Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	2988506	2988508	3	41 [0]	[0] 4	yqeJ/yqeK	hypothetical protein/hypothetical protein

CTAAAATAGATAACAAAAAGATGGAACCTCGTTAATCATAAAACAATAAAATTAAATATTCT  >  W3110S.gb/2988444‑2988505                                                              | cTAAAATAGATAACAAAAAGATGGAACCTCGTTAATCATAAAACAATAAAATTAAATATtct  <  1:1080594/62‑1 (MQ=255) cTAAAATAGATAACAAAAAGATGGAACCTCGTTAATCATAAAACAATAAAATTAAATATtct  <  1:942397/62‑1 (MQ=255) cTAAAATAGATAACAAAAAGATGGAACCTCGTTAATCATAAAACAATAAAATTAAATATtct  <  1:828639/62‑1 (MQ=255) cTAAAATAGATAACAAAAAGATGGAACCTCGTTAATCATAAAACAATAAAATTAAATATtct  <  1:812101/62‑1 (MQ=255) cTAAAATAGATAACAAAAAGATGGAACCTCGTTAATCATAAAACAATAAAATTAAATATtct  <  1:756812/62‑1 (MQ=255) cTAAAATAGATAACAAAAAGATGGAACCTCGTTAATCATAAAACAATAAAATTAAATATtct  <  1:688394/62‑1 (MQ=255) cTAAAATAGATAACAAAAAGATGGAACCTCGTTAATCATAAAACAATAAAATTAAATATtct  <  1:659869/62‑1 (MQ=255) cTAAAATAGATAACAAAAAGATGGAACCTCGTTAATCATAAAACAATAAAATTAAATATtct  <  1:618010/62‑1 (MQ=255) cTAAAATAGATAACAAAAAGATGGAACCTCGTTAATCATAAAACAATAAAATTAAATATtct  <  1:463969/62‑1 (MQ=255) cTAAAATAGATAACAAAAAGATGGAACCTCGTTAATCATAAAACAATAAAATTAAATATtct  <  1:2912419/62‑1 (MQ=255) cTAAAATAGATAACAAAAAGATGGAACCTCGTTAATCATAAAACAATAAAATTAAATATtct  <  1:2912395/62‑1 (MQ=255) cTAAAATAGATAACAAAAAGATGGAACCTCGTTAATCATAAAACAATAAAATTAAATATtct  <  1:2837535/62‑1 (MQ=255) cTAAAATAGATAACAAAAAGATGGAACCTCGTTAATCATAAAACAATAAAATTAAATATtct  <  1:2825198/62‑1 (MQ=255) cTAAAATAGATAACAAAAAGATGGAACCTCGTTAATCATAAAACAATAAAATTAAATATtct  <  1:2819796/62‑1 (MQ=255) cTAAAATAGATAACAAAAAGATGGAACCTCGTTAATCATAAAACAATAAAATTAAATATtct  <  1:232887/62‑1 (MQ=255) cTAAAATAGATAACAAAAAGATGGAACCTCGTTAATCATAAAACAATAAAATTAAATATtct  <  1:2268718/62‑1 (MQ=255) cTAAAATAGATAACAAAAAGATGGAACCTCGTTAATCATAAAACAATAAAATTAAATATtct  <  1:1699085/62‑1 (MQ=255) cTAAAATAGATAACAAAAAGATGGAACCTCGTTAATCATAAAACAATAAAATTAAATATtct  <  1:1272236/62‑1 (MQ=255) cTAAAATAGATAACAAAAAGATGGAACCTCGTTAATCATAAAACAATAAAATTAAATATtct  <  1:1332711/62‑1 (MQ=255) cTAAAATAGATAACAAAAAGATGGAACCTCGTTAATCATAAAACAATAAAATTAAATATtct  <  1:1354218/62‑1 (MQ=255) cTAAAATAGATAACAAAAAGATGGAACCTCGTTAATCATAAAACAATAAAATTAAATATtct  <  1:1391140/62‑1 (MQ=255) cTAAAATAGATAACAAAAAGATGGAACCTCGTTAATCATAAAACAATAAAATTAAATATtct  <  1:1411910/62‑1 (MQ=255) cTAAAATAGATAACAAAAAGATGGAACCTCGTTAATCATAAAACAATAAAATTAAATATtct  <  1:1459958/62‑1 (MQ=255) cTAAAATAGATAACAAAAAGATGGAACCTCGTTAATCATAAAACAATAAAATTAAATATtct  <  1:1473559/62‑1 (MQ=255) cTAAAATAGATAACAAAAAGATGGAACCTCGTTAATCATAAAACAATAAAATTAAATATtct  <  1:1497215/62‑1 (MQ=255) cTAAAATAGATAACAAAAAGATGGAACCTCGTTAATCATAAAACAATAAAATTAAATATtct  <  1:1123184/62‑1 (MQ=255) cTAAAATAGATAACAAAAAGATGGAACCTCGTTAATCATAAAACAATAAAATTAAATATtct  <  1:1116257/62‑1 (MQ=255) cTAAAATAGATAACAAAAAGATGGAACCTCGTTAATCATAAAACAATAAAATTAAATATtct  <  1:1103594/62‑1 (MQ=255) cTAAAATAGATAACAAAAAGATGGAACCTCGTTAATCATAAAACAATAAAATTAAATATtct  <  1:1731306/62‑1 (MQ=255) cTAAAATAGATAACAAAAAGATGGAACCTCGTTAATCATAAAACAATAAAATTAAATATtct  <  1:190691/62‑1 (MQ=255) cTAAAATAGATAACAAAAAGATGGAACCTCGTTAATCATAAAACAATAAAATTAAATATtct  <  1:1044000/62‑1 (MQ=255)   aaaaTAGATAACAAAAAGATGGATCCTCGTTAATCATAAAACAATAAAATTAAATATtct  >  1:2697295/1‑60 (MQ=255)   aaaaTAGATAACAAAAAGATGGAACCTCGTTAATCATAAAACAATAAAATTAAATATtct  >  1:2859948/1‑60 (MQ=255)   aaaaTAGATAACAAAAAGATGGAACCTCGTTAATCATAAAACAATAAAATTAAATATtct  >  1:747396/1‑60 (MQ=255)   aaaaTAGATAACAAAAAGATGGAACCTCGTTAATCATAAAACAATAAAATTAAATATtct  >  1:698960/1‑60 (MQ=255)   aaaaTAGATAACAAAAAGATGGAACCTCGTTAATCATAAAACAATAAAATTAAATATtct  >  1:1999103/1‑60 (MQ=255)   aaaaTAGATAACAAAAAGATGGAACCTCGTTAATCATAAAACAATAAAATTAAATATtct  >  1:2817189/1‑60 (MQ=255)   aaaaTAGATAACAAAAAGATGGAACCTCGTTAATCATAAAACAATAAAATTAAATATtct  >  1:2625945/1‑60 (MQ=255)   aaaaTAGATAACAAAAAGATGGAACCTCGTTAATCATAAAACAATAAAATTAAATATtct  >  1:2577987/1‑60 (MQ=255)   aaaaTAGATAACAAAAAGATGGAACCTCGTTAATCATAAAACAATAAAATTAAATATtct  >  1:2332160/1‑60 (MQ=255)   aaaaTAGATAACAAAAAGATGGAACCTCGTTAATCATAAAACAATAAAATTAAATATtct  >  1:2046680/1‑60 (MQ=255)                                                              | CTAAAATAGATAACAAAAAGATGGAACCTCGTTAATCATAAAACAATAAAATTAAATATTCT  >  W3110S.gb/2988444‑2988505

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑