Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	2747050	2747053	4	39 [0]	[0] 3	ypjD	predicted inner membrane protein

TGCTGGTGCACATTGGCTTATCGCTCTTTTCCTATGCCACGCTAATTATCGCCGCCCTGTAC  >  W3110S.gb/2746988‑2747049                                                              | tGCTGGTGCACATTGTCTTATCGCTCTTTTCCTATGCCACGCTAATTATCGCCGCCCTGTAc  <  1:100528/62‑1 (MQ=255) tGCTGGTGCACATTGGCTTATCGCTCTTTTCCTATGCCACGCTAATTATCGCCGCCTTGTAc  <  1:1280865/62‑1 (MQ=255) tGCTGGTGCACATTGGCTTATCGCTCTTTTCCTATGCCACGCTAATTATCGCCGCCCTGTAc  <  1:362577/62‑1 (MQ=255) tGCTGGTGCACATTGGCTTATCGCTCTTTTCCTATGCCACGCTAATTATCGCCGCCCTGTAc  <  1:2422766/62‑1 (MQ=255) tGCTGGTGCACATTGGCTTATCGCTCTTTTCCTATGCCACGCTAATTATCGCCGCCCTGTAc  <  1:2487448/62‑1 (MQ=255) tGCTGGTGCACATTGGCTTATCGCTCTTTTCCTATGCCACGCTAATTATCGCCGCCCTGTAc  <  1:2554305/62‑1 (MQ=255) tGCTGGTGCACATTGGCTTATCGCTCTTTTCCTATGCCACGCTAATTATCGCCGCCCTGTAc  <  1:2565516/62‑1 (MQ=255) tGCTGGTGCACATTGGCTTATCGCTCTTTTCCTATGCCACGCTAATTATCGCCGCCCTGTAc  <  1:2583209/62‑1 (MQ=255) tGCTGGTGCACATTGGCTTATCGCTCTTTTCCTATGCCACGCTAATTATCGCCGCCCTGTAc  <  1:2666084/62‑1 (MQ=255) tGCTGGTGCACATTGGCTTATCGCTCTTTTCCTATGCCACGCTAATTATCGCCGCCCTGTAc  <  1:2672047/62‑1 (MQ=255) tGCTGGTGCACATTGGCTTATCGCTCTTTTCCTATGCCACGCTAATTATCGCCGCCCTGTAc  <  1:2908407/62‑1 (MQ=255) tGCTGGTGCACATTGGCTTATCGCTCTTTTCCTATGCCACGCTAATTATCGCCGCCCTGTAc  <  1:2400951/62‑1 (MQ=255) tGCTGGTGCACATTGGCTTATCGCTCTTTTCCTATGCCACGCTAATTATCGCCGCCCTGTAc  <  1:393614/62‑1 (MQ=255) tGCTGGTGCACATTGGCTTATCGCTCTTTTCCTATGCCACGCTAATTATCGCCGCCCTGTAc  <  1:430010/62‑1 (MQ=255) tGCTGGTGCACATTGGCTTATCGCTCTTTTCCTATGCCACGCTAATTATCGCCGCCCTGTAc  <  1:550482/62‑1 (MQ=255) tGCTGGTGCACATTGGCTTATCGCTCTTTTCCTATGCCACGCTAATTATCGCCGCCCTGTAc  <  1:68422/62‑1 (MQ=255) tGCTGGTGCACATTGGCTTATCGCTCTTTTCCTATGCCACGCTAATTATCGCCGCCCTGTAc  <  1:754903/62‑1 (MQ=255) tGCTGGTGCACATTGGCTTATCGCTCTTTTCCTATGCCACGCTAATTATCGCCGCCCTGTAc  <  1:808814/62‑1 (MQ=255) tGCTGGTGCACATTGGCTTATCGCTCTTTTCCTATGCCACGCTAATTATCGCCGCCCTGTAc  <  1:81416/62‑1 (MQ=255) tGCTGGTGCACATTGGCTTATCGCTCTTTTCCTATGCCACGCTAATTATCGCCGCCCTGTAc  <  1:946734/62‑1 (MQ=255) tGCTGGTGCACATTGGCTTATCGCTCTTTTCCTATGCCACGCTAATTATCGCCGCCCTGTAc  <  1:1700187/62‑1 (MQ=255) tGCTGGTGCACATTGGCTTATCGCTCTTTTCCTATGCCACGCTAATTATCGCCGCCCTGTAc  <  1:1060074/62‑1 (MQ=255) tGCTGGTGCACATTGGCTTATCGCTCTTTTCCTATGCCACGCTAATTATCGCCGCCCTGTAc  <  1:1060559/62‑1 (MQ=255) tGCTGGTGCACATTGGCTTATCGCTCTTTTCCTATGCCACGCTAATTATCGCCGCCCTGTAc  <  1:1086452/62‑1 (MQ=255) tGCTGGTGCACATTGGCTTATCGCTCTTTTCCTATGCCACGCTAATTATCGCCGCCCTGTAc  <  1:1229413/62‑1 (MQ=255) tGCTGGTGCACATTGGCTTATCGCTCTTTTCCTATGCCACGCTAATTATCGCCGCCCTGTAc  <  1:1377304/62‑1 (MQ=255) tGCTGGTGCACATTGGCTTATCGCTCTTTTCCTATGCCACGCTAATTATCGCCGCCCTGTAc  <  1:1634551/62‑1 (MQ=255) tGCTGGTGCACATTGGCTTATCGCTCTTTTCCTATGCCACGCTAATTATCGCCGCCCTGTAc  <  1:1694232/62‑1 (MQ=255) tGCTGGTGCACATTGGCTTATCGCTCTTTTCCTATGCCACGCTAATTATCGCCGCCCTGTAc  <  1:238073/62‑1 (MQ=255) tGCTGGTGCACATTGGCTTATCGCTCTTTTCCTATGCCACGCTAATTATCGCCGCCCTGTAc  <  1:1798030/62‑1 (MQ=255) tGCTGGTGCACATTGGCTTATCGCTCTTTTCCTATGCCACGCTAATTATCGCCGCCCTGTAc  <  1:1839383/62‑1 (MQ=255) tGCTGGTGCACATTGGCTTATCGCTCTTTTCCTATGCCACGCTAATTATCGCCGCCCTGTAc  <  1:1952997/62‑1 (MQ=255) tGCTGGTGCACATTGGCTTATCGCTCTTTTCCTATGCCACGCTAATTATCGCCGCCCTGTAc  <  1:2004381/62‑1 (MQ=255) tGCTGGTGCACATTGGCTTATCGCTCTTTTCCTATGCCACGCTAATTATCGCCGCCCTGTAc  <  1:2097319/62‑1 (MQ=255) tGCTGGTGCACATTGGCTTATCGCTCTTTTCCTATGCCACGCTAATTATCGCCGCCCTGTAc  <  1:2162611/62‑1 (MQ=255) tGCTGGTGCACATTGGCTTATCGCTCTTTTCCTATGCCACGCTAATTATCGCCGCCCTGTAc  <  1:2240/62‑1 (MQ=255) tGCTGGTGCACATCGGCTTATCGCTCTTTTCCTATGCCACGCTAATTATCGCCGCCCTGTAc  <  1:2558482/62‑1 (MQ=255)  gCTGGTGCACATTGGCTTATCGCTCTTTTCCTATGCCACGCTAATTATCGCCGCCCTGTAc  <  1:1659177/61‑1 (MQ=255)  gCTGGTGCACATTGGCTTATCGCTCTTTTCCTATGCCACGCTAATTATCGCCGCCCTGTAc  <  1:74062/61‑1 (MQ=255)                                                              | TGCTGGTGCACATTGGCTTATCGCTCTTTTCCTATGCCACGCTAATTATCGCCGCCCTGTAC  >  W3110S.gb/2746988‑2747049

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑