Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	2788033	2788046	14	41 [0]	[0] 48	ygaT	hypothetical protein

ATGGTGAAGCTGGCGACGGCGGTGGCGCATCTGATTGGCCGTTCCAATTTCGATGCGATGAG  >  W3110S.gb/2787971‑2788032                                                              | aTGGTGAAGCTGGCGACGGCGGTGGCGCATCTGATTGGCCGTTCCAATTTCGATGCGATGAg  <  1:292563/62‑1 (MQ=255) aTGGTGAAGCTGGCGACGGCGGTGGCGCATCTGATTGGCCGTTCCAATTTCGATGCGATGAg  <  1:2352667/62‑1 (MQ=255) aTGGTGAAGCTGGCGACGGCGGTGGCGCATCTGATTGGCCGTTCCAATTTCGATGCGATGAg  <  1:2448377/62‑1 (MQ=255) aTGGTGAAGCTGGCGACGGCGGTGGCGCATCTGATTGGCCGTTCCAATTTCGATGCGATGAg  <  1:251524/62‑1 (MQ=255) aTGGTGAAGCTGGCGACGGCGGTGGCGCATCTGATTGGCCGTTCCAATTTCGATGCGATGAg  <  1:254731/62‑1 (MQ=255) aTGGTGAAGCTGGCGACGGCGGTGGCGCATCTGATTGGCCGTTCCAATTTCGATGCGATGAg  <  1:2567485/62‑1 (MQ=255) aTGGTGAAGCTGGCGACGGCGGTGGCGCATCTGATTGGCCGTTCCAATTTCGATGCGATGAg  <  1:2603516/62‑1 (MQ=255) aTGGTGAAGCTGGCGACGGCGGTGGCGCATCTGATTGGCCGTTCCAATTTCGATGCGATGAg  <  1:2625713/62‑1 (MQ=255) aTGGTGAAGCTGGCGACGGCGGTGGCGCATCTGATTGGCCGTTCCAATTTCGATGCGATGAg  <  1:2714939/62‑1 (MQ=255) aTGGTGAAGCTGGCGACGGCGGTGGCGCATCTGATTGGCCGTTCCAATTTCGATGCGATGAg  <  1:2786596/62‑1 (MQ=255) aTGGTGAAGCTGGCGACGGCGGTGGCGCATCTGATTGGCCGTTCCAATTTCGATGCGATGAg  <  1:2435250/62‑1 (MQ=255) aTGGTGAAGCTGGCGACGGCGGTGGCGCATCTGATTGGCCGTTCCAATTTCGATGCGATGAg  <  1:473546/62‑1 (MQ=255) aTGGTGAAGCTGGCGACGGCGGTGGCGCATCTGATTGGCCGTTCCAATTTCGATGCGATGAg  <  1:486984/62‑1 (MQ=255) aTGGTGAAGCTGGCGACGGCGGTGGCGCATCTGATTGGCCGTTCCAATTTCGATGCGATGAg  <  1:584455/62‑1 (MQ=255) aTGGTGAAGCTGGCGACGGCGGTGGCGCATCTGATTGGCCGTTCCAATTTCGATGCGATGAg  <  1:590683/62‑1 (MQ=255) aTGGTGAAGCTGGCGACGGCGGTGGCGCATCTGATTGGCCGTTCCAATTTCGATGCGATGAg  <  1:632457/62‑1 (MQ=255) aTGGTGAAGCTGGCGACGGCGGTGGCGCATCTGATTGGCCGTTCCAATTTCGATGCGATGAg  <  1:636418/62‑1 (MQ=255) aTGGTGAAGCTGGCGACGGCGGTGGCGCATCTGATTGGCCGTTCCAATTTCGATGCGATGAg  <  1:680960/62‑1 (MQ=255) aTGGTGAAGCTGGCGACGGCGGTGGCGCATCTGATTGGCCGTTCCAATTTCGATGCGATGAg  <  1:764443/62‑1 (MQ=255) aTGGTGAAGCTGGCGACGGCGGTGGCGCATCTGATTGGCCGTTCCAATTTCGATGCGATGAg  <  1:1317900/62‑1 (MQ=255) aTGGTGAAGCTGGCGACGGCGGTGGCGCATCTGATTGGCCGTTCCAATTTCGATGCGATGAg  <  1:2172290/62‑1 (MQ=255) aTGGTGAAGCTGGCGACGGCGGTGGCGCATCTGATTGGCCGTTCCAATTTCGATGCGATGAg  <  1:2117058/62‑1 (MQ=255) aTGGTGAAGCTGGCGACGGCGGTGGCGCATCTGATTGGCCGTTCCAATTTCGATGCGATGAg  <  1:1895517/62‑1 (MQ=255) aTGGTGAAGCTGGCGACGGCGGTGGCGCATCTGATTGGCCGTTCCAATTTCGATGCGATGAg  <  1:1591712/62‑1 (MQ=255) aTGGTGAAGCTGGCGACGGCGGTGGCGCATCTGATTGGCCGTTCCAATTTCGATGCGATGAg  <  1:1565775/62‑1 (MQ=255) aTGGTGAAGCTGGCGACGGCGGTGGCGCATCTGATTGGCCGTTCCAATTTCGATGCGATGAg  <  1:151711/62‑1 (MQ=255) aTGGTGAAGCTGGCGACGGCGGTGGCGCATCTGATTGGCCGTTCCAATTTCGATGCGATGAg  <  1:1378489/62‑1 (MQ=255)  tGGTGAAGCTGGCGACGGCGGTGGCGCATCTGATTGGCCGTTCCAATTTCGATGCGATGAg  <  1:1347059/61‑1 (MQ=255)  tGGTGAAGCTGGCGACGGCGGTGGCGCATCTGATTGGCCGTTCCAATTTCGATGCGATGAg  <  1:685151/61‑1 (MQ=255)  tGGTGAAGCTGGCGACGGCGGTGGCGCATCTGATTGGCCGTTCCAATTTCGATGCGATGAg  <  1:1349921/61‑1 (MQ=255)  tGGTGAAGCTGGCGACGGCGGTGGCGCATCTGATTGGCCGTTCCAATTTCGATGCGATGAg  <  1:614169/61‑1 (MQ=255)  tGGTGAAGCTGGCGACGGCGGTGGCGCATCTGATTGGCCGTTCCAATTTCGATGCGATGAg  <  1:1492416/61‑1 (MQ=255)  tGGTGAAGCTGGCGACGGCGGTGGCGCATCTGATTGGCCGTTCCAATTTCGATGCGATGAg  <  1:1431824/61‑1 (MQ=255)  tGGTGAAGCTGGCGACGGCGGTGGCGCATCTGATTGGCCGTTCCAATTTCGATGCGATGAg  <  1:1388180/61‑1 (MQ=255)   ggTGAAGCTGTCGACGGCGGTGGCGCATCTGATTGGCCGTTCCAATTTCGATGCGATGAg  <  1:2300810/60‑1 (MQ=255)    gTGAAGCTGGCGACGGCGGTGGCGCATCTGATTGGCCGTTCCAATTTCGATGCGATGAg  <  1:212034/59‑1 (MQ=255)      gAAGCTGGCGACGTCGGTGGCGCATCTGATTGGCCGTTCCAATTTCGATGCGATGAg  <  1:1642534/57‑1 (MQ=255)       aaGCTGGCGAGGGCGGTGGCGCATCTGATTGGCCGTTCCAATTTCGATGCGATGAg  <  1:2865446/56‑1 (MQ=255)          cTGGCGACGGCGGTGGCGCATCTGATTGGCCGTTCCAATTTCGATGCGATGAg  <  1:1268726/53‑1 (MQ=255)                aCGGCGGTGGCGCATCTGATTGGCCGTTCCAATTTCGATGCGATGAg  <  1:1020308/47‑1 (MQ=255)                         gcgcATCTGATTGGCCGTTCCAATTTCGATGCGATGAg  <  1:2005642/38‑1 (MQ=255)                                                              | ATGGTGAAGCTGGCGACGGCGGTGGCGCATCTGATTGGCCGTTCCAATTTCGATGCGATGAG  >  W3110S.gb/2787971‑2788032

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑