Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	3042237	3042267	31	14 [0]	[0] 4	yqfB	conserved hypothetical protein

CGTTTTGAAGTGCGATTCAGACTCGTCGCGGATGGTGATGGTTTTACGCCCAGCCAGAATGT  >  W3110S.gb/3042175‑3042236                                                              | cGTTTTGAAGTGCGATTCAGACTCGTCGCGGATGGTGATGGTTTTACGCCCAGCCAGAATGt  >  1:1040139/1‑62 (MQ=255) cGTTTTGAAGTGCGATTCAGACTCGTCGCGGATGGTGATGGTTTTACGCCCAGCCAGAATGt  >  1:1046608/1‑62 (MQ=255) cGTTTTGAAGTGCGATTCAGACTCGTCGCGGATGGTGATGGTTTTACGCCCAGCCAGAATGt  >  1:161391/1‑62 (MQ=255) cGTTTTGAAGTGCGATTCAGACTCGTCGCGGATGGTGATGGTTTTACGCCCAGCCAGAATGt  >  1:1905508/1‑62 (MQ=255) cGTTTTGAAGTGCGATTCAGACTCGTCGCGGATGGTGATGGTTTTACGCCCAGCCAGAATGt  >  1:2091946/1‑62 (MQ=255) cGTTTTGAAGTGCGATTCAGACTCGTCGCGGATGGTGATGGTTTTACGCCCAGCCAGAATGt  >  1:2198924/1‑62 (MQ=255) cGTTTTGAAGTGCGATTCAGACTCGTCGCGGATGGTGATGGTTTTACGCCCAGCCAGAATGt  >  1:2220590/1‑62 (MQ=255) cGTTTTGAAGTGCGATTCAGACTCGTCGCGGATGGTGATGGTTTTACGCCCAGCCAGAATGt  >  1:2348435/1‑62 (MQ=255) cGTTTTGAAGTGCGATTCAGACTCGTCGCGGATGGTGATGGTTTTACGCCCAGCCAGAATGt  >  1:258365/1‑62 (MQ=255) cGTTTTGAAGTGCGATTCAGACTCGTCGCGGATGGTGATGGTTTTACGCCCAGCCAGAATGt  >  1:258583/1‑62 (MQ=255) cGTTTTGAAGTGCGATTCAGACTCGTCGCGGATGGTGATGGTTTTACGCCCAGCCAGAATGt  >  1:2612450/1‑62 (MQ=255) cGTTTTGAAGTGCGATTCAGACTCGTCGCGGATGGTGATGGTTTTACGCCCAGCCAGAATGt  >  1:2811399/1‑62 (MQ=255) cGTTTTGAAGTGCGATTCAGACTCGTCGCGGATGGTGATGGTTTTACGCCCAGCCAGAATGt  >  1:2837023/1‑62 (MQ=255) cGTTTTGAAGTGCGATTCAGACTCGTCGCGGATGGTGATGGTTTTACGCCCAGCCAGAATGt  >  1:801265/1‑62 (MQ=255)                                                              | CGTTTTGAAGTGCGATTCAGACTCGTCGCGGATGGTGATGGTTTTACGCCCAGCCAGAATGT  >  W3110S.gb/3042175‑3042236

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑