Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	2776857	2776861	5	26 [0]	[0] 11	ypjA	adhesin‑like autotransporter

TGATGGTCAGAACGACCAGTTCACACCAGCTACCGCGTTCCACGGGGATTCCACACCGGCA  >  W3110S.gb/2776796‑2776856                                                             | tGATGGTCAGAACGACCAGTTCACACCAGCTACCGCGTTCCACGGGGATTCCACACCGGCa  <  1:2907655/61‑1 (MQ=35) tGATGGTCAGAACGACCAGTTCACACCAGCTACCGCGTTCCACGGGGATTCCACACCGGCa  <  1:986534/61‑1 (MQ=35) tGATGGTCAGAACGACCAGTTCACACCAGCTACCGCGTTCCACGGGGATTCCACACCGGCa  <  1:927912/61‑1 (MQ=35) tGATGGTCAGAACGACCAGTTCACACCAGCTACCGCGTTCCACGGGGATTCCACACCGGCa  <  1:69518/61‑1 (MQ=35) tGATGGTCAGAACGACCAGTTCACACCAGCTACCGCGTTCCACGGGGATTCCACACCGGCa  <  1:626548/61‑1 (MQ=35) tGATGGTCAGAACGACCAGTTCACACCAGCTACCGCGTTCCACGGGGATTCCACACCGGCa  <  1:50669/61‑1 (MQ=35) tGATGGTCAGAACGACCAGTTCACACCAGCTACCGCGTTCCACGGGGATTCCACACCGGCa  <  1:386204/61‑1 (MQ=35) tGATGGTCAGAACGACCAGTTCACACCAGCTACCGCGTTCCACGGGGATTCCACACCGGCa  <  1:339916/61‑1 (MQ=35) tGATGGTCAGAACGACCAGTTCACACCAGCTACCGCGTTCCACGGGGATTCCACACCGGCa  <  1:2922229/61‑1 (MQ=35) tGATGGTCAGAACGACCAGTTCACACCAGCTACCGCGTTCCACGGGGATTCCACACCGGCa  <  1:2915708/61‑1 (MQ=35) tGATGGTCAGAACGACCAGTTCACACCAGCTACCGCGTTCCACGGGGATTCCACACCGGCa  <  1:2908910/61‑1 (MQ=35) tGATGGTCAGAACGACCAGTTCACACCAGCTACCGCGTTCCACGGGGATTCCACACCGGCa  <  1:1221649/61‑1 (MQ=35) tGATGGTCAGAACGACCAGTTCACACCAGCTACCGCGTTCCACGGGGATTCCACACCGGCa  <  1:2731498/61‑1 (MQ=35) tGATGGTCAGAACGACCAGTTCACACCAGCTACCGCGTTCCACGGGGATTCCACACCGGCa  <  1:2615232/61‑1 (MQ=35) tGATGGTCAGAACGACCAGTTCACACCAGCTACCGCGTTCCACGGGGATTCCACACCGGCa  <  1:260158/61‑1 (MQ=35) tGATGGTCAGAACGACCAGTTCACACCAGCTACCGCGTTCCACGGGGATTCCACACCGGCa  <  1:2570716/61‑1 (MQ=35) tGATGGTCAGAACGACCAGTTCACACCAGCTACCGCGTTCCACGGGGATTCCACACCGGCa  <  1:2527935/61‑1 (MQ=35) tGATGGTCAGAACGACCAGTTCACACCAGCTACCGCGTTCCACGGGGATTCCACACCGGCa  <  1:2053812/61‑1 (MQ=35) tGATGGTCAGAACGACCAGTTCACACCAGCTACCGCGTTCCACGGGGATTCCACACCGGCa  <  1:1841924/61‑1 (MQ=35) tGATGGTCAGAACGACCAGTTCACACCAGCTACCGCGTTCCACGGGGATTCCACACCGGCa  <  1:1644709/61‑1 (MQ=35) tGATGGTCAGAACGACCAGTTCACACCAGCTACCGCGTTCCACGGGGATTCCACACCGGCa  <  1:1524140/61‑1 (MQ=35) tGATGGTCAGAACGACCAGTTCACACCAGCTACCGCGTTCCACGGGGATTCCACACCGGCa  <  1:1499401/61‑1 (MQ=35) tGATGGTCAGAACGACCAGTTCACACCAGCTACCGCGTTCCACGGGGATTCCACACCGGCa  <  1:1422148/61‑1 (MQ=35) tGATGGTCAGAACGACCAGTTCACACCAGCTACCGCGTTCCACGGGGATTCCACACCGGCa  <  1:1273768/61‑1 (MQ=35)  gATGGTCAGAACGACCAGTTCACACCAGCTACCGCGTTCCACGGGGATTCCACACCGGCa  <  1:842435/60‑1 (MQ=35)                     tCACACCAGCTACCGCGTTCCACGGGGATTCCACACCGGCa  <  1:475726/41‑1 (MQ=38)                                                             | TGATGGTCAGAACGACCAGTTCACACCAGCTACCGCGTTCCACGGGGATTCCACACCGGCA  >  W3110S.gb/2776796‑2776856

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑