Missing coverage evidence...
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CAATACCGTTTCTGACGCACCGCTGATTATCGGTAGCCTTGATCCCTGCTACTCCTGTACCG  >  W3110S.gb/2608645‑2608706                                                              | ctaTACCGTTTCTGACGCACCGCTGATTATCGGTAGCCTTGATCCCTGCTACTCCTGTaccg  <  1:2148346/60‑1 (MQ=255) cAATACCGTTTCTGACGCACCGCTGATTATCGGTAGCCTTGATCCCTGCTACTCCTGTaccg  <  1:2463547/62‑1 (MQ=255) cAATACCGTTTCTGACGCACCGCTGATTATCGGTAGCCTTGATCCCTGCTACTCCTGTaccg  <  1:2231620/62‑1 (MQ=255) cAATACCGTTTCTGACGCACCGCTGATTATCGGTAGCCTTGATCCCTGCTACTCCTGTaccg  <  1:2294804/62‑1 (MQ=255) cAATACCGTTTCTGACGCACCGCTGATTATCGGTAGCCTTGATCCCTGCTACTCCTGTaccg  <  1:2324093/62‑1 (MQ=255) cAATACCGTTTCTGACGCACCGCTGATTATCGGTAGCCTTGATCCCTGCTACTCCTGTaccg  <  1:2331110/62‑1 (MQ=255) cAATACCGTTTCTGACGCACCGCTGATTATCGGTAGCCTTGATCCCTGCTACTCCTGTaccg  <  1:2364150/62‑1 (MQ=255) cAATACCGTTTCTGACGCACCGCTGATTATCGGTAGCCTTGATCCCTGCTACTCCTGTaccg  <  1:238873/62‑1 (MQ=255) cAATACCGTTTCTGACGCACCGCTGATTATCGGTAGCCTTGATCCCTGCTACTCCTGTaccg  <  1:2454498/62‑1 (MQ=255) cAATACCGTTTCTGACGCACCGCTGATTATCGGTAGCCTTGATCCCTGCTACTCCTGTaccg  <  1:891446/62‑1 (MQ=255) cAATACCGTTTCTGACGCACCGCTGATTATCGGTAGCCTTGATCCCTGCTACTCCTGTaccg  <  1:2522582/62‑1 (MQ=255) cAATACCGTTTCTGACGCACCGCTGATTATCGGTAGCCTTGATCCCTGCTACTCCTGTaccg  <  1:341646/62‑1 (MQ=255) cAATACCGTTTCTGACGCACCGCTGATTATCGGTAGCCTTGATCCCTGCTACTCCTGTaccg  <  1:467642/62‑1 (MQ=255) cAATACCGTTTCTGACGCACCGCTGATTATCGGTAGCCTTGATCCCTGCTACTCCTGTaccg  <  1:499695/62‑1 (MQ=255) cAATACCGTTTCTGACGCACCGCTGATTATCGGTAGCCTTGATCCCTGCTACTCCTGTaccg  <  1:618474/62‑1 (MQ=255) cAATACCGTTTCTGACGCACCGCTGATTATCGGTAGCCTTGATCCCTGCTACTCCTGTaccg  <  1:70755/62‑1 (MQ=255) cAATACCGTTTCTGACGCACCGCTGATTATCGGTAGCCTTGATCCCTGCTACTCCTGTaccg  <  1:735135/62‑1 (MQ=255) cAATACCGTTTCTGACGCACCGCTGATTATCGGTAGCCTTGATCCCTGCTACTCCTGTaccg  <  1:1943368/62‑1 (MQ=255) cAATACCGTTTCTGACGCACCGCTGATTATCGGTAGCCTTGATCCCTGCTACTCCTGTaccg  <  1:1111270/62‑1 (MQ=255) cAATACCGTTTCTGACGCACCGCTGATTATCGGTAGCCTTGATCCCTGCTACTCCTGTaccg  <  1:1160765/62‑1 (MQ=255) cAATACCGTTTCTGACGCACCGCTGATTATCGGTAGCCTTGATCCCTGCTACTCCTGTaccg  <  1:1183400/62‑1 (MQ=255) cAATACCGTTTCTGACGCACCGCTGATTATCGGTAGCCTTGATCCCTGCTACTCCTGTaccg  <  1:1833670/62‑1 (MQ=255) cAATACCGTTTCTGACGCACCGCTGATTATCGGTAGCCTTGATCCCTGCTACTCCTGTaccg  <  1:1832235/62‑1 (MQ=255) cAATACCGTTTCTGACGCACCGCTGATTATCGGTAGCCTTGATCCCTGCTACTCCTGTaccg  <  1:1748147/62‑1 (MQ=255) cAATACCGTTTCTGACGCACCGCTGATTATCGGTAGCCTTGATCCCTGCTACTCCTGTaccg  <  1:1664297/62‑1 (MQ=255) cAATACCGTTTCTGACGCACCGCTGATTATCGGTAGCCTTGATCCCTGCTACTCCTGTaccg  <  1:1592505/62‑1 (MQ=255) cAATACCGTTTCTGACGCACCGCTGATTATCGGTAGCCTTGATCCCTGCTACTCCTGTaccg  <  1:1235204/62‑1 (MQ=255) cAATACCGTTTCTGACGCACCGCTGATTATCGGTAGCCTTGATCCCTGCTACTCCTGTaccg  <  1:12466/62‑1 (MQ=255) cAATACCGTTTCTGACGCACCGCTGATTATCGGTAGCCTTGATCCCTGCTACTCCTGTaccg  <  1:1357699/62‑1 (MQ=255) cAATACCGTGTCTGACGCACCGCTGATTATCGGTAGCCTTGATCCCTGCTACTCCTGTaccg  <  1:318067/62‑1 (MQ=255)  aaTACCGTTTCTGACGCACCGCTGATTATCGGTAGCCTTGATCCCTGCTACTCCTGTaccg  <  1:2016652/61‑1 (MQ=255)  aaTACCGTTTCTGACGCACCGCTGATTATCGGTAGCCTTGATCCCTGCTACTCCTGTaccg  <  1:1060726/61‑1 (MQ=255)  aaTACCGTTTCTGACGCACCGCTGATTATCGGTAGCCTTGATCCCTGCTACTCCTGTaccg  <  1:2400994/61‑1 (MQ=255)  aaTACCGTTTCTGACGCACCGCTGATTATCGGTAGCCTTGATCCCTGCTACTCCTGTaccg  <  1:1868272/61‑1 (MQ=255)  aaTACCGTTTCTGACGCACCGCTGATTATCGGTAGCCTTGATCCCTGCTACTCCTGTaccg  <  1:2129292/61‑1 (MQ=255)  aaTACCGTTTCTGACGCACCGCTGATTATCGGTAGCCTTGATCCCTGCTACTCCTGTaccg  <  1:2093310/61‑1 (MQ=255)  aaTACCGTTTCTGACGCACCGCTGATTATCGGTAGCCTTGATCCCTGCTACTCCTGTaccg  <  1:2054086/61‑1 (MQ=255)  aaTACCGTTTCTGACGCACCGCTGATTATCGGTAGCCTTGATCCCTGCTACTACTGTaccg  <  1:1477796/61‑1 (MQ=255)   aTACCGTTTCTGACGCACCGCTGATTATCGGTAGCCTTGATCCCTGCTACTCCTGTaccg  <  1:2519274/60‑1 (MQ=255)     aCCGTTTCTGACGCACCGCTGATTATCGGTAGCCTTGATCCCTGCTACTCCTGTaccg  <  1:1500225/58‑1 (MQ=255)       cGTTTCTGACGCACCGCTGATTATCGGTAGCCTTGATCCCTGCTACTCCTTTaccg  <  1:2584624/56‑1 (MQ=255)            cTGACGCACCGCTGATTATCGGTAGCCTTGAGCCCTGCTACTCCTGTaccg  <  1:1117704/51‑1 (MQ=255)                          aTTATCGGTAGCCTTGATCCCTGCTACTCCTGTaccg  <  1:1191467/37‑1 (MQ=255)                           ttATCGGTTGCCTTGATCCCTGCTACTCCTGTaccg  <  1:567541/36‑1 (MQ=255)                                                              | CAATACCGTTTCTGACGCACCGCTGATTATCGGTAGCCTTGATCCCTGCTACTCCTGTACCG  >  W3110S.gb/2608645‑2608706

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑