Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	3090437	3090438	2	26 [0]	[0] 5	yggJ	hypothetical protein

CAGATGAAATTGCCATGACTGCCCGCTATCAATTTACTGATATCCT  >  W3110S.gb/3090391‑3090436                                              | cAGATGAAATTGCCATGACTGCCCGCTATCAATTTACTGATATCCt  >  1:2194634/1‑46 (MQ=255) cAGATGAAATTGCCATGACTGCCCGCTATCAATTTACTGATATCCt  >  1:910477/1‑46 (MQ=255) cAGATGAAATTGCCATGACTGCCCGCTATCAATTTACTGATATCCt  >  1:880317/1‑46 (MQ=255) cAGATGAAATTGCCATGACTGCCCGCTATCAATTTACTGATATCCt  >  1:762397/1‑46 (MQ=255) cAGATGAAATTGCCATGACTGCCCGCTATCAATTTACTGATATCCt  >  1:650572/1‑46 (MQ=255) cAGATGAAATTGCCATGACTGCCCGCTATCAATTTACTGATATCCt  >  1:625564/1‑46 (MQ=255) cAGATGAAATTGCCATGACTGCCCGCTATCAATTTACTGATATCCt  >  1:622011/1‑46 (MQ=255) cAGATGAAATTGCCATGACTGCCCGCTATCAATTTACTGATATCCt  >  1:389029/1‑46 (MQ=255) cAGATGAAATTGCCATGACTGCCCGCTATCAATTTACTGATATCCt  >  1:2906788/1‑46 (MQ=255) cAGATGAAATTGCCATGACTGCCCGCTATCAATTTACTGATATCCt  >  1:2754597/1‑46 (MQ=255) cAGATGAAATTGCCATGACTGCCCGCTATCAATTTACTGATATCCt  >  1:2482650/1‑46 (MQ=255) cAGATGAAATTGCCATGACTGCCCGCTATCAATTTACTGATATCCt  >  1:2475214/1‑46 (MQ=255) cAGATGAAATTGCCATGACTGCCCGCTATCAATTTACTGATATCCt  >  1:1245348/1‑46 (MQ=255) cAGATGAAATTGCCATGACTGCCCGCTATCAATTTACTGATATCCt  >  1:2080577/1‑46 (MQ=255) cAGATGAAATTGCCATGACTGCCCGCTATCAATTTACTGATATCCt  >  1:2002929/1‑46 (MQ=255) cAGATGAAATTGCCATGACTGCCCGCTATCAATTTACTGATATCCt  >  1:1983768/1‑46 (MQ=255) cAGATGAAATTGCCATGACTGCCCGCTATCAATTTACTGATATCCt  >  1:1796132/1‑46 (MQ=255) cAGATGAAATTGCCATGACTGCCCGCTATCAATTTACTGATATCCt  >  1:1716370/1‑46 (MQ=255) cAGATGAAATTGCCATGACTGCCCGCTATCAATTTACTGATATCCt  >  1:1595558/1‑46 (MQ=255) cAGATGAAATTGCCATGACTGCCCGCTATCAATTTACTGATATCCt  >  1:1576740/1‑46 (MQ=255) cAGATGAAATTGCCATGACTGCCCGCTATCAATTTACTGATATCCt  >  1:1550744/1‑46 (MQ=255) cAGATGAAATTGCCATGACTGCCCGCTATCAATTTACTGATATCCt  >  1:154613/1‑46 (MQ=255) cAGATGAAATTGCCATGACTGCCCGCTATCAATTTACTGATATCCt  >  1:1462065/1‑46 (MQ=255) cAGATGAAATTGCCATGACTGCCCGCTATCAATTTACTGATATCCt  >  1:1330551/1‑46 (MQ=255) cAGATGAAATTGCCATGACTGCCCGCTATCAATTTACTGATATCCt  >  1:1263332/1‑46 (MQ=255) cAGATGAAATT‑CCATGACTGCCCGCTATCAATTTACTGATATCCt  >  1:2795377/1‑45 (MQ=38)                                              | CAGATGAAATTGCCATGACTGCCCGCTATCAATTTACTGATATCCT  >  W3110S.gb/3090391‑3090436

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑