Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	3097960	3097965	6	19 [0]	[1] 13	yggM	conserved hypothetical protein

CGTTCCTTTACTGGTTAACATCGCCGAGAATTTTACCGGTTTATCTTTCGTCCAGGTCTGTT  >  W3110S.gb/3097898‑3097959                                                              | cGTTGCTTTACTGGTTTACATCGCCGAGAATTTTACCGGTTTATCTTTCGTCCAGGTCTGtt  <  1:692483/62‑1 (MQ=255) cGTTCCTTTACTGGTTAACATCGCCGAGAATTTTACCGGTTTATCTTTCGTCCATGTCTGtt  <  1:1765326/62‑1 (MQ=255) cGTTCCTTTACTGGTTAACATCGCCGAGAATTTTACCGGTTTATCTTTCGTCCAGGTCTGtt  <  1:2126555/62‑1 (MQ=255) cGTTCCTTTACTGGTTAACATCGCCGAGAATTTTACCGGTTTATCTTTCGTCCAGGTCTGtt  <  1:97418/62‑1 (MQ=255) cGTTCCTTTACTGGTTAACATCGCCGAGAATTTTACCGGTTTATCTTTCGTCCAGGTCTGtt  <  1:7261/62‑1 (MQ=255) cGTTCCTTTACTGGTTAACATCGCCGAGAATTTTACCGGTTTATCTTTCGTCCAGGTCTGtt  <  1:660857/62‑1 (MQ=255) cGTTCCTTTACTGGTTAACATCGCCGAGAATTTTACCGGTTTATCTTTCGTCCAGGTCTGtt  <  1:479287/62‑1 (MQ=255) cGTTCCTTTACTGGTTAACATCGCCGAGAATTTTACCGGTTTATCTTTCGTCCAGGTCTGtt  <  1:2504099/62‑1 (MQ=255) cGTTCCTTTACTGGTTAACATCGCCGAGAATTTTACCGGTTTATCTTTCGTCCAGGTCTGtt  <  1:2298531/62‑1 (MQ=255) cGTTCCTTTACTGGTTAACATCGCCGAGAATTTTACCGGTTTATCTTTCGTCCAGGTCTGtt  <  1:2244100/62‑1 (MQ=255) cGTTCCTTTACTGGTTAACATCGCCGAGAATTTTACCGGTTTATCTTTCGTCCAGGTCTGtt  <  1:1858802/62‑1 (MQ=255) cGTTCCTTTACTGGTTAACATCGCCGAGAATTTTACCGGTTTATCTTTCGTCCAGGTCTGtt  <  1:1804059/62‑1 (MQ=255) cGTTCCTTTACTGGTTAACATCGCCGAGAATTTTACCGGTTTATCTTTCGTCCAGGTCTGtt  <  1:1764702/62‑1 (MQ=255) cGTTCCTTTACTGGTTAACATCGCCGAGAATTTTACCGGTTTATCTTTCGTCCAGGTCTGtt  <  1:1538082/62‑1 (MQ=255) cGTTCCTTTACTGGTTAACATCGCCGAGAATTTTACCGGTTTATCTTTCGTCCAGGTCTGtt  <  1:1498372/62‑1 (MQ=255) cGTTCCTTTACTGGTTAACATCGCCGAGAATTTTACCGGTTTATCTTTCGTCCAGGTCTGtt  <  1:1462930/62‑1 (MQ=255) cGTTCCTTTACTGGTTAACATCGCCGAGAATTTTACCGGTTTATCTTTCGTCCAGGTCTGtt  <  1:1267366/62‑1 (MQ=255)  gTTCCTTTACTGGTTAACATCGCCGAGAATTTTACCGGTTTATCTTTCGTCCAGGTCTGtt  <  1:2286438/61‑1 (MQ=255)      cTTTACTGGTTAACATCGCCGAGAATTTTACCGGTTTATCTTTCGTCCATGTCTGtt  <  1:1023121/57‑1 (MQ=255)                                                              | CGTTCCTTTACTGGTTAACATCGCCGAGAATTTTACCGGTTTATCTTTCGTCCAGGTCTGTT  >  W3110S.gb/3097898‑3097959

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑