTCATGCTCACCCCCTGAATCCTGCCGGGATCTGGCTGTAGTCCACATTGTCGTAACTg  <  1:159023/62‑1 (MQ=255) aGACTCATGCTCACCCCCTGAATCCTGCCGGGATCTGGCTGTAGTCCACATTGTCGTAACTg  <  1:1154980/62‑1 (MQ=255) aGACTCATGCTCACCCCCTGAATCCTGCCGGGATCTGGCTGTAGTCCACATTGTCGTAACTg  <  1:1055800/62‑1 (MQ=255)                   tGAATCCTGCCGGGATCTGGCTGTAGTCCACATTGTCGTAACTg  <  1:674965/44‑1 (MQ=255)                      aTCCTGCCTGGATCTGGCTGTAGTCCACATTGTCGTAACTg  <  1:78315/41‑1 (MQ=255)                       tCCTGCCGGGATCTGGCTGTAGTCCACATTGTCGTAACTg  <  1:2486291/40‑1 (MQ=255)                                                              | AGACTCATGCTCACCCCCTGAATCCTGCCGGGATCTGGCTGTAGTCCACATTGTCGTAACTG  >  W3110S.gb/2478314‑2478375

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑