Missing coverage evidence...
   seq id start end size ←reads reads→ gene description
* * ÷ W3110S.gb 94690 94799 110 39 [0] [1] 11 murF UDP‑N‑acetylmuramoyl‑tripeptide:D‑alanyl‑D‑ alanine ligase

GCGTCTGCTGGGGGTGATTGCATGATTAGCGTAACCCTTAGCCAACTTACCGACATTCTCA  >  W3110S.gb/94629‑94689
                                                            |
tcgTCTTCTGGGGGTGATTGCATGATTAGCGTAACCCTTAGCCAACTTACCGACATTCTCa  <  1:1152579/60‑1 (MQ=255)
gcgTCTGCTGGGGGTGATTGCATGATTAGCGTAACCCTTAGCCAGCTTACCGACATTCTCa  <  1:1852354/61‑1 (MQ=255)
gcgTCTGCTGGGGGTGATTGCATGATTAGCGTAACCCTTAGCCAACTTACCGACATTCTCa  <  1:379274/61‑1 (MQ=255)
gcgTCTGCTGGGGGTGATTGCATGATTAGCGTAACCCTTAGCCAACTTACCGACATTCTCa  <  1:2596178/61‑1 (MQ=255)
gcgTCTGCTGGGGGTGATTGCATGATTAGCGTAACCCTTAGCCAACTTACCGACATTCTCa  <  1:2603389/61‑1 (MQ=255)
gcgTCTGCTGGGGGTGATTGCATGATTAGCGTAACCCTTAGCCAACTTACCGACATTCTCa  <  1:2614174/61‑1 (MQ=255)
gcgTCTGCTGGGGGTGATTGCATGATTAGCGTAACCCTTAGCCAACTTACCGACATTCTCa  <  1:2732730/61‑1 (MQ=255)
gcgTCTGCTGGGGGTGATTGCATGATTAGCGTAACCCTTAGCCAACTTACCGACATTCTCa  <  1:2793367/61‑1 (MQ=255)
gcgTCTGCTGGGGGTGATTGCATGATTAGCGTAACCCTTAGCCAACTTACCGACATTCTCa  <  1:2843579/61‑1 (MQ=255)
gcgTCTGCTGGGGGTGATTGCATGATTAGCGTAACCCTTAGCCAACTTACCGACATTCTCa  <  1:304965/61‑1 (MQ=255)
gcgTCTGCTGGGGGTGATTGCATGATTAGCGTAACCCTTAGCCAACTTACCGACATTCTCa  <  1:316146/61‑1 (MQ=255)
gcgTCTGCTGGGGGTGATTGCATGATTAGCGTAACCCTTAGCCAACTTACCGACATTCTCa  <  1:366919/61‑1 (MQ=255)
gcgTCTGCTGGGGGTGATTGCATGATTAGCGTAACCCTTAGCCAACTTACCGACATTCTCa  <  1:2508470/61‑1 (MQ=255)
gcgTCTGCTGGGGGTGATTGCATGATTAGCGTAACCCTTAGCCAACTTACCGACATTCTCa  <  1:534994/61‑1 (MQ=255)
gcgTCTGCTGGGGGTGATTGCATGATTAGCGTAACCCTTAGCCAACTTACCGACATTCTCa  <  1:542401/61‑1 (MQ=255)
gcgTCTGCTGGGGGTGATTGCATGATTAGCGTAACCCTTAGCCAACTTACCGACATTCTCa  <  1:598513/61‑1 (MQ=255)
gcgTCTGCTGGGGGTGATTGCATGATTAGCGTAACCCTTAGCCAACTTACCGACATTCTCa  <  1:726379/61‑1 (MQ=255)
gcgTCTGCTGGGGGTGATTGCATGATTAGCGTAACCCTTAGCCAACTTACCGACATTCTCa  <  1:747394/61‑1 (MQ=255)
gcgTCTGCTGGGGGTGATTGCATGATTAGCGTAACCCTTAGCCAACTTACCGACATTCTCa  <  1:782701/61‑1 (MQ=255)
gcgTCTGCTGGGGGTGATTGCATGATTAGCGTAACCCTTAGCCAACTTACCGACATTCTCa  <  1:862962/61‑1 (MQ=255)
gcgTCTGCTGGGGGTGATTGCATGATTAGCGTAACCCTTAGCCAACTTACCGACATTCTCa  <  1:990262/61‑1 (MQ=255)
gcgTCTGCTGGGGGTGATTGCATGATTAGCGTAACCCTTAGCCAACTTACCGACATTCTCa  <  1:1935004/61‑1 (MQ=255)
gcgTCTGCTGGGGGTGATTGCATGATTAGCGTAACCCTTAGCCAACTTACCGACATTCTCa  <  1:12505/61‑1 (MQ=255)
gcgTCTGCTGGGGGTGATTGCATGATTAGCGTAACCCTTAGCCAACTTACCGACATTCTCa  <  1:1353540/61‑1 (MQ=255)
gcgTCTGCTGGGGGTGATTGCATGATTAGCGTAACCCTTAGCCAACTTACCGACATTCTCa  <  1:144927/61‑1 (MQ=255)
gcgTCTGCTGGGGGTGATTGCATGATTAGCGTAACCCTTAGCCAACTTACCGACATTCTCa  <  1:1513300/61‑1 (MQ=255)
gcgTCTGCTGGGGGTGATTGCATGATTAGCGTAACCCTTAGCCAACTTACCGACATTCTCa  <  1:1676155/61‑1 (MQ=255)
gcgTCTGCTGGGGGTGATTGCATGATTAGCGTAACCCTTAGCCAACTTACCGACATTCTCa  <  1:1699772/61‑1 (MQ=255)
gcgTCTGCTGGGGGTGATTGCATGATTAGCGTAACCCTTAGCCAACTTACCGACATTCTCa  <  1:1803237/61‑1 (MQ=255)
gcgTCTGCTGGGGGTGATTGCATGATTAGCGTAACCCTTAGCCAACTTACCGACATTCTCa  <  1:1933224/61‑1 (MQ=255)
gcgTCTGCTGGGGGTGATTGCATGATTAGCGTAACCCTTAGCCAACTTACCGACATTCTCa  <  1:1939983/61‑1 (MQ=255)
gcgTCTGCTGGGGGTGATTGCATGATTAGCGTAACCCTTAGCCAACTTACCGACATTCTCa  <  1:2165260/61‑1 (MQ=255)
gcgTCTGCTGGGGGTGATTGCATGATTAGCGTAACCCTTAGCCAACTTACCGACATTCTCa  <  1:2206250/61‑1 (MQ=255)
gcgTCTGCTGGGGGTGATTGCATGATTAGCGTAACCCTTAGCCAACTTACCGACATTCTCa  <  1:2257461/61‑1 (MQ=255)
gcgTCTGCTGGGGGTGATTGCATGATTAGCGTAACCCTTAGCCAACTTACCGACATTCTCa  <  1:2268470/61‑1 (MQ=255)
gcgTCTGCTGGGGGTGATTGCATGATTAGCGTAACCCTTAGCCAACTTACCGACATTCTCa  <  1:2410039/61‑1 (MQ=255)
gcgTCTGCTGGGGGTGATTGCATGATTAGCGTAACCCTTAGCCAACTTACCGACATTCTCa  <  1:2441067/61‑1 (MQ=255)
gcgTCTGCTGGGGGTGATTGCATGATTAGCGTAACCCTTAGCCAACTTACCGACATTCTCa  <  1:246708/61‑1 (MQ=255)
                aTTGCATGATTAGCGTAACCCTTAGCCAACTTACCGACATTCTCa  <  1:2569619/45‑1 (MQ=255)
                                                            |
GCGTCTGCTGGGGGTGATTGCATGATTAGCGTAACCCTTAGCCAACTTACCGACATTCTCA  >  W3110S.gb/94629‑94689

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap:     Deleted base: