Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	2590925	2590957	33	40 [0]	[0] 11	dapE	N‑succinyl‑diaminopimelate deacylase

GACAATCCGGTACATCGCGCAGCACCTTTCCTTAATGAATTAGTGGCTATTGAGTGGGATCA  >  W3110S.gb/2590863‑2590924                                                              | gACAATCCGGTACATCGCGCAGCACCTTTCCTTAATGAATTAGTGGCTATTGAGTGGGATCa  >  1:2701928/1‑62 (MQ=255) gACAATCCGGTACATCGCGCAGCACCTTTCCTTAATGAATTAGTGGCTATTGAGTGGGATCa  >  1:2231836/1‑62 (MQ=255) gACAATCCGGTACATCGCGCAGCACCTTTCCTTAATGAATTAGTGGCTATTGAGTGGGATCa  >  1:2380614/1‑62 (MQ=255) gACAATCCGGTACATCGCGCAGCACCTTTCCTTAATGAATTAGTGGCTATTGAGTGGGATCa  >  1:244183/1‑62 (MQ=255) gACAATCCGGTACATCGCGCAGCACCTTTCCTTAATGAATTAGTGGCTATTGAGTGGGATCa  >  1:2446073/1‑62 (MQ=255) gACAATCCGGTACATCGCGCAGCACCTTTCCTTAATGAATTAGTGGCTATTGAGTGGGATCa  >  1:2496985/1‑62 (MQ=255) gACAATCCGGTACATCGCGCAGCACCTTTCCTTAATGAATTAGTGGCTATTGAGTGGGATCa  >  1:2528966/1‑62 (MQ=255) gACAATCCGGTACATCGCGCAGCACCTTTCCTTAATGAATTAGTGGCTATTGAGTGGGATCa  >  1:2549735/1‑62 (MQ=255) gACAATCCGGTACATCGCGCAGCACCTTTCCTTAATGAATTAGTGGCTATTGAGTGGGATCa  >  1:2665534/1‑62 (MQ=255) gACAATCCGGTACATCGCGCAGCACCTTTCCTTAATGAATTAGTGGCTATTGAGTGGGATCa  >  1:2684628/1‑62 (MQ=255) gACAATCCGGTACATCGCGCAGCACCTTTCCTTAATGAATTAGTGGCTATTGAGTGGGATCa  >  1:2223302/1‑62 (MQ=255) gACAATCCGGTACATCGCGCAGCACCTTTCCTTAATGAATTAGTGGCTATTGAGTGGGATCa  >  1:2705629/1‑62 (MQ=255) gACAATCCGGTACATCGCGCAGCACCTTTCCTTAATGAATTAGTGGCTATTGAGTGGGATCa  >  1:275954/1‑62 (MQ=255) gACAATCCGGTACATCGCGCAGCACCTTTCCTTAATGAATTAGTGGCTATTGAGTGGGATCa  >  1:2854953/1‑62 (MQ=255) gACAATCCGGTACATCGCGCAGCACCTTTCCTTAATGAATTAGTGGCTATTGAGTGGGATCa  >  1:303169/1‑62 (MQ=255) gACAATCCGGTACATCGCGCAGCACCTTTCCTTAATGAATTAGTGGCTATTGAGTGGGATCa  >  1:512101/1‑62 (MQ=255) gACAATCCGGTACATCGCGCAGCACCTTTCCTTAATGAATTAGTGGCTATTGAGTGGGATCa  >  1:565754/1‑62 (MQ=255) gACAATCCGGTACATCGCGCAGCACCTTTCCTTAATGAATTAGTGGCTATTGAGTGGGATCa  >  1:819912/1‑62 (MQ=255) gACAATCCGGTACATCGCGCAGCACCTTTCCTTAATGAATTAGTGGCTATTGAGTGGGATCa  >  1:863100/1‑62 (MQ=255) gACAATCCGGTACATCGCGCAGCACCTTTCCTTAATGAATTAGTGGCTATTGAGTGGGATCa  >  1:966342/1‑62 (MQ=255) gACAATCCGGTACATCGCGCAGCACCTTTCCTTAATGAATTAGTGGCTATTGAGTGGGATCa  >  1:1442259/1‑62 (MQ=255) gACAATCCGGTACATCGCGCAGCACCTTTCCTTAATGAATTAGTGGCTATTGAGTGGGATCa  >  1:1029738/1‑62 (MQ=255) gACAATCCGGTACATCGCGCAGCACCTTTCCTTAATGAATTAGTGGCTATTGAGTGGGATCa  >  1:1104346/1‑62 (MQ=255) gACAATCCGGTACATCGCGCAGCACCTTTCCTTAATGAATTAGTGGCTATTGAGTGGGATCa  >  1:1116173/1‑62 (MQ=255) gACAATCCGGTACATCGCGCAGCACCTTTCCTTAATGAATTAGTGGCTATTGAGTGGGATCa  >  1:1152029/1‑62 (MQ=255) gACAATCCGGTACATCGCGCAGCACCTTTCCTTAATGAATTAGTGGCTATTGAGTGGGATCa  >  1:1228387/1‑62 (MQ=255) gACAATCCGGTACATCGCGCAGCACCTTTCCTTAATGAATTAGTGGCTATTGAGTGGGATCa  >  1:1334023/1‑62 (MQ=255) gACAATCCGGTACATCGCGCAGCACCTTTCCTTAATGAATTAGTGGCTATTGAGTGGGATCa  >  1:1354503/1‑62 (MQ=255) gACAATCCGGTACATCGCGCAGCACCTTTCCTTAATGAATTAGTGGCTATTGAGTGGGATCa  >  1:1381057/1‑62 (MQ=255) gACAATCCGGTACATCGCGCAGCACCTTTCCTTAATGAATTAGTGGCTATTGAGTGGGATCa  >  1:1384592/1‑62 (MQ=255) gACAATCCGGTACATCGCGCAGCACCTTTCCTTAATGAATTAGTGGCTATTGAGTGGGATCa  >  1:1002281/1‑62 (MQ=255) gACAATCCGGTACATCGCGCAGCACCTTTCCTTAATGAATTAGTGGCTATTGAGTGGGATCa  >  1:1591799/1‑62 (MQ=255) gACAATCCGGTACATCGCGCAGCACCTTTCCTTAATGAATTAGTGGCTATTGAGTGGGATCa  >  1:1654073/1‑62 (MQ=255) gACAATCCGGTACATCGCGCAGCACCTTTCCTTAATGAATTAGTGGCTATTGAGTGGGATCa  >  1:1860360/1‑62 (MQ=255) gACAATCCGGTACATCGCGCAGCACCTTTCCTTAATGAATTAGTGGCTATTGAGTGGGATCa  >  1:18893/1‑62 (MQ=255) gACAATCCGGTACATCGCGCAGCACCTTTCCTTAATGAATTAGTGGCTATTGAGTGGGATCa  >  1:2053375/1‑62 (MQ=255) gACAATCCGGTACATCGCGCAGCACCTTTCCTTAATGAATTAGTGGCTATTGAGTGGGATCa  >  1:209210/1‑62 (MQ=255) gACAATCCGGTACATCGCGCAGCACCTTTCCTTAATGAATTAGTGGCTATTGAGTGGGATCa  >  1:2098705/1‑62 (MQ=255) gACAATCCGGTACATCGCGCAGCACCTTTCCTTAATGAATTAGTGGCTATTGAGTGGGATCa  >  1:2114793/1‑62 (MQ=255) gACAATCCGGTACATCGCGCAGCACCTTTCCTTAATGAATTAGTGGCTATTGAGTGGGATCa  >  1:2178442/1‑62 (MQ=255)                                                              | GACAATCCGGTACATCGCGCAGCACCTTTCCTTAATGAATTAGTGGCTATTGAGTGGGATCA  >  W3110S.gb/2590863‑2590924

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑